MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Allochromatium vinosum DSM 180 plasmid pALVIN01

Total Repeats: 222

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013852	CCG	2	6	1170	1175	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2	NC_013852	CGA	2	6	5510	5515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_013852	GAC	2	6	5530	5535	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_013852	AGC	2	6	7918	7923	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_013852	TGC	2	6	8062	8067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_013852	CTC	2	6	8190	8195	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7	NC_013852	AAC	2	6	8262	8267	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_013852	GTT	2	6	8289	8294	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_013852	TAA	2	6	8616	8621	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_013852	ACT	2	6	8953	8958	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_013852	GCC	2	6	8991	8996	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12	NC_013852	GGT	2	6	9041	9046	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_013852	TGC	2	6	9088	9093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_013852	GGC	2	6	9197	9202	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_013852	ACC	2	6	9300	9305	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16	NC_013852	CGC	2	6	9476	9481	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17	NC_013852	GCG	2	6	9515	9520	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_013852	GCG	3	9	9549	9557	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_013852	CGA	2	6	9612	9617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_013852	GCA	2	6	9651	9656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_013852	AGC	2	6	9662	9667	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_013852	CGG	2	6	9680	9685	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_013852	GTG	2	6	9911	9916	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_013852	TGC	2	6	10004	10009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_013852	CAC	2	6	11962	11967	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
26	NC_013852	AAC	2	6	14561	14566	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_013852	GTT	2	6	15769	15774	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_013852	TTC	2	6	15796	15801	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_013852	CGC	2	6	15863	15868	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
30	NC_013852	CCG	2	6	15909	15914	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
31	NC_013852	GCC	2	6	16152	16157	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
32	NC_013852	GGC	2	6	16165	16170	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_013852	GGA	2	6	16220	16225	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_013852	ATC	2	6	16591	16596	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_013852	CGC	2	6	17207	17212	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
36	NC_013852	TGT	2	6	19117	19122	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_013852	TAG	2	6	19603	19608	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_013852	CGA	2	6	19612	19617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_013852	AGA	2	6	19944	19949	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_013852	ACA	2	6	20001	20006	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_013852	GGC	2	6	20322	20327	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_013852	TAT	2	6	21072	21077	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_013852	ACA	2	6	21078	21083	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_013852	ATG	2	6	21161	21166	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_013852	CGA	2	6	22145	22150	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_013852	GGA	2	6	22707	22712	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_013852	ACG	2	6	22722	22727	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_013852	GGA	2	6	22828	22833	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_013852	TGG	2	6	23881	23886	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_013852	TGG	2	6	23982	23987	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_013852	TGG	2	6	24004	24009	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_013852	TGG	2	6	24026	24031	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_013852	TGG	2	6	24048	24053	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_013852	TGG	2	6	24070	24075	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_013852	TGG	2	6	24092	24097	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_013852	TGG	2	6	24114	24119	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_013852	TCT	2	6	24186	24191	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_013852	GGC	2	6	24452	24457	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_013852	CAC	2	6	24508	24513	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
60	NC_013852	GGC	2	6	24630	24635	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_013852	TGG	2	6	24774	24779	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_013852	GTT	2	6	25058	25063	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_013852	ATG	3	9	25071	25079	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_013852	CCA	2	6	25735	25740	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
65	NC_013852	TCC	2	6	26301	26306	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
66	NC_013852	TCG	2	6	30418	30423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_013852	GCG	2	6	30522	30527	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_013852	GGC	2	6	31232	31237	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_013852	TGT	2	6	31255	31260	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_013852	GCC	2	6	32860	32865	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
71	NC_013852	CAG	2	6	37158	37163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_013852	GCG	2	6	37191	37196	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_013852	GCG	2	6	37270	37275	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_013852	CCA	2	6	37295	37300	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
75	NC_013852	CCA	2	6	37346	37351	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
76	NC_013852	CCG	2	6	37377	37382	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
77	NC_013852	CCA	2	6	37442	37447	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
78	NC_013852	CGA	2	6	37460	37465	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_013852	TGA	2	6	37544	37549	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_013852	TCA	2	6	37574	37579	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_013852	CGA	2	6	37595	37600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_013852	CGG	2	6	37622	37627	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_013852	TCG	2	6	37781	37786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_013852	GCG	2	6	51411	51416	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_013852	CCG	2	6	51431	51436	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
86	NC_013852	CGT	2	6	52044	52049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_013852	CGC	2	6	53579	53584	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
88	NC_013852	CGG	2	6	53623	53628	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_013852	GTG	2	6	53638	53643	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_013852	TGC	3	9	53651	53659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_013852	GGC	2	6	53679	53684	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_013852	GGC	2	6	54713	54718	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_013852	GAC	2	6	56325	56330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_013852	ATC	2	6	56644	56649	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_013852	CGT	2	6	56746	56751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_013852	TGC	2	6	56818	56823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_013852	AGC	2	6	57069	57074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_013852	TGC	2	6	57106	57111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_013852	GAT	2	6	57535	57540	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_013852	TGC	2	6	57629	57634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_013852	TCG	2	6	57668	57673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_013852	TCA	2	6	60305	60310	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_013852	CTG	2	6	60322	60327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_013852	CGC	2	6	60385	60390	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
105	NC_013852	CGG	3	9	60394	60402	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_013852	TGA	2	6	60913	60918	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_013852	TAA	2	6	62683	62688	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_013852	CAT	2	6	62704	62709	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_013852	GAA	2	6	63807	63812	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_013852	CGA	2	6	63854	63859	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_013852	CCA	2	6	63920	63925	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
112	NC_013852	AAC	2	6	64251	64256	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_013852	TTA	2	6	64266	64271	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_013852	GAT	2	6	64407	64412	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_013852	TCA	2	6	64516	64521	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_013852	CGG	2	6	64575	64580	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_013852	CGA	2	6	64641	64646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_013852	ACG	2	6	64650	64655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_013852	GGA	2	6	64714	64719	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
120	NC_013852	CGC	2	6	64754	64759	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
121	NC_013852	CCA	2	6	64799	64804	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
122	NC_013852	GAA	3	9	64821	64829	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_013852	GCC	2	6	64886	64891	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
124	NC_013852	CGC	2	6	64903	64908	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
125	NC_013852	GGA	2	6	64937	64942	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
126	NC_013852	AAT	2	6	65527	65532	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_013852	ATT	2	6	65548	65553	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_013852	CTT	2	6	66002	66007	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_013852	GCT	2	6	66078	66083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_013852	GCC	2	6	66084	66089	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
131	NC_013852	CGC	2	6	66142	66147	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
132	NC_013852	CGG	2	6	66151	66156	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_013852	CCT	2	6	66181	66186	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
134	NC_013852	GCC	2	6	66201	66206	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
135	NC_013852	ACG	2	6	66208	66213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_013852	TCG	2	6	66243	66248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_013852	ACG	2	6	66395	66400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_013852	TGA	2	6	66572	66577	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_013852	TCT	2	6	66702	66707	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_013852	CAC	2	6	66846	66851	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.