MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Azospirillum sp. B510 plasmid pAB510b

Total Repeats: 2132

< Previous12345Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_013856	TGGG	2	8	678170	678177	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
2002	NC_013856	CCCG	2	8	678381	678388	0 %	0 %	25 %	75 %	288961458
2003	NC_013856	GCCC	2	8	678603	678610	0 %	0 %	25 %	75 %	288961458
2004	NC_013856	GCCG	2	8	679309	679316	0 %	0 %	50 %	50 %	288961458
2005	NC_013856	CCCG	2	8	679431	679438	0 %	0 %	25 %	75 %	288961458
2006	NC_013856	GGTG	2	8	679695	679702	0 %	25 %	75 %	0 %	288961458
2007	NC_013856	TGCC	2	8	679891	679898	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2008	NC_013856	CTGG	2	8	681561	681568	0 %	25 %	50 %	25 %	288961461
2009	NC_013856	CGGG	2	8	681569	681576	0 %	0 %	75 %	25 %	288961461
2010	NC_013856	CTCG	2	8	682040	682047	0 %	25 %	25 %	50 %	288961462
2011	NC_013856	CTGG	2	8	682492	682499	0 %	25 %	50 %	25 %	288961463
2012	NC_013856	CGGA	2	8	682695	682702	25 %	0 %	50 %	25 %	288961463
2013	NC_013856	CGTC	2	8	683573	683580	0 %	25 %	25 %	50 %	288961463
2014	NC_013856	GCGA	2	8	684515	684522	25 %	0 %	50 %	25 %	288961465
2015	NC_013856	GGCG	2	8	684531	684538	0 %	0 %	75 %	25 %	288961465
2016	NC_013856	GCCA	2	8	684623	684630	25 %	0 %	25 %	50 %	288961465
2017	NC_013856	CCGG	2	8	684666	684673	0 %	0 %	50 %	50 %	288961465
2018	NC_013856	AGGC	2	8	684758	684765	25 %	0 %	50 %	25 %	288961465
2019	NC_013856	GTGG	2	8	685142	685149	0 %	25 %	75 %	0 %	288961466
2020	NC_013856	CGGG	2	8	685486	685493	0 %	0 %	75 %	25 %	288961466
2021	NC_013856	CGGC	2	8	685595	685602	0 %	0 %	50 %	50 %	288961466
2022	NC_013856	GCCA	2	8	685926	685933	25 %	0 %	25 %	50 %	288961466
2023	NC_013856	GGCA	2	8	685986	685993	25 %	0 %	50 %	25 %	288961466
2024	NC_013856	CGTC	2	8	686311	686318	0 %	25 %	25 %	50 %	288961466
2025	NC_013856	GGCA	2	8	686398	686405	25 %	0 %	50 %	25 %	288961466
2026	NC_013856	TGGC	2	8	686421	686428	0 %	25 %	50 %	25 %	288961466
2027	NC_013856	CTCG	2	8	686481	686488	0 %	25 %	25 %	50 %	288961466
2028	NC_013856	AGGT	2	8	686952	686959	25 %	25 %	50 %	0 %	288961467
2029	NC_013856	CGGC	2	8	688104	688111	0 %	0 %	50 %	50 %	288961468
2030	NC_013856	ACGC	2	8	688136	688143	25 %	0 %	25 %	50 %	288961468
2031	NC_013856	GGAA	2	8	688271	688278	50 %	0 %	50 %	0 %	288961468
2032	NC_013856	GCGT	2	8	688298	688305	0 %	25 %	50 %	25 %	288961468
2033	NC_013856	GGCG	2	8	689628	689635	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
2034	NC_013856	GGGA	2	8	689653	689660	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
2035	NC_013856	ATCA	2	8	689868	689875	50 %	25 %	0 %	25 %	288961470
2036	NC_013856	ATGG	2	8	690054	690061	25 %	25 %	50 %	0 %	288961470
2037	NC_013856	GGCT	2	8	690352	690359	0 %	25 %	50 %	25 %	288961470
2038	NC_013856	GAGC	2	8	690393	690400	25 %	0 %	50 %	25 %	288961470
2039	NC_013856	ATCG	2	8	690770	690777	25 %	25 %	25 %	25 %	288961470
2040	NC_013856	GGCC	2	8	690941	690948	0 %	0 %	50 %	50 %	288961470
2041	NC_013856	CGAC	2	8	691006	691013	25 %	0 %	25 %	50 %	288961470
2042	NC_013856	GAGC	2	8	691179	691186	25 %	0 %	50 %	25 %	288961470
2043	NC_013856	CTGT	2	8	691290	691297	0 %	50 %	25 %	25 %	288961470
2044	NC_013856	GCCC	2	8	691478	691485	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
2045	NC_013856	CGTC	2	8	691502	691509	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2046	NC_013856	CGGG	2	8	691685	691692	0 %	0 %	75 %	25 %	288961471
2047	NC_013856	GCCC	2	8	692247	692254	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
2048	NC_013856	GTGA	2	8	692363	692370	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
2049	NC_013856	GCCA	2	8	692711	692718	25 %	0 %	25 %	50 %	288961473
2050	NC_013856	CGTC	2	8	692879	692886	0 %	25 %	25 %	50 %	288961473
2051	NC_013856	GCCG	2	8	694075	694082	0 %	0 %	50 %	50 %	288961474
2052	NC_013856	GCGG	2	8	695699	695706	0 %	0 %	75 %	25 %	288961475
2053	NC_013856	GGCG	2	8	696037	696044	0 %	0 %	75 %	25 %	288961475
2054	NC_013856	TCCG	2	8	696118	696125	0 %	25 %	25 %	50 %	288961475
2055	NC_013856	CCAG	2	8	696321	696328	25 %	0 %	25 %	50 %	288961475
2056	NC_013856	CGAG	2	8	696773	696780	25 %	0 %	50 %	25 %	288961476
2057	NC_013856	CGCC	2	8	697246	697253	0 %	0 %	25 %	75 %	288961477
2058	NC_013856	TGGC	2	8	698007	698014	0 %	25 %	50 %	25 %	288961479
2059	NC_013856	TCAC	2	8	698355	698362	25 %	25 %	0 %	50 %	288961480
2060	NC_013856	CAGG	2	8	698405	698412	25 %	0 %	50 %	25 %	288961480
2061	NC_013856	GCCG	2	8	698829	698836	0 %	0 %	50 %	50 %	288961481
2062	NC_013856	CGGA	2	8	698846	698853	25 %	0 %	50 %	25 %	288961481
2063	NC_013856	ACCG	2	8	699033	699040	25 %	0 %	25 %	50 %	288961481
2064	NC_013856	GATC	2	8	699410	699417	25 %	25 %	25 %	25 %	288961481
2065	NC_013856	GGAA	2	8	700776	700783	50 %	0 %	50 %	0 %	288961482
2066	NC_013856	GAGC	2	8	700905	700912	25 %	0 %	50 %	25 %	288961482
2067	NC_013856	CCTC	2	8	701120	701127	0 %	25 %	0 %	75 %	288961482
2068	NC_013856	ATCG	2	8	701272	701279	25 %	25 %	25 %	25 %	288961482
2069	NC_013856	TGCT	2	8	701513	701520	0 %	50 %	25 %	25 %	288961482
2070	NC_013856	GGTT	2	8	701622	701629	0 %	50 %	50 %	0 %	288961482
2071	NC_013856	GATC	2	8	701870	701877	25 %	25 %	25 %	25 %	288961482
2072	NC_013856	GCAA	2	8	702309	702316	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
2073	NC_013856	CCAC	2	8	702459	702466	25 %	0 %	0 %	75 %	288961483
2074	NC_013856	GAAG	2	8	702487	702494	50 %	0 %	50 %	0 %	288961483
2075	NC_013856	CCGC	2	8	703098	703105	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
2076	NC_013856	GCCG	2	8	703474	703481	0 %	0 %	50 %	50 %	288961484
2077	NC_013856	TGGC	2	8	703572	703579	0 %	25 %	50 %	25 %	288961484
2078	NC_013856	ACCG	2	8	704031	704038	25 %	0 %	25 %	50 %	288961484
2079	NC_013856	ATGA	2	8	704435	704442	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2080	NC_013856	CGGT	2	8	704532	704539	0 %	25 %	50 %	25 %	288961485
2081	NC_013856	CCGG	2	8	704575	704582	0 %	0 %	50 %	50 %	288961485
2082	NC_013856	TCCG	2	8	704617	704624	0 %	25 %	25 %	50 %	288961485
2083	NC_013856	CACC	2	8	704646	704653	25 %	0 %	0 %	75 %	288961485
2084	NC_013856	GTGA	2	8	705022	705029	25 %	25 %	50 %	0 %	288961485
2085	NC_013856	GATC	2	8	705148	705155	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2086	NC_013856	GGCC	2	8	706013	706020	0 %	0 %	50 %	50 %	288961486
2087	NC_013856	ACCG	2	8	706247	706254	25 %	0 %	25 %	50 %	288961486
2088	NC_013856	GCCC	2	8	706588	706595	0 %	0 %	25 %	75 %	288961486
2089	NC_013856	AGCC	2	8	707037	707044	25 %	0 %	25 %	50 %	288961487
2090	NC_013856	CGAC	2	8	707258	707265	25 %	0 %	25 %	50 %	288961487
2091	NC_013856	TCGG	2	8	707327	707334	0 %	25 %	50 %	25 %	288961487
2092	NC_013856	CGGG	2	8	707682	707689	0 %	0 %	75 %	25 %	288961487
2093	NC_013856	GATC	2	8	708138	708145	25 %	25 %	25 %	25 %	288961487
2094	NC_013856	CGGC	2	8	708178	708185	0 %	0 %	50 %	50 %	288961487
2095	NC_013856	GCAT	2	8	708780	708787	25 %	25 %	25 %	25 %	288961488
2096	NC_013856	CGGC	2	8	709887	709894	0 %	0 %	50 %	50 %	288961489
2097	NC_013856	ACGC	2	8	709919	709926	25 %	0 %	25 %	50 %	288961489
2098	NC_013856	GGAA	2	8	710054	710061	50 %	0 %	50 %	0 %	288961489
2099	NC_013856	GCGT	2	8	710081	710088	0 %	25 %	50 %	25 %	288961489
2100	NC_013856	AGCG	2	8	710919	710926	25 %	0 %	50 %	25 %	288961490
2101	NC_013856	CAGC	2	8	711083	711090	25 %	0 %	25 %	50 %	288961490
2102	NC_013856	CGAA	2	8	712263	712270	50 %	0 %	25 %	25 %	288961491
2103	NC_013856	GGCG	2	8	712312	712319	0 %	0 %	75 %	25 %	288961491
2104	NC_013856	CGGG	2	8	712630	712637	0 %	0 %	75 %	25 %	288961491
2105	NC_013856	ACCT	2	8	713680	713687	25 %	25 %	0 %	50 %	288961492
2106	NC_013856	CATC	2	8	714251	714258	25 %	25 %	0 %	50 %	288961492
2107	NC_013856	CGGT	2	8	714633	714640	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
2108	NC_013856	GGAT	2	8	714693	714700	25 %	25 %	50 %	0 %	288961493
2109	NC_013856	TGGC	2	8	714956	714963	0 %	25 %	50 %	25 %	288961493
2110	NC_013856	CGGC	2	8	715237	715244	0 %	0 %	50 %	50 %	288961493
2111	NC_013856	CCGA	2	8	715334	715341	25 %	0 %	25 %	50 %	288961493
2112	NC_013856	CTCC	2	8	715491	715498	0 %	25 %	0 %	75 %	288961494
2113	NC_013856	CGCC	2	8	715577	715584	0 %	0 %	25 %	75 %	288961494
2114	NC_013856	CCGG	2	8	715623	715630	0 %	0 %	50 %	50 %	288961494
2115	NC_013856	CCGG	2	8	716024	716031	0 %	0 %	50 %	50 %	288961494
2116	NC_013856	CCGG	2	8	716466	716473	0 %	0 %	50 %	50 %	288961494
2117	NC_013856	CGGC	2	8	716525	716532	0 %	0 %	50 %	50 %	288961494
2118	NC_013856	CCGG	2	8	716565	716572	0 %	0 %	50 %	50 %	288961494
2119	NC_013856	GCCG	2	8	717083	717090	0 %	0 %	50 %	50 %	288961495
2120	NC_013856	GGCG	2	8	717817	717824	0 %	0 %	75 %	25 %	288961495
2121	NC_013856	CTCG	2	8	718493	718500	0 %	25 %	25 %	50 %	288961495
2122	NC_013856	CGGA	2	8	718503	718510	25 %	0 %	50 %	25 %	288961495
2123	NC_013856	GAAG	2	8	718721	718728	50 %	0 %	50 %	0 %	288961495
2124	NC_013856	ATCT	2	8	718998	719005	25 %	50 %	0 %	25 %	288961495
2125	NC_013856	TGAG	2	8	719920	719927	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
2126	NC_013856	CATC	2	8	720335	720342	25 %	25 %	0 %	50 %	288961496
2127	NC_013856	GCCG	2	8	720473	720480	0 %	0 %	50 %	50 %	288961496
2128	NC_013856	CGTA	2	8	720876	720883	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2129	NC_013856	CGGA	2	8	720922	720929	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2130	NC_013856	CCGG	2	8	721307	721314	0 %	0 %	50 %	50 %	288961497
2131	NC_013856	GCCG	2	8	721763	721770	0 %	0 %	50 %	50 %	288961498
2132	NC_013856	CGCC	2	8	722513	722520	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding

< Previous12345Next >

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.