MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Azospirillum sp. B510 plasmid pAB510b

Total Repeats: 263

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013856	GGCG	2	8	6912	6919	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
2	NC_013856	GAGT	2	8	9790	9797	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_013856	CCCG	2	8	9816	9823	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
4	NC_013856	CCAT	2	8	17638	17645	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_013856	GGCC	2	8	18623	18630	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6	NC_013856	TCCA	2	8	18783	18790	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_013856	CGGC	2	8	21754	21761	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8	NC_013856	TCCC	2	8	25003	25010	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
9	NC_013856	TTCC	2	8	30727	30734	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_013856	TCCA	2	8	31589	31596	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_013856	TCCC	2	8	32671	32678	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
12	NC_013856	TGGT	2	8	33983	33990	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_013856	TTTA	2	8	40250	40257	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_013856	GCCG	2	8	40543	40550	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15	NC_013856	ACGA	2	8	47512	47519	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
16	NC_013856	TCGG	2	8	47606	47613	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
17	NC_013856	GGCG	2	8	47834	47841	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
18	NC_013856	CTCG	2	8	58077	58084	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
19	NC_013856	TCCC	2	8	59728	59735	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
20	NC_013856	GGGC	2	8	61492	61499	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
21	NC_013856	TCGG	2	8	71203	71210	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
22	NC_013856	CGGG	2	8	72918	72925	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
23	NC_013856	AGGC	2	8	73033	73040	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
24	NC_013856	AGGT	2	8	73468	73475	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_013856	AAAC	2	8	73921	73928	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
26	NC_013856	AAAG	2	8	79836	79843	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_013856	ACGA	2	8	81476	81483	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
28	NC_013856	CCCG	2	8	90447	90454	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
29	NC_013856	GCCG	2	8	90488	90495	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
30	NC_013856	TTCC	2	8	93417	93424	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_013856	TGGC	2	8	93632	93639	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
32	NC_013856	CTCC	2	8	99279	99286	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
33	NC_013856	TGGG	2	8	109692	109699	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
34	NC_013856	GACC	2	8	120119	120126	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
35	NC_013856	GTCC	2	8	121441	121448	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
36	NC_013856	AGCC	2	8	121557	121564	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
37	NC_013856	CGTC	2	8	129196	129203	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
38	NC_013856	GGCC	2	8	140751	140758	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
39	NC_013856	CGCC	2	8	140785	140792	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
40	NC_013856	CGTC	2	8	140809	140816	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
41	NC_013856	GTCC	2	8	155523	155530	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
42	NC_013856	ACGA	2	8	165804	165811	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
43	NC_013856	GGTT	2	8	165883	165890	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_013856	GCGG	2	8	167557	167564	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
45	NC_013856	CGGT	2	8	172869	172876	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
46	NC_013856	TGAC	2	8	178492	178499	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
47	NC_013856	GGTC	2	8	178533	178540	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
48	NC_013856	TGTT	2	8	181492	181499	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
49	NC_013856	GTCG	2	8	181624	181631	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
50	NC_013856	AAGC	2	8	181873	181880	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
51	NC_013856	GACG	2	8	183426	183433	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
52	NC_013856	CCTC	2	8	183635	183642	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
53	NC_013856	CAGA	2	8	184953	184960	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
54	NC_013856	TCGG	2	8	188218	188225	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
55	NC_013856	GGCG	2	8	188468	188475	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
56	NC_013856	GCTG	2	8	189514	189521	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
57	NC_013856	CGCA	2	8	189585	189592	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
58	NC_013856	TTCG	2	8	191088	191095	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
59	NC_013856	GCTG	2	8	192921	192928	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
60	NC_013856	TCGG	2	8	194824	194831	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
61	NC_013856	CATC	2	8	195110	195117	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
62	NC_013856	CGAA	2	8	202776	202783	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
63	NC_013856	GGCG	2	8	202825	202832	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
64	NC_013856	CGTC	2	8	202911	202918	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
65	NC_013856	CGGT	2	8	205634	205641	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
66	NC_013856	CCCT	2	8	207830	207837	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
67	NC_013856	TCAC	2	8	211747	211754	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
68	NC_013856	TGGA	2	8	213142	213149	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_013856	GGAA	2	8	215591	215598	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_013856	TCGA	2	8	218709	218716	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
71	NC_013856	ATCC	2	8	221987	221994	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
72	NC_013856	TGCC	2	8	222048	222055	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
73	NC_013856	ATTC	2	8	222924	222931	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
74	NC_013856	CCGG	2	8	226478	226485	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
75	NC_013856	TCAT	2	8	226577	226584	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
76	NC_013856	GTTC	2	8	226671	226678	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
77	NC_013856	CGCC	2	8	228120	228127	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
78	NC_013856	GAAG	2	8	231621	231628	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
79	NC_013856	CCAG	2	8	233995	234002	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
80	NC_013856	CGGC	2	8	241069	241076	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
81	NC_013856	CAAT	2	8	245295	245302	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
82	NC_013856	CATC	2	8	245408	245415	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
83	NC_013856	GCGG	2	8	252832	252839	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
84	NC_013856	AGTT	2	8	253089	253096	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
85	NC_013856	CGTC	2	8	257486	257493	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
86	NC_013856	GGAG	2	8	267442	267449	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
87	NC_013856	CGAG	2	8	267929	267936	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
88	NC_013856	TCCC	2	8	268697	268704	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
89	NC_013856	GGCG	2	8	279321	279328	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
90	NC_013856	ATCG	2	8	288102	288109	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
91	NC_013856	GCGG	2	8	288133	288140	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
92	NC_013856	GGTG	2	8	288233	288240	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
93	NC_013856	CGGC	2	8	288279	288286	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
94	NC_013856	CCGG	2	8	288431	288438	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
95	NC_013856	TCCT	2	8	295760	295767	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
96	NC_013856	GCCC	2	8	300372	300379	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
97	NC_013856	GGTC	2	8	300400	300407	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
98	NC_013856	CGGC	2	8	303979	303986	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
99	NC_013856	TTTG	2	8	305623	305630	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
100	NC_013856	TTCC	2	8	305699	305706	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
101	NC_013856	GTCC	2	8	305775	305782	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
102	NC_013856	GCCG	2	8	306594	306601	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
103	NC_013856	GCCC	2	8	307877	307884	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
104	NC_013856	GAGG	2	8	307894	307901	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
105	NC_013856	GGGC	2	8	312680	312687	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
106	NC_013856	TCAA	2	8	313775	313782	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
107	NC_013856	GCGG	2	8	319611	319618	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
108	NC_013856	CCGC	2	8	319672	319679	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
109	NC_013856	ATCC	2	8	321111	321118	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
110	NC_013856	CCAG	2	8	322869	322876	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
111	NC_013856	GCCC	2	8	322883	322890	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
112	NC_013856	CGGG	2	8	322900	322907	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
113	NC_013856	TCAA	2	8	333411	333418	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
114	NC_013856	TGAC	2	8	333425	333432	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
115	NC_013856	CCGG	2	8	334870	334877	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
116	NC_013856	ACCG	2	8	335016	335023	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
117	NC_013856	GGCG	2	8	335048	335055	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
118	NC_013856	GCGG	2	8	336178	336185	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
119	NC_013856	CGAA	2	8	341518	341525	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
120	NC_013856	CGGG	2	8	342583	342590	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
121	NC_013856	CGAG	2	8	345307	345314	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
122	NC_013856	CCGT	2	8	345624	345631	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
123	NC_013856	TCCG	2	8	345651	345658	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
124	NC_013856	GGCG	2	8	345694	345701	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
125	NC_013856	TCGG	2	8	347060	347067	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
126	NC_013856	CCGC	2	8	349162	349169	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
127	NC_013856	TCCC	2	8	366427	366434	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
128	NC_013856	CGGC	2	8	370843	370850	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
129	NC_013856	GCGG	2	8	372420	372427	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
130	NC_013856	GGAT	2	8	375160	375167	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
131	NC_013856	AACG	2	8	376151	376158	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
132	NC_013856	CCAT	2	8	380649	380656	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
133	NC_013856	CTCC	2	8	385601	385608	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
134	NC_013856	TGCC	2	8	385610	385617	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
135	NC_013856	CCGG	2	8	387905	387912	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
136	NC_013856	TCCT	2	8	394334	394341	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
137	NC_013856	AGGC	2	8	397287	397294	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
138	NC_013856	CTTG	2	8	398532	398539	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
139	NC_013856	CGGC	2	8	400622	400629	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
140	NC_013856	CCGC	2	8	410265	410272	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
141	NC_013856	TTAT	2	8	416510	416517	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_013856	CGAA	2	8	416664	416671	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
143	NC_013856	TCCC	2	8	420574	420581	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
144	NC_013856	CGGC	2	8	425064	425071	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
145	NC_013856	CGGC	2	8	425179	425186	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
146	NC_013856	GTCT	2	8	426018	426025	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
147	NC_013856	CAGA	2	8	426043	426050	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
148	NC_013856	AAAC	2	8	427063	427070	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
149	NC_013856	CCGG	2	8	427129	427136	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
150	NC_013856	CGCC	2	8	427158	427165	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
151	NC_013856	CGAC	2	8	431108	431115	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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261	NC_013856	CGTA	2	8	720876	720883	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
262	NC_013856	CGGA	2	8	720922	720929	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
263	NC_013856	CGCC	2	8	722513	722520	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.