MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Streptococcus gallolyticus UCN34 chromosome

Total Repeats: 368

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013798	CTTTT	2	10	2873	2882	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_013798	GGAAA	2	10	5353	5362	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
3	NC_013798	TCGTG	2	10	19488	19497	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
4	NC_013798	GTTAA	2	10	20236	20245	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
5	NC_013798	GGGAG	2	10	20754	20763	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
6	NC_013798	AGGGA	2	10	22962	22971	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
7	NC_013798	ATGGA	2	10	24755	24764	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
8	NC_013798	ATGAC	2	10	37045	37054	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
9	NC_013798	CTTTA	2	10	43222	43231	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
10	NC_013798	TGAAC	2	10	48121	48130	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
11	NC_013798	ATATT	2	10	51364	51373	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_013798	AAAAG	2	10	51763	51772	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
13	NC_013798	ATTTT	2	10	62901	62910	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_013798	AAGGA	2	10	69675	69684	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
15	NC_013798	AAAAT	2	10	74872	74881	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_013798	TCGTG	2	10	80500	80509	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
17	NC_013798	GTTAA	2	10	81248	81257	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
18	NC_013798	GGGAG	2	10	81766	81775	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
19	NC_013798	AGGGA	2	10	83974	83983	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
20	NC_013798	AATGA	2	10	86795	86804	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
21	NC_013798	AGCTA	2	10	90153	90162	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
22	NC_013798	GTAAA	2	10	106882	106891	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
23	NC_013798	GTAAA	2	10	108487	108496	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
24	NC_013798	CCTTC	2	10	112114	112123	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
25	NC_013798	TAATC	2	10	113208	113217	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
26	NC_013798	AAATA	2	10	131063	131072	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_013798	TTATA	2	10	134026	134035	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_013798	TTTTA	2	10	137818	137827	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_013798	ATGAA	2	10	137844	137853	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
30	NC_013798	ATTTG	2	10	143200	143209	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
31	NC_013798	TAAAA	2	10	146046	146055	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_013798	GAAGT	2	10	159052	159061	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
33	NC_013798	AACAT	2	10	159217	159226	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
34	NC_013798	AAAAG	2	10	161010	161019	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
35	NC_013798	TATTC	2	10	161099	161108	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
36	NC_013798	GTTAA	2	10	162295	162304	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
37	NC_013798	AAGGA	2	10	166041	166050	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
38	NC_013798	ATTGA	2	10	167185	167194	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
39	NC_013798	ATCTA	2	10	192592	192601	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
40	NC_013798	TTGAT	2	10	196446	196455	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
41	NC_013798	TTTCA	2	10	199937	199946	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
42	NC_013798	AACTT	2	10	206247	206256	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
43	NC_013798	AAAAT	2	10	206506	206515	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_013798	TAAAA	2	10	214606	214615	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_013798	TTGAT	2	10	230636	230645	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
46	NC_013798	AAAAT	2	10	238663	238672	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_013798	TCGTG	2	10	251115	251124	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
48	NC_013798	GTTAA	2	10	251863	251872	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
49	NC_013798	GGGAG	2	10	252381	252390	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
50	NC_013798	AGGGA	2	10	254589	254598	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
51	NC_013798	TCGTG	2	10	256928	256937	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
52	NC_013798	GTTAA	2	10	257676	257685	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
53	NC_013798	GGGAG	2	10	258194	258203	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
54	NC_013798	AGGGA	2	10	260402	260411	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
55	NC_013798	TAAAC	2	10	274925	274934	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
56	NC_013798	GCAGA	2	10	280077	280086	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
57	NC_013798	GAGAG	2	10	286924	286933	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
58	NC_013798	ACAGC	2	10	287621	287630	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
59	NC_013798	AAATG	2	10	291635	291644	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
60	NC_013798	CAACA	2	10	304900	304909	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
61	NC_013798	AGCAA	2	10	308971	308980	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
62	NC_013798	TTTGT	2	10	323116	323125	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
63	NC_013798	TTTAT	2	10	325446	325455	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_013798	TAAAA	2	10	329574	329583	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_013798	GAAAT	2	10	332082	332091	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
66	NC_013798	TCGTG	2	10	355504	355513	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
67	NC_013798	GTTAA	2	10	356252	356261	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
68	NC_013798	GGGAG	2	10	356770	356779	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
69	NC_013798	AGGGA	2	10	358978	358987	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
70	NC_013798	ATAAA	2	10	368314	368323	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_013798	AGGTA	2	10	378441	378450	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
72	NC_013798	ATTAA	2	10	381482	381491	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_013798	TTTAT	2	10	391013	391022	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_013798	GGGAT	2	10	406116	406125	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
75	NC_013798	GGAAA	2	10	407259	407268	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
76	NC_013798	CTAGT	2	10	409802	409811	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
77	NC_013798	TGATT	2	10	413012	413021	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
78	NC_013798	AAAAT	2	10	413082	413091	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_013798	ATATA	2	10	417866	417875	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_013798	TTTTA	2	10	445570	445579	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_013798	GAAAA	2	10	446562	446571	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
82	NC_013798	TATAA	2	10	449618	449627	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_013798	CAAAC	2	10	449638	449647	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
84	NC_013798	TTTTC	2	10	467092	467101	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
85	NC_013798	TTTTC	2	10	467125	467134	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
86	NC_013798	GAAAA	2	10	467659	467668	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
87	NC_013798	TTATA	2	10	469147	469156	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_013798	CAGGT	2	10	469716	469725	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
89	NC_013798	TATAT	2	10	495868	495877	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_013798	ATATA	2	10	522319	522328	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_013798	TTTCC	2	10	522413	522422	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
92	NC_013798	TCGTG	2	10	530097	530106	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
93	NC_013798	GTTAA	2	10	530845	530854	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
94	NC_013798	GGGAG	2	10	531363	531372	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
95	NC_013798	AGGGA	2	10	533571	533580	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
96	NC_013798	TATTT	2	10	534545	534554	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_013798	GCTGT	2	10	534656	534665	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
98	NC_013798	TAGTA	2	10	534801	534810	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
99	NC_013798	AAGCC	2	10	546467	546476	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
100	NC_013798	TATCC	2	10	547315	547324	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
101	NC_013798	TAAAA	2	10	548709	548718	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_013798	AATTT	2	10	555540	555549	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_013798	ATAAA	2	10	574856	574865	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_013798	CATTG	2	10	578341	578350	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
105	NC_013798	ATTTT	2	10	578699	578708	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_013798	CTTGT	2	10	588100	588109	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
107	NC_013798	TATGG	2	10	597894	597903	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
108	NC_013798	ATAAA	2	10	602837	602846	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_013798	CTAAT	2	10	603039	603048	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
110	NC_013798	GTAAA	2	10	615652	615661	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
111	NC_013798	AATTG	2	10	621140	621149	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
112	NC_013798	GATAG	2	10	656983	656992	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
113	NC_013798	TAGTG	2	10	662962	662971	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
114	NC_013798	AGCAC	2	10	668869	668878	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
115	NC_013798	AAAAG	2	10	679866	679875	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
116	NC_013798	TAATA	2	10	715145	715154	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_013798	AATCA	2	10	716314	716323	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
118	NC_013798	GGGGT	2	10	717536	717545	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
119	NC_013798	TCAAA	2	10	738355	738364	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
120	NC_013798	TCACC	2	10	743444	743453	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
121	NC_013798	GTTGT	2	10	746121	746130	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
122	NC_013798	TAAAA	2	10	749143	749152	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_013798	TCTTT	2	10	761301	761310	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
124	NC_013798	TAAAA	2	10	767239	767248	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_013798	ATATC	2	10	775091	775100	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
126	NC_013798	AGAAA	2	10	775407	775416	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
127	NC_013798	TAGCT	2	10	777628	777637	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
128	NC_013798	AATAA	2	10	788271	788280	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_013798	AACTT	2	10	811794	811803	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
130	NC_013798	TGAAT	2	10	841146	841155	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
131	NC_013798	GAAAG	2	10	864213	864222	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
132	NC_013798	ATATC	2	10	864530	864539	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
133	NC_013798	AGTTT	2	10	870699	870708	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
134	NC_013798	ATTTC	2	10	871343	871352	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
135	NC_013798	TTTGT	2	10	882582	882591	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
136	NC_013798	TCAGT	2	10	882702	882711	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
137	NC_013798	GTTAT	2	10	884494	884503	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
138	NC_013798	TTTTA	2	10	884560	884569	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_013798	AATAA	2	10	886502	886511	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_013798	ATCAT	2	10	891954	891963	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
141	NC_013798	CTTTT	2	10	899287	899296	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
142	NC_013798	ATAAA	2	10	902107	902116	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_013798	TCAAA	2	10	903563	903572	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
144	NC_013798	ATGGT	2	10	903628	903637	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
145	NC_013798	TATAT	2	10	931657	931666	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_013798	CTAAA	2	10	961054	961063	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
147	NC_013798	GCTGT	2	10	973521	973530	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
148	NC_013798	TTTAT	2	10	974773	974782	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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363	NC_013798	TCATG	2	10	2306356	2306365	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.