MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Allochromatium vinosum DSM 180 plasmid pALVIN01

Total Repeats: 43

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013852	A	8	8	7993	8000	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_013852	T	6	6	8690	8695	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_013852	T	7	7	8847	8853	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_013852	T	6	6	8890	8895	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_013852	A	6	6	9963	9968	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_013852	C	6	6	10107	10112	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
7	NC_013852	G	6	6	16562	16567	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
8	NC_013852	C	6	6	17887	17892	0 %	0 %	0 %	100 %	288947692
9	NC_013852	T	6	6	19148	19153	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_013852	T	6	6	19677	19682	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_013852	A	6	6	22805	22810	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_013852	G	6	6	23263	23268	0 %	0 %	100 %	0 %	288947699
13	NC_013852	T	7	7	24160	24166	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_013852	C	6	6	27518	27523	0 %	0 %	0 %	100 %	288947704
15	NC_013852	T	6	6	44255	44260	0 %	100 %	0 %	0 %	288947723
16	NC_013852	A	6	6	44598	44603	100 %	0 %	0 %	0 %	288947723
17	NC_013852	A	6	6	44973	44978	100 %	0 %	0 %	0 %	288947723
18	NC_013852	A	6	6	45043	45048	100 %	0 %	0 %	0 %	288947723
19	NC_013852	T	6	6	45553	45558	0 %	100 %	0 %	0 %	288947724
20	NC_013852	A	7	7	45753	45759	100 %	0 %	0 %	0 %	288947724
21	NC_013852	A	6	6	56630	56635	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_013852	G	6	6	56650	56655	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
23	NC_013852	A	6	6	56763	56768	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_013852	C	6	6	60584	60589	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
25	NC_013852	T	6	6	61451	61456	0 %	100 %	0 %	0 %	288947740
26	NC_013852	G	6	6	61519	61524	0 %	0 %	100 %	0 %	288947740
27	NC_013852	G	6	6	61547	61552	0 %	0 %	100 %	0 %	288947740
28	NC_013852	T	6	6	62246	62251	0 %	100 %	0 %	0 %	288947740
29	NC_013852	T	7	7	62632	62638	0 %	100 %	0 %	0 %	288947740
30	NC_013852	C	6	6	62783	62788	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
31	NC_013852	T	6	6	64027	64032	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_013852	T	6	6	64117	64122	0 %	100 %	0 %	0 %	288947744
33	NC_013852	T	6	6	67176	67181	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_013852	C	6	6	69868	69873	0 %	0 %	0 %	100 %	288947752
35	NC_013852	G	7	7	70876	70882	0 %	0 %	100 %	0 %	288947754
36	NC_013852	A	7	7	71031	71037	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_013852	C	6	6	72485	72490	0 %	0 %	0 %	100 %	288947756
38	NC_013852	A	7	7	72953	72959	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_013852	G	7	7	79278	79284	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
40	NC_013852	T	6	6	79777	79782	0 %	100 %	0 %	0 %	288947765
41	NC_013852	A	6	6	81081	81086	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_013852	G	6	6	81389	81394	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
43	NC_013852	G	6	6	89973	89978	0 %	0 %	100 %	0 %	288947779

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.