MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Ferroglobus placidus DSM 10642 chromosome

Total Repeats: 93

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013849	TATCTC	2	12	54510	54521	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_013849	TTCCTA	2	12	93646	93657	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_013849	ATTAAA	2	12	137430	137441	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_013849	AGAAGC	2	12	161382	161393	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_013849	AAGCTT	2	12	200732	200743	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_013849	CCATCC	2	12	201403	201414	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7	NC_013849	TTTGCC	2	12	207772	207783	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_013849	AATTTG	2	12	209676	209687	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_013849	GTTTCG	2	12	227387	227398	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_013849	AAGAAT	2	12	288022	288033	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_013849	AAATTG	2	12	343206	343217	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_013849	TTTGGT	2	12	365089	365100	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_013849	ATGATT	2	12	379970	379981	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_013849	ATTTGT	2	12	387051	387062	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_013849	TCACCT	2	12	390040	390051	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_013849	GCAACA	2	12	390406	390417	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_013849	CCACAC	2	12	390443	390454	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18	NC_013849	TGAGAT	2	12	412444	412455	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_013849	ATTTTA	2	12	412553	412564	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_013849	CTTTGC	2	12	426723	426734	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_013849	CTAAAC	2	12	431036	431047	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_013849	CATCAA	2	12	432516	432527	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_013849	TCAACC	2	12	432532	432543	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_013849	GCAACT	2	12	432896	432907	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_013849	GCCGTT	2	12	436381	436392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_013849	TGAATT	3	18	449490	449507	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_013849	TTTGAT	2	12	466048	466059	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_013849	CTATAA	2	12	466427	466438	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_013849	ATTTTT	2	12	489015	489026	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_013849	TTCTCC	2	12	500471	500482	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_013849	AACAAA	2	12	504918	504929	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_013849	CTGTTT	2	12	506937	506948	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_013849	AACAAA	2	12	574752	574763	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_013849	ATTTTT	2	12	700113	700124	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_013849	TTAGTT	2	12	755397	755408	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_013849	AAAATT	2	12	755513	755524	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_013849	ATCTTT	2	12	793522	793533	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_013849	AATAAA	2	12	811996	812007	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_013849	ATTTTC	2	12	884235	884246	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_013849	AAAAAG	2	12	927836	927847	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_013849	AGCATA	2	12	931105	931116	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_013849	AGCATA	2	12	936948	936959	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_013849	TTTCTA	2	12	948318	948329	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_013849	TTCTTT	2	12	977668	977679	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_013849	AAATAT	2	12	1008106	1008117	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_013849	TTTTTC	2	12	1031215	1031226	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_013849	ATTTTT	2	12	1035339	1035350	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_013849	ACTAAG	2	12	1048214	1048225	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_013849	AGAGCA	2	12	1139099	1139110	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_013849	TAAAAA	2	12	1139722	1139733	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_013849	ACTATC	2	12	1147323	1147334	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_013849	ATTTTT	2	12	1147358	1147369	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_013849	TTTTAT	2	12	1166304	1166315	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_013849	ACATCT	2	12	1177274	1177285	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_013849	TGGCGT	2	12	1200426	1200437	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_013849	TATTTT	2	12	1232471	1232482	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_013849	GCTGAG	2	12	1455000	1455011	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_013849	GAATTT	2	12	1554643	1554654	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_013849	ATTTTT	2	12	1555805	1555816	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_013849	CTGAAA	2	12	1566351	1566362	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_013849	ATATCG	2	12	1612397	1612408	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_013849	GAAAAA	2	12	1628763	1628774	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_013849	TAAAAA	2	12	1665041	1665052	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_013849	TTTTAT	2	12	1767474	1767485	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_013849	ATTAAC	2	12	1767533	1767544	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_013849	AAATAT	2	12	1777232	1777243	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_013849	AGAAAC	2	12	1783742	1783753	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_013849	ATTTTT	2	12	1796388	1796399	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_013849	AGTTTA	2	12	1833285	1833296	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_013849	TTAAGG	2	12	1859968	1859979	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_013849	CCTCCA	2	12	1881906	1881917	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
72	NC_013849	TCGCTT	2	12	1908534	1908545	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_013849	AAAATT	2	12	1910891	1910902	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_013849	TTTAGC	2	12	1940600	1940611	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_013849	AAAATA	2	12	1954372	1954383	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_013849	GATAAA	2	12	1958632	1958643	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
77	NC_013849	TCCGGG	2	12	1974018	1974029	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_013849	AATCCA	2	12	1993284	1993295	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_013849	ACTCCC	2	12	1993457	1993468	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
80	NC_013849	CGGAGG	2	12	2001781	2001792	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_013849	TTTTAT	2	12	2011989	2012000	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_013849	TATAAA	2	12	2018690	2018701	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_013849	AAATTT	2	12	2035021	2035032	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_013849	TATTGA	2	12	2048430	2048441	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
85	NC_013849	TTTCGA	2	12	2058225	2058236	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_013849	AATAAA	2	12	2108723	2108734	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_013849	AACTTT	2	12	2112369	2112380	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_013849	TAAATT	2	12	2125436	2125447	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_013849	GACACA	2	12	2138107	2138118	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_013849	AAATTT	2	12	2152638	2152649	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_013849	TTCAAG	2	12	2164430	2164441	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_013849	GTCCTC	2	12	2173344	2173355	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
93	NC_013849	TGTATT	2	12	2173443	2173454	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.