MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Allochromatium vinosum DSM 180 plasmid pALVIN01

Total Repeats: 1220

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013852	GCC	2	6	56	61	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288947675
2	NC_013852	GCC	2	6	95	100	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288947675
3	NC_013852	CGG	2	6	115	120	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288947675
4	NC_013852	GGC	2	6	127	132	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288947675
5	NC_013852	CCG	2	6	204	209	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288947675
6	NC_013852	GTG	2	6	254	259	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	288947675
7	NC_013852	CCG	2	6	276	281	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288947675
8	NC_013852	CCG	2	6	399	404	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288947675
9	NC_013852	TGC	2	6	429	434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288947675
10	NC_013852	GGC	2	6	482	487	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288947675
11	NC_013852	TGC	2	6	525	530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288947675
12	NC_013852	GAT	2	6	586	591	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	288947675
13	NC_013852	CGT	2	6	696	701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288947675
14	NC_013852	GAT	2	6	842	847	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	288947675
15	NC_013852	GAT	2	6	884	889	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	288947675
16	NC_013852	TCG	2	6	1041	1046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288947675
17	NC_013852	ACG	2	6	1059	1064	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288947675
18	NC_013852	CTG	2	6	1067	1072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288947675
19	NC_013852	GTG	2	6	1106	1111	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	288947675
20	NC_013852	CGG	2	6	1264	1269	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288947676
21	NC_013852	CGC	2	6	1312	1317	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288947676
22	NC_013852	GGC	2	6	1323	1328	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288947676
23	NC_013852	GCG	2	6	1338	1343	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288947676
24	NC_013852	TGG	2	6	1401	1406	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	288947676
25	NC_013852	TCG	2	6	1411	1416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288947676
26	NC_013852	GCG	2	6	1458	1463	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288947676
27	NC_013852	CGC	2	6	1478	1483	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288947676
28	NC_013852	TGG	2	6	1713	1718	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	288947676
29	NC_013852	GGT	2	6	1728	1733	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	288947676
30	NC_013852	GGA	2	6	1799	1804	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	288947676
31	NC_013852	GCC	2	6	1822	1827	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288947676
32	NC_013852	ATC	2	6	2067	2072	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	288947676
33	NC_013852	CTG	2	6	2199	2204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288947676
34	NC_013852	ACG	2	6	2219	2224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288947676
35	NC_013852	CCG	2	6	2278	2283	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288947676
36	NC_013852	GAT	2	6	2340	2345	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	288947676
37	NC_013852	GGC	2	6	2441	2446	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288947677
38	NC_013852	GCT	2	6	2480	2485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288947677
39	NC_013852	TGC	2	6	2515	2520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288947677
40	NC_013852	CGC	2	6	2657	2662	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288947677
41	NC_013852	GCC	3	9	2691	2699	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288947677
42	NC_013852	TGA	2	6	2756	2761	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	288947677
43	NC_013852	CTG	2	6	2787	2792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288947677
44	NC_013852	GAC	2	6	2829	2834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288947677
45	NC_013852	GGC	2	6	2873	2878	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288947677
46	NC_013852	GAG	2	6	2988	2993	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	288947677
47	NC_013852	AGC	2	6	3031	3036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288947677
48	NC_013852	TGA	2	6	3052	3057	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	288947677
49	NC_013852	GCC	2	6	3105	3110	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288947677
50	NC_013852	AGC	2	6	3139	3144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288947677
51	NC_013852	GCG	2	6	3214	3219	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288947677
52	NC_013852	GGC	2	6	3281	3286	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288947677
53	NC_013852	GGA	2	6	3311	3316	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	288947677
54	NC_013852	CGG	2	6	3361	3366	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288947677
55	NC_013852	GCT	2	6	3428	3433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288947677
56	NC_013852	CGG	2	6	3451	3456	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288947677
57	NC_013852	CGG	2	6	3545	3550	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288947677
58	NC_013852	CGA	2	6	3551	3556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288947677
59	NC_013852	CGC	2	6	3662	3667	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288947677
60	NC_013852	GCC	2	6	3779	3784	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288947677
61	NC_013852	CGG	2	6	3830	3835	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288947677
62	NC_013852	GAC	2	6	3861	3866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288947677
63	NC_013852	CGG	2	6	4102	4107	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288947677
64	NC_013852	AAG	2	6	4208	4213	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	288947678
65	NC_013852	AAG	2	6	4217	4222	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	288947678
66	NC_013852	ACA	2	6	4239	4244	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	288947678
67	NC_013852	AGC	3	9	4245	4253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288947678
68	NC_013852	GCG	2	6	4274	4279	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288947678
69	NC_013852	CGC	2	6	4291	4296	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288947678
70	NC_013852	CGA	2	6	4402	4407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288947678
71	NC_013852	CGC	2	6	4437	4442	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288947678
72	NC_013852	ACA	2	6	4554	4559	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	288947678
73	NC_013852	GCG	2	6	4573	4578	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288947678
74	NC_013852	CGG	2	6	4593	4598	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288947678
75	NC_013852	AGG	2	6	4623	4628	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	288947678
76	NC_013852	TGG	2	6	4751	4756	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	288947678
77	NC_013852	GGA	2	6	4762	4767	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	288947678
78	NC_013852	GGC	2	6	4882	4887	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288947678
79	NC_013852	GTT	2	6	4900	4905	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	288947678
80	NC_013852	CGG	2	6	5035	5040	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288947678
81	NC_013852	CCG	2	6	5111	5116	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288947678
82	NC_013852	GCT	2	6	5164	5169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288947678
83	NC_013852	GCC	2	6	5233	5238	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288947678
84	NC_013852	CGC	3	9	5269	5277	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288947678
85	NC_013852	TGG	2	6	5346	5351	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	288947678
86	NC_013852	ACC	2	6	5390	5395	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	288947678
87	NC_013852	CTC	2	6	5664	5669	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	288947679
88	NC_013852	CTG	2	6	5800	5805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288947679
89	NC_013852	ACC	2	6	5977	5982	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	288947679
90	NC_013852	CGC	2	6	6051	6056	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288947679
91	NC_013852	GAA	2	6	6201	6206	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	288947679
92	NC_013852	GAG	2	6	6223	6228	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	288947679
93	NC_013852	GCT	2	6	6342	6347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288947679
94	NC_013852	CGG	2	6	6354	6359	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288947679
95	NC_013852	GCT	2	6	6390	6395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288947679
96	NC_013852	AGG	2	6	6401	6406	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	288947679
97	NC_013852	GGC	2	6	6408	6413	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288947679
98	NC_013852	CCA	2	6	6428	6433	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	288947680
99	NC_013852	AAG	3	9	6486	6494	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	288947680
100	NC_013852	GAT	2	6	6524	6529	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	288947680
101	NC_013852	TGC	2	6	6601	6606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288947680
102	NC_013852	GAT	2	6	6609	6614	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	288947680
103	NC_013852	AGG	2	6	6619	6624	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	288947680
104	NC_013852	TGC	2	6	6625	6630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288947680
105	NC_013852	CGG	2	6	6635	6640	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288947680
106	NC_013852	GCG	2	6	6658	6663	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288947680
107	NC_013852	ATC	2	6	6681	6686	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	288947680
108	NC_013852	TGC	2	6	6769	6774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288947680
109	NC_013852	GAG	2	6	6807	6812	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	288947680
110	NC_013852	CGG	3	9	7099	7107	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288947681
111	NC_013852	GTG	2	6	7181	7186	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	288947681
112	NC_013852	TGG	2	6	7325	7330	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	288947681
113	NC_013852	CGG	2	6	7341	7346	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288947681
114	NC_013852	GAG	2	6	7361	7366	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	288947681
115	NC_013852	CAC	2	6	7372	7377	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	288947681
116	NC_013852	CAT	2	6	7379	7384	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	288947681
117	NC_013852	GCC	2	6	7492	7497	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288947681
118	NC_013852	CGC	2	6	7531	7536	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288947681
119	NC_013852	GTT	2	6	7582	7587	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	288947681
120	NC_013852	CAG	2	6	7658	7663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288947681
121	NC_013852	GCA	2	6	7692	7697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288947681
122	NC_013852	GGC	2	6	7705	7710	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288947681
123	NC_013852	GGC	2	6	7717	7722	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288947681
124	NC_013852	GGA	2	6	7756	7761	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	288947681
125	NC_013852	TGG	2	6	7796	7801	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	288947681
126	NC_013852	ATG	2	6	7845	7850	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	288947681
127	NC_013852	GGA	2	6	10204	10209	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	288947682
128	NC_013852	CTG	2	6	10266	10271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288947682
129	NC_013852	TCG	2	6	10305	10310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288947682
130	NC_013852	CCG	2	6	10427	10432	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288947682
131	NC_013852	GCT	2	6	10471	10476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288947682
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256	NC_013852	CTG	3	9	20615	20623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288947695
257	NC_013852	GCG	2	6	20672	20677	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288947695
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374	NC_013852	GCG	2	6	30627	30632	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288947709
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