MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Azospirillum sp. B510 plasmid pAB510a

Total Repeats: 60

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013855	GCGTCG	2	12	60305	60316	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_013855	GCGTCG	2	12	62543	62554	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_013855	GCGGCC	2	12	69076	69087	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4	NC_013855	TATAAT	2	12	90427	90438	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_013855	GGGGCG	2	12	91537	91548	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_013855	GGCCGT	2	12	167160	167171	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_013855	CCAAGG	2	12	178183	178194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_013855	AGGTCC	2	12	239353	239364	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_013855	AGGGAA	2	12	263083	263094	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_013855	CCAAAA	2	12	265482	265493	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_013855	CCGGTT	2	12	348509	348520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_013855	GCCACG	2	12	358758	358769	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
13	NC_013855	TGGCCG	2	12	408789	408800	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_013855	CCTCGG	2	12	409013	409024	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
15	NC_013855	CGGCTG	2	12	421457	421468	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_013855	CGTGAT	2	12	424542	424553	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_013855	TGGGGG	2	12	431281	431292	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_013855	GCTGCG	2	12	450933	450944	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_013855	CTCCGC	2	12	471711	471722	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
20	NC_013855	CGCCAT	2	12	475249	475260	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
21	NC_013855	ATTCGG	2	12	484087	484098	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_013855	GATGCT	2	12	509742	509753	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_013855	GCCATT	2	12	517447	517458	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_013855	CTCGGC	2	12	536961	536972	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
25	NC_013855	TCCGGG	2	12	569406	569417	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_013855	GACCAG	3	18	574806	574823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_013855	GGGGCG	2	12	581504	581515	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_013855	AGGGGG	2	12	650291	650302	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_013855	ACCGCC	2	12	656457	656468	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
30	NC_013855	ATAAGA	2	12	677789	677800	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_013855	CCCGAT	2	12	768087	768098	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
32	NC_013855	GGGAAC	2	12	769873	769884	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_013855	TCGGCC	2	12	801489	801500	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
34	NC_013855	GCTTTT	2	12	801801	801812	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_013855	GCGGTC	2	12	802391	802402	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_013855	TCCTTC	2	12	820673	820684	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_013855	AAATAT	2	12	878815	878826	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_013855	CCCGGA	2	12	899847	899858	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
39	NC_013855	GCCCTT	2	12	904275	904286	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
40	NC_013855	CCCGGA	2	12	972332	972343	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
41	NC_013855	AGAACC	2	12	976623	976634	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_013855	GATTTC	2	12	1131337	1131348	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_013855	AAATGA	2	12	1151450	1151461	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_013855	AATGGG	2	12	1186630	1186641	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_013855	GGAGCA	2	12	1201552	1201563	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_013855	GCCGGT	2	12	1202954	1202965	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_013855	AAAGCC	2	12	1206451	1206462	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_013855	ATTTTT	2	12	1206632	1206643	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_013855	CCGGCA	2	12	1208386	1208397	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
50	NC_013855	GAGCCG	2	12	1244312	1244323	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_013855	GCGGTC	2	12	1258281	1258292	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_013855	TGCTCC	2	12	1261908	1261919	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
53	NC_013855	CCCGGA	2	12	1276402	1276413	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
54	NC_013855	ACGCCT	2	12	1287887	1287898	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
55	NC_013855	TCCTTC	2	12	1291289	1291300	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
56	NC_013855	CGGCCT	2	12	1353881	1353892	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
57	NC_013855	CCAGCA	3	18	1354208	1354225	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
58	NC_013855	CCCCAA	2	12	1404206	1404217	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
59	NC_013855	AGGATG	2	12	1420063	1420074	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_013855	CGACGG	2	12	1431796	1431807	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.