MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Azospirillum sp. B510 chromosome

Total Repeats: 162

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013854	CCCCAC	2	12	4182	4193	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
2	NC_013854	CCCTCC	3	18	20128	20145	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
3	NC_013854	CGAGGC	2	12	53895	53906	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_013854	GGGGAG	2	12	61057	61068	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_013854	AAAATT	2	12	102903	102914	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_013854	TCGCCA	2	12	111752	111763	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
7	NC_013854	AGCGGA	2	12	132767	132778	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_013854	CCGGCC	2	12	187913	187924	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9	NC_013854	GCATGG	2	12	196055	196066	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_013854	GGGGGA	2	12	205324	205335	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_013854	CTTCGC	2	12	220110	220121	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
12	NC_013854	GCTGGG	2	12	236160	236171	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_013854	GCGGGA	2	12	241169	241180	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_013854	GGCGGG	2	12	279866	279877	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_013854	CGGAGA	2	12	294985	294996	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_013854	GGGAGG	2	12	311406	311417	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_013854	GGAGGG	2	12	329230	329241	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_013854	CGTTCG	2	12	369321	369332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_013854	GCCGGC	2	12	374119	374130	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
20	NC_013854	GCCGTC	2	12	456246	456257	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
21	NC_013854	CGGAAA	2	12	477024	477035	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_013854	AGGCCG	2	12	494055	494066	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_013854	GGGGGC	2	12	497800	497811	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_013854	TGGCGG	2	12	507118	507129	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_013854	TCCGGG	2	12	524954	524965	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_013854	CATCCT	2	12	525694	525705	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_013854	CGCAAA	2	12	558276	558287	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_013854	CATCGG	2	12	559123	559134	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_013854	GGGAGA	2	12	578384	578395	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_013854	GCCGGC	2	12	586420	586431	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
31	NC_013854	GAAAAG	2	12	605814	605825	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_013854	CCCGGA	2	12	611338	611349	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
33	NC_013854	CGCGTA	2	12	647069	647080	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_013854	CGCGTC	2	12	667833	667844	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
35	NC_013854	GGGTCG	2	12	690642	690653	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_013854	GGTCCT	2	12	696837	696848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_013854	CGTCAA	2	12	731445	731456	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_013854	CTCTCC	2	12	754290	754301	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
39	NC_013854	AGGGTG	2	12	766053	766064	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_013854	CCTGCG	2	12	766132	766143	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
41	NC_013854	CCCATC	2	12	773319	773330	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
42	NC_013854	CCACGG	2	12	791837	791848	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
43	NC_013854	GCGGGC	2	12	794805	794816	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_013854	ATGGGA	2	12	822535	822546	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_013854	GCGGAT	2	12	848903	848914	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_013854	TTGTCT	2	12	898445	898456	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_013854	AGGCGA	2	12	901494	901505	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_013854	AACCAT	2	12	909123	909134	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_013854	CGACGC	2	12	911041	911052	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
50	NC_013854	AAGGAC	2	12	913222	913233	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_013854	CAACGC	2	12	915695	915706	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
52	NC_013854	GGGAGT	2	12	924258	924269	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_013854	CGGGGC	2	12	978311	978322	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_013854	TGCGCC	2	12	1015191	1015202	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
55	NC_013854	TCCGTG	2	12	1025263	1025274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_013854	TCCGCC	2	12	1053545	1053556	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
57	NC_013854	GCGCTT	2	12	1080550	1080561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_013854	TTGGCT	2	12	1102897	1102908	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_013854	CTGTCC	2	12	1108943	1108954	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
60	NC_013854	CGCAAA	2	12	1125775	1125786	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_013854	CGGGCG	2	12	1139884	1139895	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_013854	CGACGC	2	12	1164954	1164965	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
63	NC_013854	CGTTTT	2	12	1196425	1196436	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_013854	GCCCTG	2	12	1202937	1202948	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
65	NC_013854	TGGGGG	2	12	1252417	1252428	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_013854	CCATGA	2	12	1261901	1261912	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_013854	CGACGC	2	12	1283938	1283949	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
68	NC_013854	TCATCG	2	12	1297257	1297268	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_013854	GAGGAC	2	12	1352844	1352855	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_013854	GCCTCC	2	12	1359251	1359262	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
71	NC_013854	CCGCGA	2	12	1362319	1362330	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
72	NC_013854	TTCCGG	2	12	1393878	1393889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_013854	ACGCCG	2	12	1443188	1443199	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
74	NC_013854	TGACGT	2	12	1463387	1463398	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_013854	CAAAAG	2	12	1472469	1472480	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_013854	ACCGGC	2	12	1492320	1492331	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
77	NC_013854	TGGGAC	2	12	1550981	1550992	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_013854	GTTGAT	2	12	1584114	1584125	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_013854	TTCGAG	2	12	1590763	1590774	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_013854	GAGGGA	2	12	1606917	1606928	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_013854	CATCCT	2	12	1611819	1611830	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
82	NC_013854	CGGCAT	2	12	1612753	1612764	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_013854	ACCGCG	2	12	1621602	1621613	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
84	NC_013854	CCGATG	2	12	1629330	1629341	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_013854	CCATCA	2	12	1633958	1633969	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
86	NC_013854	AACGGC	2	12	1662842	1662853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_013854	GGGGCG	2	12	1706676	1706687	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_013854	GCCCCG	2	12	1749725	1749736	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
89	NC_013854	AGGCAT	2	12	1801341	1801352	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_013854	AGCCGG	2	12	1801428	1801439	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_013854	GGCATC	2	12	1804722	1804733	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_013854	GCGGCC	2	12	1891229	1891240	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
93	NC_013854	TACAGT	2	12	1939833	1939844	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_013854	CGCAAG	2	12	1994020	1994031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_013854	CCCCGA	2	12	1995069	1995080	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
96	NC_013854	CCGCCC	2	12	2070118	2070129	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
97	NC_013854	CCGCCA	3	18	2074002	2074019	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
98	NC_013854	ATCCCA	2	12	2089722	2089733	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
99	NC_013854	CCTGAC	2	12	2096364	2096375	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
100	NC_013854	GACCGG	2	12	2100971	2100982	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_013854	GCGATG	2	12	2101021	2101032	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
102	NC_013854	GACAAC	2	12	2111267	2111278	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_013854	GCGACC	2	12	2135536	2135547	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
104	NC_013854	ACGGTG	2	12	2140611	2140622	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
105	NC_013854	CTACGG	2	12	2153284	2153295	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_013854	CGACGC	2	12	2161866	2161877	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
107	NC_013854	GTTCCG	2	12	2164421	2164432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_013854	AGGCCA	2	12	2174136	2174147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_013854	GATGGC	2	12	2176484	2176495	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
110	NC_013854	GCTTCG	2	12	2177228	2177239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_013854	GCCGCT	2	12	2204117	2204128	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
112	NC_013854	GCATCG	2	12	2210645	2210656	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_013854	TGCCAG	2	12	2251445	2251456	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_013854	CGCCTT	2	12	2251481	2251492	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
115	NC_013854	TGGCGA	2	12	2279972	2279983	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
116	NC_013854	CGGGCG	2	12	2291291	2291302	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_013854	CCCGGC	2	12	2299254	2299265	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
118	NC_013854	GCGCCC	2	12	2311446	2311457	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
119	NC_013854	GGAGAG	2	12	2318414	2318425	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
120	NC_013854	ACCCCT	2	12	2318435	2318446	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
121	NC_013854	ACTCCC	2	12	2353311	2353322	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
122	NC_013854	CGAAAG	2	12	2395731	2395742	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
123	NC_013854	CTGCCC	2	12	2396795	2396806	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
124	NC_013854	CCCCGG	2	12	2410286	2410297	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
125	NC_013854	CGGAAC	2	12	2415188	2415199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_013854	GGGAAC	2	12	2451546	2451557	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
127	NC_013854	GTTGGC	2	12	2518621	2518632	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
128	NC_013854	TTTTCG	2	12	2536028	2536039	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
129	NC_013854	GACGGC	2	12	2587809	2587820	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_013854	TGCCGG	2	12	2619542	2619553	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_013854	CCAGCG	2	12	2625170	2625181	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
132	NC_013854	TTTTCG	2	12	2643849	2643860	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
133	NC_013854	GAGAGG	2	12	2657413	2657424	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
134	NC_013854	GACCTG	2	12	2660409	2660420	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_013854	TCGCCG	2	12	2660575	2660586	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
136	NC_013854	GGCAAT	2	12	2715161	2715172	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
137	NC_013854	TGCCGG	2	12	2722473	2722484	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_013854	GGGTCT	2	12	2770770	2770781	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
139	NC_013854	TCGGGG	2	12	2777130	2777141	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
140	NC_013854	CCCGGT	2	12	2802820	2802831	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
141	NC_013854	CGAAAA	2	12	2831411	2831422	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
142	NC_013854	TCGGGA	2	12	2853424	2853435	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
143	NC_013854	GCCCTC	2	12	2872755	2872766	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
144	NC_013854	CCTGCT	2	12	2892927	2892938	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
145	NC_013854	GTCCTG	2	12	2915837	2915848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_013854	CCTTTC	2	12	2929427	2929438	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
147	NC_013854	GCGTCG	2	12	2949032	2949043	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
148	NC_013854	GAAACG	2	12	2951456	2951467	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
149	NC_013854	CGCCCC	2	12	2979861	2979872	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
150	NC_013854	CCCGGC	2	12	2999940	2999951	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
151	NC_013854	GTCTCC	2	12	3009133	3009144	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
152	NC_013854	GCAGCG	2	12	3065048	3065059	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
153	NC_013854	TCGGCG	2	12	3065239	3065250	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
154	NC_013854	GGGCGG	2	12	3112875	3112886	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
155	NC_013854	GGGGAG	2	12	3159609	3159620	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
156	NC_013854	TGTCGA	2	12	3161639	3161650	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
157	NC_013854	TGAGGA	2	12	3207914	3207925	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
158	NC_013854	CCCGGA	2	12	3208656	3208667	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
159	NC_013854	GGCCAT	2	12	3231403	3231414	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
160	NC_013854	GCCATG	2	12	3232125	3232136	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
161	NC_013854	CCCGGT	2	12	3237000	3237011	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
162	NC_013854	ACGGGT	2	12	3283971	3283982	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.