MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Allochromatium vinosum DSM 180 plasmid pALVIN01

Total Repeats: 42

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013852	GATC	2	8	13887	13894	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_013852	CACC	2	8	14572	14579	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
3	NC_013852	TCCA	2	8	17526	17533	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_013852	GATT	2	8	19189	19196	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_013852	ATTA	2	8	19558	19565	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_013852	CGAG	2	8	22932	22939	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
7	NC_013852	CAAA	2	8	23913	23920	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
8	NC_013852	ACCG	2	8	24364	24371	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
9	NC_013852	ACCG	2	8	24688	24695	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
10	NC_013852	ACCG	2	8	24791	24798	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
11	NC_013852	TCAT	2	8	37082	37089	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_013852	GCGG	2	8	37495	37502	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
13	NC_013852	TCGC	2	8	37770	37777	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
14	NC_013852	GACC	2	8	37855	37862	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
15	NC_013852	CCGG	2	8	54683	54690	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16	NC_013852	GGCT	2	8	56552	56559	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
17	NC_013852	CGGC	2	8	56927	56934	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18	NC_013852	GATT	2	8	57583	57590	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_013852	AAGT	2	8	57859	57866	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_013852	ATCC	2	8	60367	60374	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NC_013852	GCCC	2	8	60511	60518	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
22	NC_013852	ACCC	2	8	60689	60696	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
23	NC_013852	GCCC	2	8	60697	60704	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
24	NC_013852	TGAT	2	8	64675	64682	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
25	NC_013852	GCCG	2	8	64955	64962	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
26	NC_013852	TCCA	2	8	66125	66132	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_013852	CCAT	2	8	66292	66299	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
28	NC_013852	CCTC	2	8	66788	66795	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
29	NC_013852	GGTC	2	8	67026	67033	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
30	NC_013852	ATCT	2	8	67070	67077	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
31	NC_013852	ATCG	2	8	70037	70044	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
32	NC_013852	CGGT	2	8	70613	70620	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
33	NC_013852	TCCA	2	8	71415	71422	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_013852	GCCG	2	8	76017	76024	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
35	NC_013852	GTCG	2	8	77395	77402	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
36	NC_013852	GGCC	2	8	77768	77775	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
37	NC_013852	GCTG	2	8	77992	77999	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
38	NC_013852	ATGG	2	8	80366	80373	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_013852	GCCA	2	8	81200	81207	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
40	NC_013852	TCAC	2	8	82903	82910	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_013852	GTGA	2	8	82927	82934	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_013852	AGTT	2	8	100652	100659	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.