MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Azospirillum sp. B510 plasmid pAB510d

Total Repeats: 284

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013858	TTAC	2	8	23	30	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_013858	GGGC	2	8	120	127	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3	NC_013858	GATT	2	8	686	693	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_013858	GGCG	3	12	10456	10467	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
5	NC_013858	CGTC	2	8	10512	10519	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6	NC_013858	AAGA	2	8	10524	10531	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
7	NC_013858	AACG	2	8	11367	11374	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
8	NC_013858	GCGG	2	8	14967	14974	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
9	NC_013858	GTCC	2	8	16203	16210	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
10	NC_013858	GCGG	2	8	18491	18498	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
11	NC_013858	TTAT	2	8	19115	19122	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_013858	GCAT	2	8	22245	22252	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
13	NC_013858	AAAG	2	8	22343	22350	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
14	NC_013858	CATG	2	8	24456	24463	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
15	NC_013858	AAGC	2	8	24484	24491	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
16	NC_013858	AAGC	2	8	24514	24521	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
17	NC_013858	GCCG	2	8	28247	28254	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18	NC_013858	AGCG	2	8	28283	28290	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
19	NC_013858	ATGG	2	8	32451	32458	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_013858	GCCC	2	8	33432	33439	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
21	NC_013858	GCCC	2	8	35834	35841	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
22	NC_013858	CCGT	2	8	43944	43951	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
23	NC_013858	GTCC	2	8	45101	45108	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
24	NC_013858	CAAA	2	8	45163	45170	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
25	NC_013858	CGGA	2	8	46536	46543	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
26	NC_013858	GCCC	2	8	47832	47839	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
27	NC_013858	ACCA	2	8	47843	47850	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
28	NC_013858	AGAC	2	8	51345	51352	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
29	NC_013858	TGGC	2	8	55270	55277	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
30	NC_013858	TGGC	2	8	55285	55292	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
31	NC_013858	CCCA	2	8	58091	58098	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
32	NC_013858	TCAT	2	8	61101	61108	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
33	NC_013858	GGTT	2	8	61282	61289	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_013858	GGGA	2	8	61344	61351	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
35	NC_013858	CCCT	2	8	62582	62589	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
36	NC_013858	CGGG	2	8	67092	67099	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
37	NC_013858	GGCG	2	8	73752	73759	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
38	NC_013858	GCCG	2	8	74907	74914	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
39	NC_013858	GCCC	2	8	74955	74962	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
40	NC_013858	CCGC	2	8	75871	75878	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
41	NC_013858	GCCG	2	8	79401	79408	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
42	NC_013858	GCCG	2	8	81529	81536	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
43	NC_013858	GGGC	2	8	81660	81667	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
44	NC_013858	CGGG	2	8	82280	82287	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
45	NC_013858	CCCG	2	8	82323	82330	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
46	NC_013858	GCCG	2	8	82358	82365	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
47	NC_013858	CCGG	2	8	82494	82501	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
48	NC_013858	CCGG	2	8	83803	83810	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
49	NC_013858	GGAC	2	8	83919	83926	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
50	NC_013858	CCGG	2	8	83990	83997	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
51	NC_013858	CGGC	2	8	84002	84009	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
52	NC_013858	CCGC	2	8	86555	86562	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
53	NC_013858	CCCT	2	8	86651	86658	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
54	NC_013858	GGCG	2	8	86717	86724	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
55	NC_013858	ACGG	2	8	88272	88279	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
56	NC_013858	GGAT	2	8	88320	88327	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_013858	TCCC	2	8	88449	88456	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
58	NC_013858	GCCG	2	8	89478	89485	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
59	NC_013858	ACGG	2	8	90308	90315	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
60	NC_013858	CGAC	2	8	94593	94600	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
61	NC_013858	GCGG	2	8	95676	95683	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
62	NC_013858	ACAA	2	8	97346	97353	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
63	NC_013858	GCCC	2	8	97501	97508	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
64	NC_013858	AAAC	2	8	99200	99207	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
65	NC_013858	CGGG	2	8	100154	100161	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
66	NC_013858	CCGG	2	8	104050	104057	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
67	NC_013858	CCGG	2	8	104706	104713	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
68	NC_013858	CCGC	2	8	104956	104963	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
69	NC_013858	GCCC	2	8	114770	114777	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
70	NC_013858	TGGC	2	8	116255	116262	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
71	NC_013858	TTTA	2	8	119722	119729	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_013858	GGGC	2	8	121522	121529	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
73	NC_013858	ACAA	2	8	121549	121556	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
74	NC_013858	GACG	2	8	121722	121729	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
75	NC_013858	CGGC	2	8	121803	121810	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
76	NC_013858	CGAC	2	8	121929	121936	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
77	NC_013858	ATGG	2	8	122853	122860	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_013858	ATTG	2	8	122880	122887	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
79	NC_013858	GCGG	2	8	125720	125727	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
80	NC_013858	CCGG	2	8	129243	129250	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
81	NC_013858	GGCA	2	8	130650	130657	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
82	NC_013858	ATTT	2	8	131050	131057	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_013858	CCGG	2	8	133161	133168	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
84	NC_013858	TCCG	2	8	146876	146883	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
85	NC_013858	GAAA	2	8	147827	147834	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
86	NC_013858	GAGG	2	8	150607	150614	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
87	NC_013858	AAGC	2	8	156959	156966	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
88	NC_013858	GCCA	2	8	157060	157067	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
89	NC_013858	GAGG	2	8	162820	162827	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
90	NC_013858	GGCT	2	8	164445	164452	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
91	NC_013858	GGAT	2	8	164566	164573	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
92	NC_013858	ATCG	2	8	165716	165723	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
93	NC_013858	CGGC	2	8	169458	169465	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
94	NC_013858	CGGA	2	8	169539	169546	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
95	NC_013858	GATG	2	8	169568	169575	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
96	NC_013858	TGGC	2	8	169588	169595	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
97	NC_013858	GTCC	2	8	169652	169659	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
98	NC_013858	CGGG	2	8	170960	170967	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
99	NC_013858	TCCC	2	8	171008	171015	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
100	NC_013858	CTGG	2	8	172091	172098	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
101	NC_013858	TTTG	2	8	172101	172108	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
102	NC_013858	GGGT	2	8	175158	175165	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
103	NC_013858	TTGA	2	8	185976	185983	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
104	NC_013858	TGGG	2	8	191025	191032	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
105	NC_013858	CCGG	2	8	191499	191506	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
106	NC_013858	GGTC	2	8	191690	191697	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
107	NC_013858	CTCC	2	8	191827	191834	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
108	NC_013858	GCCC	2	8	192067	192074	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
109	NC_013858	CATC	2	8	192082	192089	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
110	NC_013858	GTCT	2	8	193616	193623	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
111	NC_013858	CGCC	2	8	193764	193771	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
112	NC_013858	AACA	2	8	195850	195857	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
113	NC_013858	AATT	2	8	195920	195927	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_013858	ATGC	2	8	200445	200452	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
115	NC_013858	GACC	2	8	200711	200718	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
116	NC_013858	CGGT	2	8	205271	205278	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
117	NC_013858	GGAA	2	8	205795	205802	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
118	NC_013858	CGGC	2	8	205808	205815	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
119	NC_013858	CGGC	2	8	208033	208040	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
120	NC_013858	TGAC	2	8	208079	208086	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
121	NC_013858	GACG	2	8	209058	209065	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
122	NC_013858	CGTC	3	12	216041	216052	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
123	NC_013858	ACCC	2	8	226629	226636	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
124	NC_013858	GGAG	2	8	230189	230196	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
125	NC_013858	CCGC	2	8	233585	233592	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
126	NC_013858	CGGG	2	8	235767	235774	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
127	NC_013858	CGGC	2	8	238398	238405	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
128	NC_013858	CGTC	2	8	241253	241260	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
129	NC_013858	TCGG	2	8	244222	244229	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
130	NC_013858	GCCG	2	8	244266	244273	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
131	NC_013858	CGGC	2	8	244275	244282	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
132	NC_013858	GGAG	2	8	246735	246742	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
133	NC_013858	CCGA	2	8	249820	249827	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
134	NC_013858	CCGC	2	8	249892	249899	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
135	NC_013858	TTGC	2	8	249954	249961	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
136	NC_013858	CGGC	2	8	250957	250964	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
137	NC_013858	GGTT	2	8	256352	256359	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
138	NC_013858	ACCA	2	8	256388	256395	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
139	NC_013858	TTCC	2	8	259700	259707	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
140	NC_013858	GGCT	2	8	263250	263257	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
141	NC_013858	GCGG	4	16	265268	265283	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
142	NC_013858	GTCC	2	8	267887	267894	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
143	NC_013858	TGTA	2	8	271353	271360	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
144	NC_013858	ATGA	2	8	276908	276915	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
145	NC_013858	AAAT	2	8	277550	277557	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_013858	GGTG	2	8	277731	277738	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
147	NC_013858	TCCC	2	8	281295	281302	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
148	NC_013858	AATG	2	8	291560	291567	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
149	NC_013858	AGGC	2	8	291664	291671	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
150	NC_013858	GCCG	2	8	295729	295736	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
151	NC_013858	GCCC	2	8	296081	296088	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
152	NC_013858	AGGG	2	8	307420	307427	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
153	NC_013858	CCGC	2	8	313974	313981	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
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156	NC_013858	CTGA	2	8	323344	323351	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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162	NC_013858	GCCG	2	8	338708	338715	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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189	NC_013858	GAGG	2	8	411347	411354	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.