MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Azospirillum sp. B510 plasmid pAB510d

Total Repeats: 88

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013858	CTCCG	2	10	8036	8045	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
2	NC_013858	TTAAT	2	10	19068	19077	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_013858	ACCCG	5	25	28255	28279	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
4	NC_013858	CTTCC	2	10	51324	51333	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
5	NC_013858	CGGGA	2	10	62594	62603	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
6	NC_013858	TCTTT	2	10	69471	69480	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
7	NC_013858	GGACG	2	10	81818	81827	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
8	NC_013858	TGGCT	2	10	88330	88339	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
9	NC_013858	GGCGG	2	10	90320	90329	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
10	NC_013858	CGTTT	2	10	100036	100045	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
11	NC_013858	GGGTC	2	10	111146	111155	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
12	NC_013858	GCCGC	2	10	111222	111231	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
13	NC_013858	CGATC	2	10	122180	122189	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
14	NC_013858	GCACC	2	10	123945	123954	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
15	NC_013858	GCCGT	2	10	126103	126112	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
16	NC_013858	GGCGG	2	10	140332	140341	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
17	NC_013858	CGTGA	2	10	146946	146955	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
18	NC_013858	CGGAG	2	10	147877	147886	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
19	NC_013858	GGATT	2	10	150621	150630	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
20	NC_013858	TCCCG	2	10	162807	162816	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
21	NC_013858	GAGCG	2	10	167317	167326	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
22	NC_013858	GCGTT	2	10	169599	169608	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
23	NC_013858	GGGTA	2	10	185788	185797	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
24	NC_013858	GCCGG	2	10	187417	187426	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
25	NC_013858	GGCCG	2	10	191073	191082	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
26	NC_013858	GCCCC	2	10	200677	200686	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
27	NC_013858	GCCGC	2	10	200821	200830	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
28	NC_013858	CATCG	2	10	201058	201067	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
29	NC_013858	CCGGC	2	10	201813	201822	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
30	NC_013858	ACCGG	2	10	202749	202758	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
31	NC_013858	GGGCG	2	10	216074	216083	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
32	NC_013858	CGACA	2	10	235055	235064	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
33	NC_013858	TGTGC	2	10	235790	235799	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
34	NC_013858	ACGGA	2	10	239186	239195	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
35	NC_013858	GGGCC	2	10	251249	251258	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
36	NC_013858	TCACG	2	10	256322	256331	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
37	NC_013858	TCACA	2	10	264462	264471	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
38	NC_013858	GCGGG	2	10	281356	281365	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
39	NC_013858	CCCCA	2	10	288844	288853	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
40	NC_013858	TGGGG	2	10	288883	288892	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
41	NC_013858	GGCTG	2	10	295790	295799	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
42	NC_013858	GGCCC	2	10	296262	296271	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
43	NC_013858	TCCCG	2	10	314034	314043	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
44	NC_013858	GACGA	2	10	314167	314176	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
45	NC_013858	CATCC	2	10	320975	320984	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
46	NC_013858	GGGCG	2	10	323244	323253	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
47	NC_013858	CCTCC	2	10	335056	335065	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
48	NC_013858	GGGAC	2	10	341206	341215	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
49	NC_013858	AGACC	2	10	342595	342604	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
50	NC_013858	CGGAT	2	10	342723	342732	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
51	NC_013858	GCCGG	2	10	346328	346337	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
52	NC_013858	TCCAG	2	10	353374	353383	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
53	NC_013858	CCCCA	2	10	361100	361109	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
54	NC_013858	TGCGG	2	10	371424	371433	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
55	NC_013858	CCCCA	2	10	373726	373735	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
56	NC_013858	AGGGA	2	10	373751	373760	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
57	NC_013858	CATCG	2	10	413494	413503	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
58	NC_013858	GCAAA	2	10	425704	425713	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
59	NC_013858	TGAGT	2	10	441289	441298	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
60	NC_013858	TCCCG	2	10	465703	465712	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
61	NC_013858	CTGGA	2	10	465727	465736	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
62	NC_013858	GCCAT	2	10	468366	468375	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
63	NC_013858	GGAGC	2	10	469709	469718	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
64	NC_013858	CGCCA	2	10	469759	469768	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
65	NC_013858	TGTCC	2	10	469911	469920	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
66	NC_013858	GGCGC	2	10	474347	474356	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
67	NC_013858	CTATC	2	10	487529	487538	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
68	NC_013858	TCACG	2	10	493236	493245	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
69	NC_013858	CCGGC	2	10	493249	493258	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
70	NC_013858	GGCGT	2	10	516513	516522	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
71	NC_013858	GGCGT	2	10	517871	517880	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
72	NC_013858	ACCGC	2	10	531966	531975	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
73	NC_013858	ACGCC	2	10	547475	547484	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
74	NC_013858	CCGCC	2	10	553893	553902	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
75	NC_013858	GGCGG	2	10	558889	558898	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
76	NC_013858	TCCCG	2	10	565249	565258	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
77	NC_013858	CATGT	2	10	565293	565302	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
78	NC_013858	CATGC	2	10	565432	565441	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
79	NC_013858	GACGG	2	10	566723	566732	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
80	NC_013858	CGGGA	2	10	568842	568851	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
81	NC_013858	ACCAA	2	10	577376	577385	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
82	NC_013858	AGGGG	2	10	588626	588635	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
83	NC_013858	CCGCC	2	10	605898	605907	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
84	NC_013858	CGAGA	2	10	608368	608377	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
85	NC_013858	CAGTC	2	10	616964	616973	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
86	NC_013858	ACGGG	2	10	619616	619625	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
87	NC_013858	TCCTC	2	10	621830	621839	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
88	NC_013858	TCGCG	2	10	622257	622266	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.