MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Klebsiella variicola At-22 chromosome

Total Repeats: 175

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013850	TAAGCG	2	12	38068	38079	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_013850	AGGGAG	2	12	87953	87964	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_013850	AGTGAA	2	12	113503	113514	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_013850	CAGGAA	2	12	129426	129437	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_013850	GAGGGG	2	12	155182	155193	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_013850	TTTATC	2	12	171914	171925	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_013850	TTTTTA	2	12	189975	189986	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_013850	AAAGAT	2	12	204983	204994	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_013850	AATAAA	2	12	211641	211652	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_013850	AGCCAC	2	12	253548	253559	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
11	NC_013850	CGCAGG	2	12	282501	282512	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_013850	GAATGA	2	12	324123	324134	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_013850	AAAAAC	2	12	399425	399436	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_013850	AAAAAT	2	12	436191	436202	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_013850	TTTTGT	2	12	447765	447776	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_013850	CAAAAA	2	12	453084	453095	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_013850	GGCAGC	2	12	487353	487364	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_013850	GCACAG	2	12	505390	505401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_013850	AATTTA	2	12	542195	542206	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_013850	ATTAAT	2	12	581477	581488	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_013850	ATCATT	2	12	628002	628013	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_013850	GGATCG	2	12	634285	634296	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_013850	GAAAAG	2	12	647423	647434	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_013850	TACAAC	2	12	652144	652155	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_013850	CGGACT	2	12	713449	713460	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_013850	CGGACT	2	12	713612	713623	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_013850	AGATAC	2	12	747283	747294	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_013850	TAGCAA	2	12	830456	830467	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_013850	CTTTTT	2	12	838376	838387	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_013850	GATCGC	2	12	842202	842213	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_013850	GTTAAC	2	12	842225	842236	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_013850	GCTTAC	2	12	971175	971186	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_013850	TATTGA	2	12	998952	998963	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_013850	GTGATG	2	12	1000366	1000377	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_013850	AGAAGG	2	12	1000676	1000687	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_013850	ATGTCG	2	12	1055862	1055873	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_013850	CACTGA	2	12	1087957	1087968	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_013850	GGCTGC	2	12	1147312	1147323	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_013850	GCGACT	2	12	1150493	1150504	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_013850	ATTAGA	2	12	1167496	1167507	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_013850	ATCGCG	2	12	1194792	1194803	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_013850	AGCGCC	2	12	1324801	1324812	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
43	NC_013850	GTGGCT	2	12	1342129	1342140	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_013850	TCTCCC	2	12	1354101	1354112	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
45	NC_013850	GCACTT	2	12	1367626	1367637	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_013850	GTTTTT	2	12	1376464	1376475	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_013850	TTTTCT	2	12	1428261	1428272	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_013850	TTAATG	2	12	1451960	1451971	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_013850	GGATTG	2	12	1464050	1464061	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_013850	GGCCCT	2	12	1476533	1476544	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
51	NC_013850	TGTCGC	2	12	1518427	1518438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_013850	ACGAGA	2	12	1544061	1544072	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_013850	CGCGCC	2	12	1550737	1550748	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
54	NC_013850	ACTTTC	2	12	1567106	1567117	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_013850	ATTGTT	2	12	1664648	1664659	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_013850	CTCATT	2	12	1665437	1665448	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_013850	TCCCTC	2	12	1710183	1710194	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
58	NC_013850	AGGGAG	2	12	1724989	1725000	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_013850	GCAGCC	2	12	1734694	1734705	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
60	NC_013850	CGAATC	2	12	1741947	1741958	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_013850	AGTATC	2	12	1760730	1760741	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_013850	GCAGCG	2	12	1794017	1794028	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_013850	CGCAAG	2	12	1881232	1881243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_013850	ATTCTG	2	12	1895255	1895266	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_013850	TAAAAA	2	12	1952310	1952321	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_013850	CTTATT	2	12	1955727	1955738	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_013850	CGGGCG	2	12	2009668	2009679	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_013850	ATTTGC	2	12	2026990	2027001	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_013850	TTATAA	2	12	2075072	2075083	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_013850	TTATTT	2	12	2183695	2183706	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_013850	CCCTTT	2	12	2204967	2204978	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
72	NC_013850	TTTGTT	2	12	2212927	2212938	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_013850	AAAGGA	2	12	2213170	2213181	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_013850	GCATAA	2	12	2244388	2244399	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_013850	GGAAGG	2	12	2286145	2286156	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_013850	GGAAGG	2	12	2286280	2286291	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
77	NC_013850	GGAAGG	2	12	2286414	2286425	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
78	NC_013850	CGGCAG	2	12	2300899	2300910	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_013850	ATGACG	2	12	2303281	2303292	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_013850	TGATGC	2	12	2308877	2308888	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_013850	CTTACA	2	12	2328298	2328309	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_013850	ATTTAT	2	12	2367251	2367262	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_013850	AAAGGG	2	12	2387148	2387159	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
84	NC_013850	GCGCTG	2	12	2436577	2436588	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_013850	CTTTTT	2	12	2437986	2437997	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_013850	TTTTCA	2	12	2441523	2441534	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_013850	AACATA	2	12	2471266	2471277	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_013850	GTGAGC	2	12	2495089	2495100	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_013850	CGCAGC	2	12	2510092	2510103	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
90	NC_013850	CGGGCA	2	12	2510219	2510230	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_013850	TCATTT	2	12	2571962	2571973	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_013850	AATGAC	2	12	2576303	2576314	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_013850	GAGGGT	2	12	2606974	2606985	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
94	NC_013850	TGAGCA	2	12	2615087	2615098	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_013850	TGTAAT	2	12	2674795	2674806	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
96	NC_013850	CCTGAA	2	12	2785721	2785732	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_013850	CGCCAG	2	12	2791695	2791706	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
98	NC_013850	ATCCTG	2	12	2894585	2894596	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_013850	TGGTTT	2	12	2919783	2919794	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_013850	GCACTG	2	12	2964728	2964739	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_013850	AGGGAG	2	12	2997815	2997826	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_013850	CCGCCT	2	12	3047716	3047727	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
103	NC_013850	GCTGCG	2	12	3050365	3050376	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_013850	AAGAGC	2	12	3056856	3056867	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
105	NC_013850	CCCTGC	2	12	3207973	3207984	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
106	NC_013850	CTTTCC	2	12	3210367	3210378	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
107	NC_013850	CAACCA	2	12	3234742	3234753	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
108	NC_013850	TCCCTC	2	12	3241464	3241475	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
109	NC_013850	TGAAAA	2	12	3302796	3302807	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
110	NC_013850	CTTATT	2	12	3351858	3351869	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
111	NC_013850	TGCAGC	2	12	3362115	3362126	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_013850	TCCCCT	2	12	3362211	3362222	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
113	NC_013850	GCTTTA	2	12	3445180	3445191	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
114	NC_013850	AGGTGA	2	12	3525353	3525364	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
115	NC_013850	GGAGAT	2	12	3635617	3635628	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
116	NC_013850	CACGTC	2	12	3660447	3660458	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
117	NC_013850	TTAATC	2	12	3708322	3708333	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
118	NC_013850	TCCCTC	2	12	3737750	3737761	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
119	NC_013850	AAACAA	2	12	3779070	3779081	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
120	NC_013850	ATTTTC	2	12	3781336	3781347	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
121	NC_013850	AAGCGC	2	12	3816134	3816145	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_013850	TGAGCA	2	12	3863096	3863107	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
123	NC_013850	TTATCA	2	12	3882874	3882885	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
124	NC_013850	GCCCGG	2	12	3928910	3928921	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
125	NC_013850	AGGGAG	2	12	3931324	3931335	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
126	NC_013850	CGATAA	2	12	3950026	3950037	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
127	NC_013850	TATCAT	2	12	3950042	3950053	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
128	NC_013850	ATTTGC	2	12	3958329	3958340	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
129	NC_013850	TCTCCC	2	12	4023394	4023405	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
130	NC_013850	CCAGTA	2	12	4026755	4026766	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_013850	CGTGAG	2	12	4046465	4046476	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
132	NC_013850	TCTCCC	2	12	4052325	4052336	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
133	NC_013850	GCAAAC	2	12	4092588	4092599	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_013850	CGGCCG	2	12	4200668	4200679	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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139	NC_013850	TTTAAT	2	12	4309413	4309424	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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142	NC_013850	CTGGCG	2	12	4480523	4480534	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.