MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Allochromatium vinosum DSM 180 chromosome

Total Repeats: 51912

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_013851	CCG	2	6	107195	107200	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288939866
1502	NC_013851	GCG	2	6	107507	107512	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288939867
1503	NC_013851	GTT	2	6	107780	107785	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	288939868
1504	NC_013851	GCC	2	6	107820	107825	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288939868
1505	NC_013851	CCG	2	6	107829	107834	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288939868
1506	NC_013851	CTG	2	6	107901	107906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288939868
1507	NC_013851	CGA	2	6	107981	107986	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288939868
1508	NC_013851	GCA	2	6	108080	108085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288939868
1509	NC_013851	CAG	2	6	108339	108344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288939869
1510	NC_013851	CGA	2	6	108347	108352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288939869
1511	NC_013851	CGG	2	6	108386	108391	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288939869
1512	NC_013851	GCG	2	6	108397	108402	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288939869
1513	NC_013851	TCA	2	6	108430	108435	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	288939869
1514	NC_013851	GAC	2	6	108441	108446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288939869
1515	NC_013851	GTC	3	9	108474	108482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288939869
1516	NC_013851	GAC	2	6	108483	108488	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288939869
1517	NC_013851	GCG	2	6	108508	108513	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288939869
1518	NC_013851	TCG	2	6	108526	108531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288939869
1519	NC_013851	CAA	2	6	108563	108568	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	288939869
1520	NC_013851	GCG	2	6	108583	108588	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288939869
1521	NC_013851	GCG	2	6	108616	108621	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288939869
1522	NC_013851	TCG	2	6	108671	108676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288939870
1523	NC_013851	GCT	2	6	108702	108707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288939870
1524	NC_013851	CTG	2	6	108712	108717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288939870
1525	NC_013851	TCA	2	6	108746	108751	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	288939870
1526	NC_013851	TCT	2	6	108866	108871	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	288939870
1527	NC_013851	GCT	2	6	108912	108917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288939870
1528	NC_013851	GCC	2	6	108946	108951	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288939870
1529	NC_013851	TCG	2	6	109068	109073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288939870
1530	NC_013851	GCT	2	6	109097	109102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288939870
1531	NC_013851	GCT	2	6	109134	109139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288939870
1532	NC_013851	CTG	2	6	109225	109230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288939870
1533	NC_013851	CGC	2	6	109422	109427	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288939870
1534	NC_013851	CGA	2	6	109449	109454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288939870
1535	NC_013851	TCG	2	6	109460	109465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288939870
1536	NC_013851	CGA	2	6	109635	109640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288939870
1537	NC_013851	CAC	2	6	109985	109990	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	288939871
1538	NC_013851	GCC	2	6	110008	110013	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288939871
1539	NC_013851	CGA	2	6	110037	110042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288939871
1540	NC_013851	GCT	2	6	110087	110092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288939871
1541	NC_013851	CGA	2	6	110118	110123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288939871
1542	NC_013851	GCT	2	6	110169	110174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288939871
1543	NC_013851	CGA	3	9	110270	110278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288939871
1544	NC_013851	GAT	2	6	110409	110414	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	288939872
1545	NC_013851	CAT	2	6	110592	110597	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	288939872
1546	NC_013851	CCA	2	6	110796	110801	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	288939873
1547	NC_013851	GAA	2	6	110846	110851	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	288939873
1548	NC_013851	CTG	2	6	110855	110860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288939873
1549	NC_013851	AAG	2	6	110876	110881	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	288939873
1550	NC_013851	GGC	2	6	110892	110897	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288939873
1551	NC_013851	TCA	2	6	110961	110966	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	288939873
1552	NC_013851	GAG	2	6	111092	111097	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	288939873
1553	NC_013851	CGA	2	6	111247	111252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288939873
1554	NC_013851	GCC	2	6	111393	111398	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288939873
1555	NC_013851	GTC	2	6	111431	111436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288939873
1556	NC_013851	AGA	2	6	111474	111479	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	288939873
1557	NC_013851	GAG	2	6	111524	111529	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	288939873
1558	NC_013851	GCT	2	6	111583	111588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288939873
1559	NC_013851	TCG	2	6	111780	111785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288939873
1560	NC_013851	GAT	2	6	111800	111805	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	288939873
1561	NC_013851	AGG	2	6	111834	111839	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	288939873
1562	NC_013851	CAG	2	6	111926	111931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288939873
1563	NC_013851	ATG	2	6	117773	117778	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	288939874
1564	NC_013851	AGT	2	6	117834	117839	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	288939874
1565	NC_013851	GAC	2	6	117859	117864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288939874
1566	NC_013851	ATG	2	6	117937	117942	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	288939874
1567	NC_013851	CCG	2	6	117955	117960	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288939874
1568	NC_013851	CCG	2	6	118001	118006	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288939874
1569	NC_013851	TGA	2	6	118107	118112	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	288939874
1570	NC_013851	TTC	2	6	118262	118267	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	288939875
1571	NC_013851	TCG	2	6	118331	118336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288939875
1572	NC_013851	GAC	2	6	118496	118501	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288939875
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1574	NC_013851	TCG	2	6	118569	118574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288939875
1575	NC_013851	TTC	2	6	118716	118721	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	288939875
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1577	NC_013851	GCG	2	6	118781	118786	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288939875
1578	NC_013851	CGG	2	6	118867	118872	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288939875
1579	NC_013851	CGG	2	6	118891	118896	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288939875
1580	NC_013851	TCG	2	6	119020	119025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288939875
1581	NC_013851	GCC	2	6	119043	119048	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288939875
1582	NC_013851	GCG	2	6	119105	119110	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288939875
1583	NC_013851	CGC	2	6	119121	119126	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288939875
1584	NC_013851	TCG	2	6	119457	119462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288939876
1585	NC_013851	TGG	2	6	119485	119490	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	288939876
1586	NC_013851	GTC	2	6	119663	119668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288939876
1587	NC_013851	CAG	2	6	120041	120046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288939876
1588	NC_013851	GCC	2	6	120103	120108	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288939876
1589	NC_013851	CCA	2	6	120113	120118	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	288939876
1590	NC_013851	CGT	2	6	120150	120155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288939876
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1592	NC_013851	CGG	2	6	120430	120435	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288939877
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1597	NC_013851	GCG	2	6	120548	120553	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288939877
1598	NC_013851	GTC	2	6	120562	120567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288939877
1599	NC_013851	CAG	2	6	120706	120711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288939877
1600	NC_013851	CAG	2	6	120796	120801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288939877
1601	NC_013851	AGG	2	6	120845	120850	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	288939877
1602	NC_013851	GTC	2	6	120862	120867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288939877
1603	NC_013851	CGC	2	6	120999	121004	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288939877
1604	NC_013851	CAG	2	6	121238	121243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288939878
1605	NC_013851	AGG	2	6	121345	121350	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	288939878
1606	NC_013851	CGG	2	6	121390	121395	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288939878
1607	NC_013851	TGA	3	9	121468	121476	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	288939878
1608	NC_013851	CGA	2	6	121507	121512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288939878
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1610	NC_013851	CCA	2	6	121705	121710	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	288939878
1611	NC_013851	AGC	2	6	121729	121734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288939878
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1613	NC_013851	CAT	2	6	122038	122043	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	288939879
1614	NC_013851	CGA	2	6	122128	122133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288939879
1615	NC_013851	GGA	3	9	122164	122172	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	288939879
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2000	NC_013851	GGA	2	6	147180	147185	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	288939900

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