MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Allochromatium vinosum DSM 180 plasmid pALVIN01

Total Repeats: 201

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013852	CCGC	2	8	162	169	0 %	0 %	25 %	75 %	288947675
2	NC_013852	GTGC	2	8	463	470	0 %	25 %	50 %	25 %	288947675
3	NC_013852	AGTC	2	8	754	761	25 %	25 %	25 %	25 %	288947675
4	NC_013852	CGTC	2	8	1873	1880	0 %	25 %	25 %	50 %	288947676
5	NC_013852	GCGG	2	8	2498	2505	0 %	0 %	75 %	25 %	288947677
6	NC_013852	CTCG	2	8	2942	2949	0 %	25 %	25 %	50 %	288947677
7	NC_013852	GGCC	2	8	3065	3072	0 %	0 %	50 %	50 %	288947677
8	NC_013852	CAGG	2	8	3443	3450	25 %	0 %	50 %	25 %	288947677
9	NC_013852	CCGC	2	8	4165	4172	0 %	0 %	25 %	75 %	288947677
10	NC_013852	CCGC	2	8	4302	4309	0 %	0 %	25 %	75 %	288947678
11	NC_013852	GGCT	2	8	5204	5211	0 %	25 %	50 %	25 %	288947678
12	NC_013852	AAGA	2	8	5318	5325	75 %	0 %	25 %	0 %	288947678
13	NC_013852	TGGC	2	8	5417	5424	0 %	25 %	50 %	25 %	288947678
14	NC_013852	GTCG	2	8	5598	5605	0 %	25 %	50 %	25 %	288947679
15	NC_013852	CCGA	2	8	5950	5957	25 %	0 %	25 %	50 %	288947679
16	NC_013852	TCCG	2	8	6327	6334	0 %	25 %	25 %	50 %	288947679
17	NC_013852	TGAA	2	8	7632	7639	50 %	25 %	25 %	0 %	288947681
18	NC_013852	CCGG	2	8	10664	10671	0 %	0 %	50 %	50 %	288947682
19	NC_013852	GCAC	2	8	12069	12076	25 %	0 %	25 %	50 %	288947683
20	NC_013852	CGGC	2	8	12218	12225	0 %	0 %	50 %	50 %	288947684
21	NC_013852	CCCG	2	8	12386	12393	0 %	0 %	25 %	75 %	288947684
22	NC_013852	CGGT	2	8	12920	12927	0 %	25 %	50 %	25 %	288947685
23	NC_013852	GTCG	2	8	13224	13231	0 %	25 %	50 %	25 %	288947685
24	NC_013852	CCGA	2	8	13342	13349	25 %	0 %	25 %	50 %	288947685
25	NC_013852	CCGA	2	8	13486	13493	25 %	0 %	25 %	50 %	288947685
26	NC_013852	TGGC	2	8	13990	13997	0 %	25 %	50 %	25 %	288947686
27	NC_013852	GCGA	2	8	14007	14014	25 %	0 %	50 %	25 %	288947686
28	NC_013852	ATCA	2	8	14376	14383	50 %	25 %	0 %	25 %	288947686
29	NC_013852	TGGC	2	8	15396	15403	0 %	25 %	50 %	25 %	288947687
30	NC_013852	CGAC	2	8	15430	15437	25 %	0 %	25 %	50 %	288947687
31	NC_013852	GCGG	2	8	16444	16451	0 %	0 %	75 %	25 %	288947689
32	NC_013852	CCCG	2	8	16734	16741	0 %	0 %	25 %	75 %	288947690
33	NC_013852	GATG	2	8	17721	17728	25 %	25 %	50 %	0 %	288947692
34	NC_013852	GGCG	2	8	17864	17871	0 %	0 %	75 %	25 %	288947692
35	NC_013852	CGAG	2	8	18098	18105	25 %	0 %	50 %	25 %	288947693
36	NC_013852	CCCG	2	8	18311	18318	0 %	0 %	25 %	75 %	288947693
37	NC_013852	GCTG	2	8	18433	18440	0 %	25 %	50 %	25 %	288947693
38	NC_013852	GATG	2	8	18732	18739	25 %	25 %	50 %	0 %	288947693
39	NC_013852	GAAG	2	8	18749	18756	50 %	0 %	50 %	0 %	288947693
40	NC_013852	CAGG	2	8	20926	20933	25 %	0 %	50 %	25 %	288947696
41	NC_013852	TGCC	2	8	21251	21258	0 %	25 %	25 %	50 %	288947697
42	NC_013852	GAAC	2	8	21426	21433	50 %	0 %	25 %	25 %	288947697
43	NC_013852	CATC	2	8	23314	23321	25 %	25 %	0 %	50 %	288947699
44	NC_013852	CAGC	2	8	25124	25131	25 %	0 %	25 %	50 %	288947701
45	NC_013852	TCGG	2	8	26037	26044	0 %	25 %	50 %	25 %	288947702
46	NC_013852	GATC	2	8	26837	26844	25 %	25 %	25 %	25 %	288947703
47	NC_013852	CCGC	2	8	26865	26872	0 %	0 %	25 %	75 %	288947704
48	NC_013852	CCTT	2	8	27238	27245	0 %	50 %	0 %	50 %	288947704
49	NC_013852	TCCG	2	8	27707	27714	0 %	25 %	25 %	50 %	288947704
50	NC_013852	CCGA	2	8	28153	28160	25 %	0 %	25 %	50 %	288947705
51	NC_013852	CGGT	2	8	28589	28596	0 %	25 %	50 %	25 %	288947705
52	NC_013852	ATCT	2	8	29381	29388	25 %	50 %	0 %	25 %	288947706
53	NC_013852	GCTG	2	8	30815	30822	0 %	25 %	50 %	25 %	288947709
54	NC_013852	GGAG	2	8	30934	30941	25 %	0 %	75 %	0 %	288947709
55	NC_013852	CAAC	3	12	31588	31599	50 %	0 %	0 %	50 %	288947710
56	NC_013852	CAAG	2	8	31670	31677	50 %	0 %	25 %	25 %	288947711
57	NC_013852	GCCG	2	8	33027	33034	0 %	0 %	50 %	50 %	288947712
58	NC_013852	GTTC	2	8	33322	33329	0 %	50 %	25 %	25 %	288947712
59	NC_013852	CTGG	2	8	33683	33690	0 %	25 %	50 %	25 %	288947713
60	NC_013852	GCGG	2	8	33866	33873	0 %	0 %	75 %	25 %	288947713
61	NC_013852	GTTG	2	8	34090	34097	0 %	50 %	50 %	0 %	288947713
62	NC_013852	TGAG	2	8	34992	34999	25 %	25 %	50 %	0 %	288947715
63	NC_013852	GCTG	2	8	35021	35028	0 %	25 %	50 %	25 %	288947715
64	NC_013852	GGCC	2	8	35132	35139	0 %	0 %	50 %	50 %	288947715
65	NC_013852	TGCC	2	8	35160	35167	0 %	25 %	25 %	50 %	288947715
66	NC_013852	GGCG	2	8	35533	35540	0 %	0 %	75 %	25 %	288947716
67	NC_013852	GACG	2	8	35627	35634	25 %	0 %	50 %	25 %	288947716
68	NC_013852	CCGG	2	8	35664	35671	0 %	0 %	50 %	50 %	288947716
69	NC_013852	GGGC	2	8	36597	36604	0 %	0 %	75 %	25 %	288947717
70	NC_013852	AATC	2	8	36763	36770	50 %	25 %	0 %	25 %	288947718
71	NC_013852	ACCG	2	8	38253	38260	25 %	0 %	25 %	50 %	288947720
72	NC_013852	GATC	2	8	38830	38837	25 %	25 %	25 %	25 %	288947720
73	NC_013852	CTTC	2	8	39091	39098	0 %	50 %	0 %	50 %	288947721
74	NC_013852	CCTG	2	8	39168	39175	0 %	25 %	25 %	50 %	288947721
75	NC_013852	CCCG	2	8	39298	39305	0 %	0 %	25 %	75 %	288947721
76	NC_013852	GATC	2	8	39796	39803	25 %	25 %	25 %	25 %	288947721
77	NC_013852	CGAA	2	8	40080	40087	50 %	0 %	25 %	25 %	288947721
78	NC_013852	CGCC	2	8	40875	40882	0 %	0 %	25 %	75 %	288947721
79	NC_013852	TCGA	2	8	42315	42322	25 %	25 %	25 %	25 %	288947721
80	NC_013852	CCCG	2	8	43592	43599	0 %	0 %	25 %	75 %	288947722
81	NC_013852	TTTC	2	8	44271	44278	0 %	75 %	0 %	25 %	288947723
82	NC_013852	AACA	2	8	44771	44778	75 %	0 %	0 %	25 %	288947723
83	NC_013852	GTCA	2	8	44949	44956	25 %	25 %	25 %	25 %	288947723
84	NC_013852	TAGA	2	8	45385	45392	50 %	25 %	25 %	0 %	288947724
85	NC_013852	AAGC	2	8	45401	45408	50 %	0 %	25 %	25 %	288947724
86	NC_013852	ATGC	2	8	45583	45590	25 %	25 %	25 %	25 %	288947724
87	NC_013852	AAAG	2	8	45696	45703	75 %	0 %	25 %	0 %	288947724
88	NC_013852	GTAA	2	8	46083	46090	50 %	25 %	25 %	0 %	288947724
89	NC_013852	TGAT	2	8	46102	46109	25 %	50 %	25 %	0 %	288947724
90	NC_013852	AGAA	2	8	46157	46164	75 %	0 %	25 %	0 %	288947724
91	NC_013852	GTCG	2	8	46563	46570	0 %	25 %	50 %	25 %	288947725
92	NC_013852	TCGC	2	8	47345	47352	0 %	25 %	25 %	50 %	288947725
93	NC_013852	CGTC	2	8	47380	47387	0 %	25 %	25 %	50 %	288947725
94	NC_013852	CGGG	2	8	48052	48059	0 %	0 %	75 %	25 %	288947725
95	NC_013852	CGCT	2	8	48603	48610	0 %	25 %	25 %	50 %	288947725
96	NC_013852	TCGA	2	8	48618	48625	25 %	25 %	25 %	25 %	288947725
97	NC_013852	CCGG	2	8	48666	48673	0 %	0 %	50 %	50 %	288947725
98	NC_013852	CGGC	2	8	49632	49639	0 %	0 %	50 %	50 %	288947725
99	NC_013852	GGCG	2	8	49753	49760	0 %	0 %	75 %	25 %	288947725
100	NC_013852	GACA	2	8	50064	50071	50 %	0 %	25 %	25 %	288947725
101	NC_013852	CCCG	2	8	50381	50388	0 %	0 %	25 %	75 %	288947725
102	NC_013852	AGCG	2	8	50448	50455	25 %	0 %	50 %	25 %	288947725
103	NC_013852	CCGC	2	8	50649	50656	0 %	0 %	25 %	75 %	288947725
104	NC_013852	CGGT	2	8	51282	51289	0 %	25 %	50 %	25 %	288947725
105	NC_013852	TCCA	2	8	51336	51343	25 %	25 %	0 %	50 %	288947725
106	NC_013852	GGCT	2	8	52907	52914	0 %	25 %	50 %	25 %	288947727
107	NC_013852	GATC	2	8	53085	53092	25 %	25 %	25 %	25 %	288947727
108	NC_013852	GCGG	2	8	53265	53272	0 %	0 %	75 %	25 %	288947728
109	NC_013852	AGGT	2	8	54320	54327	25 %	25 %	50 %	0 %	288947729
110	NC_013852	TCCC	2	8	54554	54561	0 %	25 %	0 %	75 %	288947730
111	NC_013852	GTCA	2	8	57413	57420	25 %	25 %	25 %	25 %	288947733
112	NC_013852	CTGG	2	8	57972	57979	0 %	25 %	50 %	25 %	288947734
113	NC_013852	ATCG	2	8	58042	58049	25 %	25 %	25 %	25 %	288947734
114	NC_013852	AGCC	3	12	58230	58241	25 %	0 %	25 %	50 %	288947734
115	NC_013852	GATG	2	8	58769	58776	25 %	25 %	50 %	0 %	288947735
116	NC_013852	ATTG	2	8	59164	59171	25 %	50 %	25 %	0 %	288947736
117	NC_013852	GCTG	2	8	59374	59381	0 %	25 %	50 %	25 %	288947737
118	NC_013852	GCAA	2	8	59700	59707	50 %	0 %	25 %	25 %	288947737
119	NC_013852	GACC	2	8	59870	59877	25 %	0 %	25 %	50 %	288947737
120	NC_013852	GATT	2	8	60863	60870	25 %	50 %	25 %	0 %	288947739
121	NC_013852	TTCC	2	8	61143	61150	0 %	50 %	0 %	50 %	288947740
122	NC_013852	CTGG	2	8	61376	61383	0 %	25 %	50 %	25 %	288947740
123	NC_013852	TCTT	2	8	61485	61492	0 %	75 %	0 %	25 %	288947740
124	NC_013852	CGTC	2	8	61596	61603	0 %	25 %	25 %	50 %	288947740
125	NC_013852	GTCG	2	8	61966	61973	0 %	25 %	50 %	25 %	288947740
126	NC_013852	TGTC	2	8	62165	62172	0 %	50 %	25 %	25 %	288947740
127	NC_013852	CGCC	2	8	62279	62286	0 %	0 %	25 %	75 %	288947740
128	NC_013852	CCGT	2	8	62371	62378	0 %	25 %	25 %	50 %	288947740
129	NC_013852	CCTC	2	8	62600	62607	0 %	25 %	0 %	75 %	288947740
130	NC_013852	TTCC	2	8	62619	62626	0 %	50 %	0 %	50 %	288947740
131	NC_013852	AGCA	2	8	62829	62836	50 %	0 %	25 %	25 %	288947741
132	NC_013852	CGGA	2	8	62996	63003	25 %	0 %	50 %	25 %	288947741
133	NC_013852	TGGC	2	8	63327	63334	0 %	25 %	50 %	25 %	288947742
134	NC_013852	ATCA	2	8	63426	63433	50 %	25 %	0 %	25 %	288947743
135	NC_013852	CCTG	2	8	67545	67552	0 %	25 %	25 %	50 %	288947748
136	NC_013852	TCCC	2	8	67634	67641	0 %	25 %	0 %	75 %	288947748
137	NC_013852	CTTG	2	8	68273	68280	0 %	50 %	25 %	25 %	288947750
138	NC_013852	GTCG	2	8	69056	69063	0 %	25 %	50 %	25 %	288947751
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.