MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Allochromatium vinosum DSM 180 plasmid pALVIN01

Total Repeats: 21

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013852	GGGCG	2	10	17172	17181	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
2	NC_013852	GAACA	2	10	20009	20018	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
3	NC_013852	CGACG	2	10	54753	54762	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
4	NC_013852	AAGTC	2	10	56300	56309	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
5	NC_013852	GACTT	2	10	56412	56421	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
6	NC_013852	ACTTA	2	10	56835	56844	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
7	NC_013852	TCAAG	2	10	57836	57845	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
8	NC_013852	GCCCC	2	10	60578	60587	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
9	NC_013852	TGCCG	2	10	60618	60627	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
10	NC_013852	CGGCA	2	10	60663	60672	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
11	NC_013852	CGCGA	2	10	65033	65042	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
12	NC_013852	TTTTA	2	10	67233	67242	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_013852	CGCCA	2	10	70056	70065	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
14	NC_013852	CGAAT	2	10	71615	71624	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
15	NC_013852	TTTGA	2	10	71736	71745	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
16	NC_013852	TTTGA	2	10	71820	71829	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
17	NC_013852	ATCCT	2	10	78394	78403	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
18	NC_013852	GTGAC	2	10	80867	80876	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
19	NC_013852	CCGGA	2	10	81142	81151	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
20	NC_013852	TCATC	2	10	93362	93371	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
21	NC_013852	GACTT	2	10	100641	100650	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.