MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Streptococcus gallolyticus UCN34 chromosome

Total Repeats: 112

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013798	TTAGCG	2	12	22097	22108	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_013798	ACTAAT	2	12	23103	23114	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_013798	TTTTTA	2	12	32430	32441	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_013798	AAATAC	2	12	37077	37088	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_013798	TTGAAA	2	12	43245	43256	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_013798	GAAAGG	2	12	48109	48120	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_013798	TAAAAA	2	12	51818	51829	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_013798	TTAGCG	2	12	83109	83120	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_013798	ACTAAT	2	12	84115	84126	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_013798	TTCGGG	2	12	85019	85030	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_013798	ATTACT	2	12	127443	127454	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_013798	TAAAAT	2	12	171280	171291	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_013798	TATCTT	2	12	187191	187202	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_013798	AAAATT	2	12	193644	193655	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_013798	AAATTT	2	12	209726	209737	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_013798	TCTTTT	2	12	222858	222869	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_013798	CTAATA	2	12	229028	229039	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_013798	TGAAAA	2	12	245577	245588	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_013798	TTAGCG	2	12	253724	253735	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_013798	ACTAAT	2	12	254730	254741	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_013798	TTAGCG	2	12	259537	259548	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_013798	ACTAAT	2	12	260543	260554	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_013798	TATTGC	2	12	283040	283051	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_013798	TTAAAA	2	12	291681	291692	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_013798	TCACTT	2	12	327261	327272	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_013798	TTAGCG	2	12	358113	358124	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_013798	ACTAAT	2	12	359119	359130	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_013798	AAATTT	2	12	363627	363638	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_013798	AAAAGA	2	12	363683	363694	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_013798	TATTTA	2	12	366919	366930	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_013798	CAGCAA	2	12	378843	378854	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_013798	GGAATT	2	12	379083	379094	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_013798	TCAAAA	2	12	413786	413797	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_013798	TCCTTT	2	12	415796	415807	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_013798	TTTCAT	2	12	434609	434620	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_013798	GAAAAG	2	12	467244	467255	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_013798	CAAAAA	2	12	494963	494974	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_013798	GCTTTT	2	12	524222	524233	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_013798	TTAGCG	2	12	532706	532717	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_013798	ACTAAT	2	12	533712	533723	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_013798	ATAATT	2	12	565817	565828	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_013798	TAAGCT	2	12	578272	578283	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_013798	TTTTAT	2	12	578726	578737	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_013798	ATGAAC	2	12	592150	592161	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_013798	TATTTT	2	12	603133	603144	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_013798	TTGACA	2	12	637876	637887	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_013798	AAAACA	2	12	679817	679828	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_013798	AATTAA	2	12	690471	690482	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_013798	TTCAGA	2	12	698676	698687	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_013798	AATTTA	2	12	704037	704048	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_013798	CGACAC	2	12	742091	742102	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
52	NC_013798	AATATA	2	12	767421	767432	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_013798	CTATAA	2	12	781370	781381	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_013798	TTTTTA	2	12	797790	797801	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_013798	GCCTTC	2	12	808335	808346	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
56	NC_013798	TTTATT	2	12	831825	831836	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_013798	TAAAAA	2	12	962921	962932	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_013798	TATTTA	2	12	973469	973480	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_013798	TCTGTT	2	12	977074	977085	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_013798	TGACAA	2	12	981203	981214	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_013798	TACCTT	2	12	997486	997497	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_013798	GATAAT	2	12	1007335	1007346	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_013798	TTCGGG	2	12	1032659	1032670	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_013798	AAAAGA	2	12	1059754	1059765	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_013798	TTTAAT	2	12	1222574	1222585	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_013798	CAAAAA	2	12	1288960	1288971	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_013798	AAAAAT	2	12	1375116	1375127	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_013798	CAATTA	2	12	1380631	1380642	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_013798	TTTTAA	2	12	1415409	1415420	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_013798	AAAAAC	2	12	1428817	1428828	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_013798	TTTTAT	2	12	1472985	1472996	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_013798	TTTTCA	2	12	1495533	1495544	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_013798	GAAATT	2	12	1508653	1508664	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
74	NC_013798	ATTTGT	2	12	1515530	1515541	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_013798	TTTTAG	2	12	1523370	1523381	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_013798	ATTTAA	2	12	1533598	1533609	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_013798	ATTAAT	2	12	1603020	1603031	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_013798	ATGATT	3	18	1609911	1609928	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_013798	AATTTT	2	12	1660172	1660183	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_013798	AATGCA	2	12	1704408	1704419	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_013798	TAAAAA	2	12	1807177	1807188	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_013798	TACAAA	2	12	1886238	1886249	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_013798	AAAAGA	2	12	1888611	1888622	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_013798	TTTTCA	2	12	1917904	1917915	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_013798	CATTTA	2	12	1927638	1927649	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_013798	TGAAAA	2	12	1928562	1928573	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_013798	GGAAAA	2	12	1940998	1941009	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_013798	GTTTCA	2	12	1959681	1959692	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_013798	TACATT	2	12	1968208	1968219	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_013798	AATTTC	2	12	1990446	1990457	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_013798	GGAAGG	2	12	2005882	2005893	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
92	NC_013798	TAAAAG	2	12	2013450	2013461	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_013798	CTATTT	2	12	2052739	2052750	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_013798	TATTTT	2	12	2082259	2082270	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_013798	TAAATC	2	12	2082771	2082782	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_013798	TATTTT	2	12	2110170	2110181	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_013798	AATTAA	2	12	2121546	2121557	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_013798	CAAAAA	2	12	2138112	2138123	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_013798	CTCTAC	2	12	2138164	2138175	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
100	NC_013798	CACAAC	2	12	2142801	2142812	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
101	NC_013798	TTTTAA	2	12	2153132	2153143	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_013798	AAATAT	2	12	2170787	2170798	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_013798	GTTTTA	2	12	2179630	2179641	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
104	NC_013798	AAAAGA	2	12	2203495	2203506	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
105	NC_013798	ACCGAA	2	12	2214200	2214211	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_013798	TTGGCT	2	12	2243396	2243407	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
107	NC_013798	TTTTGC	2	12	2250088	2250099	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
108	NC_013798	TTCCTT	2	12	2262122	2262133	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_013798	ATTTTC	2	12	2274672	2274683	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
110	NC_013798	TAAAAA	2	12	2274764	2274775	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_013798	ACAAAA	2	12	2291697	2291708	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
112	NC_013798	AATGAA	2	12	2350047	2350058	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.