MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Hydrogenobacter thermophilus TK-6

Total Repeats: 1293

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013799	TTTTC	2	10	2694	2703	0 %	80 %	0 %	20 %	288817324
2	NC_013799	TAAAG	2	10	5338	5347	60 %	20 %	20 %	0 %	288817328
3	NC_013799	AACCA	2	10	6391	6400	60 %	0 %	0 %	40 %	288817328
4	NC_013799	TTTCT	2	10	9688	9697	0 %	80 %	0 %	20 %	288817332
5	NC_013799	CATAA	2	10	10079	10088	60 %	20 %	0 %	20 %	288817333
6	NC_013799	GGGAT	2	10	10681	10690	20 %	20 %	60 %	0 %	288817334
7	NC_013799	ATTTC	2	10	12980	12989	20 %	60 %	0 %	20 %	288817336
8	NC_013799	TTTTG	2	10	13058	13067	0 %	80 %	20 %	0 %	288817336
9	NC_013799	TTTAA	2	10	13463	13472	40 %	60 %	0 %	0 %	288817336
10	NC_013799	TCTTA	2	10	13555	13564	20 %	60 %	0 %	20 %	288817336
11	NC_013799	CTCTT	2	10	13726	13735	0 %	60 %	0 %	40 %	288817336
12	NC_013799	TATTT	2	10	16482	16491	20 %	80 %	0 %	0 %	288817338
13	NC_013799	GAATA	2	10	16675	16684	60 %	20 %	20 %	0 %	288817339
14	NC_013799	TTAAA	2	10	18833	18842	60 %	40 %	0 %	0 %	288817340
15	NC_013799	AAACA	2	10	19158	19167	80 %	0 %	0 %	20 %	288817340
16	NC_013799	TTCCT	2	10	21059	21068	0 %	60 %	0 %	40 %	288817341
17	NC_013799	AAAAG	2	10	22719	22728	80 %	0 %	20 %	0 %	288817344
18	NC_013799	TTACC	2	10	30557	30566	20 %	40 %	0 %	40 %	288817348
19	NC_013799	GAAGC	2	10	30604	30613	40 %	0 %	40 %	20 %	288817349
20	NC_013799	CTTAG	2	10	30807	30816	20 %	40 %	20 %	20 %	288817349
21	NC_013799	CCTTA	2	10	32386	32395	20 %	40 %	0 %	40 %	288817350
22	NC_013799	CCTCA	2	10	32590	32599	20 %	20 %	0 %	60 %	288817350
23	NC_013799	CTCGT	2	10	33451	33460	0 %	40 %	20 %	40 %	288817351
24	NC_013799	GAGCT	2	10	34223	34232	20 %	20 %	40 %	20 %	288817352
25	NC_013799	TGGTT	2	10	34378	34387	0 %	60 %	40 %	0 %	288817352
26	NC_013799	CATCT	2	10	34749	34758	20 %	40 %	0 %	40 %	288817352
27	NC_013799	ATATA	2	10	35831	35840	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_013799	CTTCT	2	10	37393	37402	0 %	60 %	0 %	40 %	288817354
29	NC_013799	CTGAG	2	10	38729	38738	20 %	20 %	40 %	20 %	288817354
30	NC_013799	GTAAA	2	10	42826	42835	60 %	20 %	20 %	0 %	288817358
31	NC_013799	ACCTG	2	10	43056	43065	20 %	20 %	20 %	40 %	288817359
32	NC_013799	TCCCC	2	10	45746	45755	0 %	20 %	0 %	80 %	288817361
33	NC_013799	TGTCT	2	10	47824	47833	0 %	60 %	20 %	20 %	288817361
34	NC_013799	CCTTC	2	10	48679	48688	0 %	40 %	0 %	60 %	288817362
35	NC_013799	CTTCT	2	10	49201	49210	0 %	60 %	0 %	40 %	288817362
36	NC_013799	AAGGC	2	10	49748	49757	40 %	0 %	40 %	20 %	288817363
37	NC_013799	GGCAG	2	10	50286	50295	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
38	NC_013799	GACAG	2	10	55085	55094	40 %	0 %	40 %	20 %	288817367
39	NC_013799	CACTT	2	10	56319	56328	20 %	40 %	0 %	40 %	288817369
40	NC_013799	AGCAT	2	10	56443	56452	40 %	20 %	20 %	20 %	288817369
41	NC_013799	CCTTA	2	10	56682	56691	20 %	40 %	0 %	40 %	288817369
42	NC_013799	ACACC	2	10	56899	56908	40 %	0 %	0 %	60 %	288817370
43	NC_013799	CTGCT	2	10	58627	58636	0 %	40 %	20 %	40 %	288817372
44	NC_013799	TGGTA	2	10	59093	59102	20 %	40 %	40 %	0 %	288817372
45	NC_013799	AGGTT	2	10	60731	60740	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
46	NC_013799	ATCTT	2	10	61816	61825	20 %	60 %	0 %	20 %	288817375
47	NC_013799	TGTGG	2	10	62156	62165	0 %	40 %	60 %	0 %	288817375
48	NC_013799	TCTTT	2	10	63575	63584	0 %	80 %	0 %	20 %	288817377
49	NC_013799	AAGTA	2	10	64909	64918	60 %	20 %	20 %	0 %	288817380
50	NC_013799	ACAAA	2	10	65040	65049	80 %	0 %	0 %	20 %	288817380
51	NC_013799	TATGG	2	10	66203	66212	20 %	40 %	40 %	0 %	288817380
52	NC_013799	GAAAA	2	10	67077	67086	80 %	0 %	20 %	0 %	288817382
53	NC_013799	TCTTT	2	10	70181	70190	0 %	80 %	0 %	20 %	288817385
54	NC_013799	CCCTT	2	10	71902	71911	0 %	40 %	0 %	60 %	288817388
55	NC_013799	GCCAA	2	10	72446	72455	40 %	0 %	20 %	40 %	288817389
56	NC_013799	TCCTC	2	10	74447	74456	0 %	40 %	0 %	60 %	288817391
57	NC_013799	GCACA	2	10	78550	78559	40 %	0 %	20 %	40 %	288817396
58	NC_013799	AAAAG	2	10	78564	78573	80 %	0 %	20 %	0 %	288817396
59	NC_013799	TATAT	2	10	79373	79382	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_013799	TTTAA	2	10	79467	79476	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_013799	TGGAA	2	10	79824	79833	40 %	20 %	40 %	0 %	288817398
62	NC_013799	GAAAA	2	10	79958	79967	80 %	0 %	20 %	0 %	288817398
63	NC_013799	GCTTT	2	10	84591	84600	0 %	60 %	20 %	20 %	288817402
64	NC_013799	TGGAT	2	10	85023	85032	20 %	40 %	40 %	0 %	288817402
65	NC_013799	GCTAC	2	10	86162	86171	20 %	20 %	20 %	40 %	288817403
66	NC_013799	TGCTC	2	10	88579	88588	0 %	40 %	20 %	40 %	288817407
67	NC_013799	CTCTC	2	10	93866	93875	0 %	40 %	0 %	60 %	288817410
68	NC_013799	AACTA	2	10	94307	94316	60 %	20 %	0 %	20 %	288817411
69	NC_013799	ACTCT	2	10	94810	94819	20 %	40 %	0 %	40 %	288817411
70	NC_013799	ACTGC	2	10	95098	95107	20 %	20 %	20 %	40 %	288817411
71	NC_013799	AAGGA	2	10	97220	97229	60 %	0 %	40 %	0 %	288817413
72	NC_013799	TACAC	2	10	100534	100543	40 %	20 %	0 %	40 %	288817416
73	NC_013799	TGCCT	2	10	101130	101139	0 %	40 %	20 %	40 %	288817416
74	NC_013799	GTCCT	2	10	105436	105445	0 %	40 %	20 %	40 %	288817420
75	NC_013799	AAGCT	2	10	105634	105643	40 %	20 %	20 %	20 %	288817420
76	NC_013799	TCTTT	2	10	105665	105674	0 %	80 %	0 %	20 %	288817420
77	NC_013799	CAAAA	2	10	105704	105713	80 %	0 %	0 %	20 %	288817420
78	NC_013799	ACCTC	2	10	106770	106779	20 %	20 %	0 %	60 %	288817423
79	NC_013799	CTTCT	2	10	107316	107325	0 %	60 %	0 %	40 %	288817423
80	NC_013799	ATCCT	2	10	109680	109689	20 %	40 %	0 %	40 %	288817424
81	NC_013799	CAGTC	2	10	110702	110711	20 %	20 %	20 %	40 %	288817425
82	NC_013799	TATTT	2	10	111685	111694	20 %	80 %	0 %	0 %	288817426
83	NC_013799	CCCTT	2	10	118243	118252	0 %	40 %	0 %	60 %	288817433
84	NC_013799	TGATA	2	10	119418	119427	40 %	40 %	20 %	0 %	288817435
85	NC_013799	GCCAT	2	10	122165	122174	20 %	20 %	20 %	40 %	288817438
86	NC_013799	AAAGC	2	10	130285	130294	60 %	0 %	20 %	20 %	288817446
87	NC_013799	CCCCT	2	10	132322	132331	0 %	20 %	0 %	80 %	288817448
88	NC_013799	TATAC	2	10	134372	134381	40 %	40 %	0 %	20 %	288817451
89	NC_013799	CTGTG	2	10	135163	135172	0 %	40 %	40 %	20 %	288817452
90	NC_013799	TACAT	2	10	135580	135589	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
91	NC_013799	AGTAG	2	10	137116	137125	40 %	20 %	40 %	0 %	288817455
92	NC_013799	AAAAG	2	10	139627	139636	80 %	0 %	20 %	0 %	288817457
93	NC_013799	AGAAA	2	10	139688	139697	80 %	0 %	20 %	0 %	288817457
94	NC_013799	TCATC	2	10	140176	140185	20 %	40 %	0 %	40 %	288817458
95	NC_013799	AGAGG	2	10	142444	142453	40 %	0 %	60 %	0 %	288817459
96	NC_013799	GAGCA	2	10	144310	144319	40 %	0 %	40 %	20 %	288817461
97	NC_013799	AATGA	2	10	145397	145406	60 %	20 %	20 %	0 %	288817463
98	NC_013799	TCCCA	2	10	145946	145955	20 %	20 %	0 %	60 %	288817464
99	NC_013799	AGCTA	2	10	146053	146062	40 %	20 %	20 %	20 %	288817464
100	NC_013799	GTTGG	2	10	146526	146535	0 %	40 %	60 %	0 %	288817464
101	NC_013799	TCCTC	2	10	148048	148057	0 %	40 %	0 %	60 %	288817465
102	NC_013799	GAGGG	2	10	149356	149365	20 %	0 %	80 %	0 %	288817465
103	NC_013799	GCTTA	2	10	150662	150671	20 %	40 %	20 %	20 %	288817465
104	NC_013799	TAGCT	2	10	153903	153912	20 %	40 %	20 %	20 %	288817468
105	NC_013799	TCCTC	2	10	155847	155856	0 %	40 %	0 %	60 %	288817470
106	NC_013799	GAGCA	2	10	156107	156116	40 %	0 %	40 %	20 %	288817470
107	NC_013799	CATCC	2	10	156776	156785	20 %	20 %	0 %	60 %	288817471
108	NC_013799	CATCA	2	10	157963	157972	40 %	20 %	0 %	40 %	288817472
109	NC_013799	TTACC	2	10	158451	158460	20 %	40 %	0 %	40 %	288817472
110	NC_013799	AAGCT	2	10	159019	159028	40 %	20 %	20 %	20 %	288817473
111	NC_013799	CTTCC	2	10	159645	159654	0 %	40 %	0 %	60 %	288817473
112	NC_013799	TGGAG	2	10	161132	161141	20 %	20 %	60 %	0 %	288817474
113	NC_013799	GAAGA	2	10	163731	163740	60 %	0 %	40 %	0 %	288817477
114	NC_013799	GGCTT	2	10	164594	164603	0 %	40 %	40 %	20 %	288817478
115	NC_013799	GAAAA	2	10	164637	164646	80 %	0 %	20 %	0 %	288817478
116	NC_013799	TGAAG	2	10	166717	166726	40 %	20 %	40 %	0 %	288817481
117	NC_013799	AGAGG	2	10	171596	171605	40 %	0 %	60 %	0 %	288817486
118	NC_013799	AGGCA	2	10	172587	172596	40 %	0 %	40 %	20 %	288817487
119	NC_013799	TGCCA	2	10	172849	172858	20 %	20 %	20 %	40 %	288817487
120	NC_013799	GAAAG	2	10	174151	174160	60 %	0 %	40 %	0 %	288817488
121	NC_013799	AAAAG	2	10	176334	176343	80 %	0 %	20 %	0 %	288817490
122	NC_013799	CTCTA	2	10	176749	176758	20 %	40 %	0 %	40 %	288817491
123	NC_013799	TGATG	2	10	176809	176818	20 %	40 %	40 %	0 %	288817491
124	NC_013799	ATAGC	2	10	179137	179146	40 %	20 %	20 %	20 %	288817494
125	NC_013799	GCACA	2	10	182090	182099	40 %	0 %	20 %	40 %	288817497
126	NC_013799	AGCTG	2	10	186127	186136	20 %	20 %	40 %	20 %	288817501
127	NC_013799	CTATC	2	10	186620	186629	20 %	40 %	0 %	40 %	288817502
128	NC_013799	GCCTT	2	10	188099	188108	0 %	40 %	20 %	40 %	288817505
129	NC_013799	CTTCT	2	10	188772	188781	0 %	60 %	0 %	40 %	288817506
130	NC_013799	GTCCC	2	10	190875	190884	0 %	20 %	20 %	60 %	288817508
131	NC_013799	GCCTT	2	10	191065	191074	0 %	40 %	20 %	40 %	288817508
132	NC_013799	CAGCA	2	10	191666	191675	40 %	0 %	20 %	40 %	288817508
133	NC_013799	AAAGC	2	10	195236	195245	60 %	0 %	20 %	20 %	288817513
134	NC_013799	AAAAG	2	10	198974	198983	80 %	0 %	20 %	0 %	288817515
135	NC_013799	AAGGC	2	10	199782	199791	40 %	0 %	40 %	20 %	288817518
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