MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Allochromatium vinosum DSM 180 plasmid pALVIN01

Total Repeats: 300

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013852	CA	3	6	3	8	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_013852	CG	3	6	669	674	0 %	0 %	50 %	50 %	288947675
3	NC_013852	GC	3	6	859	864	0 %	0 %	50 %	50 %	288947675
4	NC_013852	CG	3	6	897	902	0 %	0 %	50 %	50 %	288947675
5	NC_013852	GC	3	6	1100	1105	0 %	0 %	50 %	50 %	288947675
6	NC_013852	CG	3	6	1368	1373	0 %	0 %	50 %	50 %	288947676
7	NC_013852	TG	4	8	1828	1835	0 %	50 %	50 %	0 %	288947676
8	NC_013852	CG	4	8	2295	2302	0 %	0 %	50 %	50 %	288947676
9	NC_013852	CG	3	6	2455	2460	0 %	0 %	50 %	50 %	288947677
10	NC_013852	CG	3	6	2507	2512	0 %	0 %	50 %	50 %	288947677
11	NC_013852	CG	3	6	2596	2601	0 %	0 %	50 %	50 %	288947677
12	NC_013852	GC	3	6	2727	2732	0 %	0 %	50 %	50 %	288947677
13	NC_013852	CG	3	6	2890	2895	0 %	0 %	50 %	50 %	288947677
14	NC_013852	CG	3	6	3022	3027	0 %	0 %	50 %	50 %	288947677
15	NC_013852	CG	3	6	3097	3102	0 %	0 %	50 %	50 %	288947677
16	NC_013852	GC	3	6	3947	3952	0 %	0 %	50 %	50 %	288947677
17	NC_013852	CG	3	6	4089	4094	0 %	0 %	50 %	50 %	288947677
18	NC_013852	GC	3	6	4152	4157	0 %	0 %	50 %	50 %	288947677
19	NC_013852	TG	3	6	5430	5435	0 %	50 %	50 %	0 %	288947678
20	NC_013852	GC	3	6	5699	5704	0 %	0 %	50 %	50 %	288947679
21	NC_013852	CG	3	6	5722	5727	0 %	0 %	50 %	50 %	288947679
22	NC_013852	GC	3	6	5875	5880	0 %	0 %	50 %	50 %	288947679
23	NC_013852	GC	3	6	6209	6214	0 %	0 %	50 %	50 %	288947679
24	NC_013852	GC	3	6	6422	6427	0 %	0 %	50 %	50 %	288947680
25	NC_013852	GT	3	6	6455	6460	0 %	50 %	50 %	0 %	288947680
26	NC_013852	GC	3	6	6629	6634	0 %	0 %	50 %	50 %	288947680
27	NC_013852	CG	3	6	6720	6725	0 %	0 %	50 %	50 %	288947680
28	NC_013852	GC	3	6	6869	6874	0 %	0 %	50 %	50 %	288947681
29	NC_013852	TG	3	6	7195	7200	0 %	50 %	50 %	0 %	288947681
30	NC_013852	CG	3	6	9007	9012	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
31	NC_013852	GC	3	6	9700	9705	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
32	NC_013852	GC	3	6	10631	10636	0 %	0 %	50 %	50 %	288947682
33	NC_013852	CG	3	6	10831	10836	0 %	0 %	50 %	50 %	288947682
34	NC_013852	CG	3	6	11414	11419	0 %	0 %	50 %	50 %	288947682
35	NC_013852	GC	3	6	12026	12031	0 %	0 %	50 %	50 %	288947683
36	NC_013852	CG	4	8	12498	12505	0 %	0 %	50 %	50 %	288947684
37	NC_013852	GC	3	6	12805	12810	0 %	0 %	50 %	50 %	288947685
38	NC_013852	CG	3	6	12842	12847	0 %	0 %	50 %	50 %	288947685
39	NC_013852	GC	4	8	13560	13567	0 %	0 %	50 %	50 %	288947685
40	NC_013852	GC	3	6	13662	13667	0 %	0 %	50 %	50 %	288947685
41	NC_013852	GC	3	6	13757	13762	0 %	0 %	50 %	50 %	288947685
42	NC_013852	CA	3	6	13839	13844	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
43	NC_013852	GC	3	6	14942	14947	0 %	0 %	50 %	50 %	288947687
44	NC_013852	GC	4	8	16390	16397	0 %	0 %	50 %	50 %	288947689
45	NC_013852	GC	4	8	16399	16406	0 %	0 %	50 %	50 %	288947689
46	NC_013852	GC	3	6	16472	16477	0 %	0 %	50 %	50 %	288947689
47	NC_013852	CG	3	6	16697	16702	0 %	0 %	50 %	50 %	288947690
48	NC_013852	CG	3	6	17049	17054	0 %	0 %	50 %	50 %	288947690
49	NC_013852	GC	3	6	17118	17123	0 %	0 %	50 %	50 %	288947690
50	NC_013852	GC	3	6	17745	17750	0 %	0 %	50 %	50 %	288947692
51	NC_013852	GC	3	6	17852	17857	0 %	0 %	50 %	50 %	288947692
52	NC_013852	GC	3	6	18188	18193	0 %	0 %	50 %	50 %	288947693
53	NC_013852	GC	3	6	18276	18281	0 %	0 %	50 %	50 %	288947693
54	NC_013852	GC	3	6	18585	18590	0 %	0 %	50 %	50 %	288947693
55	NC_013852	CG	3	6	18834	18839	0 %	0 %	50 %	50 %	288947693
56	NC_013852	CT	3	6	19994	19999	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
57	NC_013852	CG	4	8	20103	20110	0 %	0 %	50 %	50 %	288947694
58	NC_013852	CG	3	6	20553	20558	0 %	0 %	50 %	50 %	288947695
59	NC_013852	GA	3	6	20864	20869	50 %	0 %	50 %	0 %	288947696
60	NC_013852	GC	3	6	21662	21667	0 %	0 %	50 %	50 %	288947697
61	NC_013852	TC	4	8	22346	22353	0 %	50 %	0 %	50 %	288947698
62	NC_013852	CG	3	6	22410	22415	0 %	0 %	50 %	50 %	288947698
63	NC_013852	CG	3	6	22576	22581	0 %	0 %	50 %	50 %	288947698
64	NC_013852	GC	3	6	22751	22756	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
65	NC_013852	GC	3	6	23005	23010	0 %	0 %	50 %	50 %	288947699
66	NC_013852	CA	3	6	23295	23300	50 %	0 %	0 %	50 %	288947699
67	NC_013852	GC	3	6	23940	23945	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
68	NC_013852	CA	3	6	25037	25042	50 %	0 %	0 %	50 %	288947700
69	NC_013852	GC	4	8	25317	25324	0 %	0 %	50 %	50 %	288947701
70	NC_013852	GC	3	6	25598	25603	0 %	0 %	50 %	50 %	288947701
71	NC_013852	CG	3	6	25627	25632	0 %	0 %	50 %	50 %	288947701
72	NC_013852	TG	3	6	25681	25686	0 %	50 %	50 %	0 %	288947701
73	NC_013852	GC	3	6	25695	25700	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
74	NC_013852	TG	3	6	25886	25891	0 %	50 %	50 %	0 %	288947702
75	NC_013852	CG	3	6	25933	25938	0 %	0 %	50 %	50 %	288947702
76	NC_013852	GC	3	6	26791	26796	0 %	0 %	50 %	50 %	288947703
77	NC_013852	CA	3	6	27046	27051	50 %	0 %	0 %	50 %	288947704
78	NC_013852	GC	3	6	27293	27298	0 %	0 %	50 %	50 %	288947704
79	NC_013852	GC	3	6	27333	27338	0 %	0 %	50 %	50 %	288947704
80	NC_013852	GC	3	6	27822	27827	0 %	0 %	50 %	50 %	288947704
81	NC_013852	GC	3	6	28272	28277	0 %	0 %	50 %	50 %	288947705
82	NC_013852	GA	3	6	29656	29661	50 %	0 %	50 %	0 %	288947707
83	NC_013852	CG	3	6	29972	29977	0 %	0 %	50 %	50 %	288947707
84	NC_013852	CG	4	8	30823	30830	0 %	0 %	50 %	50 %	288947709
85	NC_013852	CA	3	6	31106	31111	50 %	0 %	0 %	50 %	288947709
86	NC_013852	GC	3	6	31459	31464	0 %	0 %	50 %	50 %	288947710
87	NC_013852	CG	3	6	31735	31740	0 %	0 %	50 %	50 %	288947711
88	NC_013852	GC	3	6	31905	31910	0 %	0 %	50 %	50 %	288947711
89	NC_013852	GC	3	6	32373	32378	0 %	0 %	50 %	50 %	288947711
90	NC_013852	GC	3	6	32541	32546	0 %	0 %	50 %	50 %	288947711
91	NC_013852	GC	4	8	32581	32588	0 %	0 %	50 %	50 %	288947711
92	NC_013852	GC	3	6	33456	33461	0 %	0 %	50 %	50 %	288947712
93	NC_013852	CG	3	6	33830	33835	0 %	0 %	50 %	50 %	288947713
94	NC_013852	CG	3	6	34545	34550	0 %	0 %	50 %	50 %	288947714
95	NC_013852	AG	3	6	35313	35318	50 %	0 %	50 %	0 %	288947715
96	NC_013852	GT	3	6	35382	35387	0 %	50 %	50 %	0 %	288947715
97	NC_013852	GA	3	6	35618	35623	50 %	0 %	50 %	0 %	288947716
98	NC_013852	CG	3	6	36272	36277	0 %	0 %	50 %	50 %	288947717
99	NC_013852	CA	3	6	37113	37118	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
100	NC_013852	GC	3	6	37639	37644	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
101	NC_013852	GC	3	6	38321	38326	0 %	0 %	50 %	50 %	288947720
102	NC_013852	TC	3	6	38785	38790	0 %	50 %	0 %	50 %	288947720
103	NC_013852	CG	3	6	39220	39225	0 %	0 %	50 %	50 %	288947721
104	NC_013852	GC	3	6	39289	39294	0 %	0 %	50 %	50 %	288947721
105	NC_013852	CG	3	6	39403	39408	0 %	0 %	50 %	50 %	288947721
106	NC_013852	GC	3	6	39572	39577	0 %	0 %	50 %	50 %	288947721
107	NC_013852	GC	3	6	39772	39777	0 %	0 %	50 %	50 %	288947721
108	NC_013852	GC	3	6	39844	39849	0 %	0 %	50 %	50 %	288947721
109	NC_013852	GC	4	8	39894	39901	0 %	0 %	50 %	50 %	288947721
110	NC_013852	CG	4	8	40057	40064	0 %	0 %	50 %	50 %	288947721
111	NC_013852	CG	3	6	41919	41924	0 %	0 %	50 %	50 %	288947721
112	NC_013852	GC	3	6	42033	42038	0 %	0 %	50 %	50 %	288947721
113	NC_013852	GC	3	6	42055	42060	0 %	0 %	50 %	50 %	288947721
114	NC_013852	CG	3	6	43511	43516	0 %	0 %	50 %	50 %	288947722
115	NC_013852	GC	3	6	43563	43568	0 %	0 %	50 %	50 %	288947722
116	NC_013852	CG	3	6	43706	43711	0 %	0 %	50 %	50 %	288947722
117	NC_013852	GC	3	6	43830	43835	0 %	0 %	50 %	50 %	288947722
118	NC_013852	GA	3	6	44817	44822	50 %	0 %	50 %	0 %	288947723
119	NC_013852	CG	3	6	46344	46349	0 %	0 %	50 %	50 %	288947725
120	NC_013852	CG	3	6	46595	46600	0 %	0 %	50 %	50 %	288947725
121	NC_013852	CG	4	8	46650	46657	0 %	0 %	50 %	50 %	288947725
122	NC_013852	GC	3	6	46989	46994	0 %	0 %	50 %	50 %	288947725
123	NC_013852	CG	3	6	47062	47067	0 %	0 %	50 %	50 %	288947725
124	NC_013852	CG	3	6	47166	47171	0 %	0 %	50 %	50 %	288947725
125	NC_013852	CG	3	6	47398	47403	0 %	0 %	50 %	50 %	288947725
126	NC_013852	GC	4	8	47599	47606	0 %	0 %	50 %	50 %	288947725
127	NC_013852	CG	3	6	48004	48009	0 %	0 %	50 %	50 %	288947725
128	NC_013852	CG	3	6	48249	48254	0 %	0 %	50 %	50 %	288947725
129	NC_013852	CG	3	6	48394	48399	0 %	0 %	50 %	50 %	288947725
130	NC_013852	CG	3	6	48916	48921	0 %	0 %	50 %	50 %	288947725
131	NC_013852	GC	3	6	49226	49231	0 %	0 %	50 %	50 %	288947725
132	NC_013852	CG	4	8	50257	50264	0 %	0 %	50 %	50 %	288947725
133	NC_013852	GC	3	6	50323	50328	0 %	0 %	50 %	50 %	288947725
134	NC_013852	GC	3	6	50806	50811	0 %	0 %	50 %	50 %	288947725
135	NC_013852	CG	3	6	51498	51503	0 %	0 %	50 %	50 %	288947726
136	NC_013852	CG	3	6	51593	51598	0 %	0 %	50 %	50 %	288947726
137	NC_013852	CG	3	6	51955	51960	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
138	NC_013852	GT	3	6	52004	52009	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
139	NC_013852	CG	3	6	53324	53329	0 %	0 %	50 %	50 %	288947728
140	NC_013852	CG	3	6	53514	53519	0 %	0 %	50 %	50 %	288947728
141	NC_013852	TG	3	6	54011	54016	0 %	50 %	50 %	0 %	288947729
142	NC_013852	TG	3	6	54401	54406	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
143	NC_013852	GC	3	6	54659	54664	0 %	0 %	50 %	50 %	288947730
144	NC_013852	CA	3	6	55243	55248	50 %	0 %	0 %	50 %	288947731
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300	NC_013852	GC	3	6	101824	101829	0 %	0 %	50 %	50 %	288947793

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.