MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Allochromatium vinosum DSM 180 plasmid pALVIN01

Total Repeats: 44

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013852	CA	3	6	3	8	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_013852	CG	3	6	9007	9012	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3	NC_013852	GC	3	6	9700	9705	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4	NC_013852	CA	3	6	13839	13844	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_013852	CT	3	6	19994	19999	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_013852	GC	3	6	22751	22756	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7	NC_013852	GC	3	6	23940	23945	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8	NC_013852	GC	3	6	25695	25700	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9	NC_013852	CA	3	6	37113	37118	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_013852	GC	3	6	37639	37644	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11	NC_013852	CG	3	6	51955	51960	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12	NC_013852	GT	3	6	52004	52009	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_013852	TG	3	6	54401	54406	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_013852	TC	4	8	56499	56506	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_013852	CG	3	6	56730	56735	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16	NC_013852	CG	3	6	57701	57706	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17	NC_013852	CG	3	6	57772	57777	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18	NC_013852	CG	3	6	57788	57793	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19	NC_013852	CG	4	8	60992	60999	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
20	NC_013852	CG	4	8	63758	63765	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
21	NC_013852	GC	3	6	63951	63956	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
22	NC_013852	GC	3	6	64492	64497	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
23	NC_013852	GC	3	6	64508	64513	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
24	NC_013852	CG	3	6	64654	64659	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
25	NC_013852	TG	3	6	64720	64725	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_013852	CG	3	6	65044	65049	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
27	NC_013852	CG	3	6	66399	66404	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
28	NC_013852	CG	4	8	66651	66658	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
29	NC_013852	GC	3	6	66892	66897	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
30	NC_013852	TA	3	6	67214	67219	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_013852	GT	3	6	67246	67251	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_013852	CG	3	6	69485	69490	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
33	NC_013852	CG	3	6	70582	70587	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
34	NC_013852	CG	3	6	71466	71471	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
35	NC_013852	GC	3	6	72778	72783	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
36	NC_013852	CG	3	6	77424	77429	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
37	NC_013852	CT	3	6	79171	79176	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_013852	TC	3	6	80612	80617	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_013852	CG	3	6	80724	80729	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
40	NC_013852	GC	3	6	81110	81115	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
41	NC_013852	GC	4	8	81209	81216	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
42	NC_013852	CG	3	6	81285	81290	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
43	NC_013852	CA	3	6	88511	88516	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
44	NC_013852	TA	3	6	97602	97607	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.