MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Hydrogenobacter thermophilus TK-6

Total Repeats: 219

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013799	TA	3	6	3689	3694	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_013799	TA	3	6	11899	11904	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_013799	AG	3	6	11946	11951	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_013799	TA	3	6	23879	23884	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_013799	TA	3	6	38893	38898	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_013799	CT	3	6	50274	50279	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_013799	TA	3	6	57495	57500	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_013799	TA	3	6	57792	57797	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_013799	TA	3	6	60681	60686	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_013799	CA	3	6	64265	64270	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_013799	AT	4	8	74371	74378	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_013799	AT	3	6	75811	75816	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_013799	AT	3	6	78477	78482	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_013799	TC	3	6	85792	85797	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_013799	AT	3	6	92643	92648	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_013799	TA	3	6	96426	96431	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_013799	TA	3	6	96434	96439	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_013799	TA	3	6	142909	142914	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_013799	TC	3	6	174226	174231	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
20	NC_013799	AT	3	6	194205	194210	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_013799	AC	3	6	197015	197020	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_013799	GT	3	6	229379	229384	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_013799	AG	3	6	229552	229557	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_013799	AT	3	6	238205	238210	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_013799	GA	3	6	242901	242906	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_013799	GA	3	6	246703	246708	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_013799	GT	3	6	246911	246916	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_013799	CT	3	6	249963	249968	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_013799	CT	3	6	269266	269271	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_013799	GT	3	6	277676	277681	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_013799	AG	4	8	282451	282458	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_013799	TG	3	6	294560	294565	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_013799	GT	3	6	295907	295912	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_013799	AT	3	6	307387	307392	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_013799	GA	3	6	321244	321249	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_013799	AG	3	6	321276	321281	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_013799	CT	3	6	321419	321424	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_013799	TC	3	6	321500	321505	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_013799	CT	3	6	321790	321795	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
40	NC_013799	CT	3	6	322226	322231	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_013799	CT	3	6	322343	322348	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_013799	AG	3	6	328342	328347	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_013799	AT	3	6	336920	336925	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_013799	AT	3	6	338269	338274	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_013799	CT	4	8	353056	353063	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
46	NC_013799	TC	3	6	353111	353116	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
47	NC_013799	TA	5	10	353264	353273	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_013799	GA	4	8	383882	383889	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_013799	AG	4	8	384094	384101	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_013799	TC	3	6	385468	385473	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
51	NC_013799	AT	3	6	391011	391016	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_013799	TA	4	8	397056	397063	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_013799	TG	3	6	399170	399175	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_013799	TG	3	6	399677	399682	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_013799	AG	3	6	399787	399792	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_013799	CT	4	8	400104	400111	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
57	NC_013799	AG	3	6	433031	433036	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_013799	AG	3	6	436810	436815	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_013799	AT	3	6	463400	463405	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_013799	AT	3	6	506455	506460	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_013799	CA	3	6	507679	507684	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
62	NC_013799	AT	3	6	507723	507728	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_013799	TA	4	8	517961	517968	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_013799	AG	3	6	518391	518396	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_013799	GT	3	6	518582	518587	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_013799	GA	3	6	522644	522649	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_013799	AT	3	6	546942	546947	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_013799	CT	3	6	579637	579642	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
69	NC_013799	CT	3	6	579661	579666	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
70	NC_013799	AT	3	6	582029	582034	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_013799	CT	3	6	587864	587869	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
72	NC_013799	TA	3	6	590188	590193	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_013799	GT	3	6	593914	593919	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_013799	AG	3	6	594072	594077	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_013799	AG	4	8	595410	595417	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_013799	AG	3	6	595431	595436	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_013799	TA	3	6	627136	627141	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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79	NC_013799	AG	3	6	638499	638504	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
80	NC_013799	AG	3	6	639049	639054	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
81	NC_013799	TG	3	6	639118	639123	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
82	NC_013799	GA	3	6	639636	639641	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
83	NC_013799	TC	3	6	643156	643161	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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87	NC_013799	AG	3	6	685889	685894	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
88	NC_013799	CA	3	6	686135	686140	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
89	NC_013799	AT	4	8	697374	697381	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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91	NC_013799	AT	3	6	711112	711117	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_013799	AT	3	6	727612	727617	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_013799	TA	3	6	756502	756507	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_013799	TA	3	6	757100	757105	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_013799	GA	3	6	761975	761980	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
96	NC_013799	TA	3	6	765127	765132	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_013799	TC	3	6	778228	778233	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
98	NC_013799	TA	3	6	779536	779541	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_013799	TA	3	6	803428	803433	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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101	NC_013799	AG	3	6	809690	809695	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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103	NC_013799	AT	3	6	809993	809998	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_013799	TA	3	6	810542	810547	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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108	NC_013799	AG	3	6	852186	852191	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
109	NC_013799	AC	3	6	889279	889284	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
110	NC_013799	CT	3	6	889302	889307	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
111	NC_013799	TG	3	6	889344	889349	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
112	NC_013799	TC	3	6	893593	893598	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
113	NC_013799	AT	3	6	901422	901427	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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115	NC_013799	CT	3	6	909224	909229	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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117	NC_013799	TA	3	6	909484	909489	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_013799	AT	3	6	915771	915776	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_013799	TA	3	6	927166	927171	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_013799	GC	3	6	928555	928560	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
121	NC_013799	CT	3	6	942460	942465	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
122	NC_013799	TA	3	6	942536	942541	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_013799	AT	3	6	943875	943880	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_013799	TA	3	6	958098	958103	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_013799	AT	3	6	959703	959708	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_013799	AT	3	6	962487	962492	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_013799	AT	3	6	962516	962521	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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129	NC_013799	AT	3	6	986084	986089	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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138	NC_013799	GA	4	8	1036697	1036704	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
139	NC_013799	TA	3	6	1036741	1036746	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.