MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Bacillus pseudofirmus OF4 plasmid pBpOF4-02

Total Repeats: 44

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013793	TTTCCA	2	12	851	862	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	288557109
2	NC_013793	TAAACT	2	12	4803	4814	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_013793	ATAGAA	2	12	5639	5650	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_013793	AAAGTG	2	12	7593	7604	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	288557119
5	NC_013793	TTTGTT	2	12	10007	10018	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	288557122
6	NC_013793	GGCTGT	2	12	12743	12754	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	288557124
7	NC_013793	AATGGA	2	12	15712	15723	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	288557126
8	NC_013793	ATATTA	2	12	18574	18585	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_013793	TAGTGC	2	12	24613	24624	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	288557139
10	NC_013793	GGTTCA	2	12	27182	27193	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	288557141
11	NC_013793	TTGTTC	2	12	28670	28681	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	288557142
12	NC_013793	ATCAAA	2	12	28877	28888	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_013793	ATTTGG	2	12	29430	29441	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	288557143
14	NC_013793	AATGAA	2	12	33472	33483	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	288557148
15	NC_013793	TTGTGA	2	12	34695	34706	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	288557150
16	NC_013793	GAAAAA	2	12	36113	36124	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_013793	TCCAGT	2	12	42474	42485	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	288557164
18	NC_013793	GTACTC	2	12	42811	42822	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	288557164
19	NC_013793	TTTAGT	2	12	43056	43067	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	288557165
20	NC_013793	TTCAGC	2	12	44743	44754	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	288557167
21	NC_013793	AAAAGT	2	12	47567	47578	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	288557171
22	NC_013793	GAAGCT	2	12	54498	54509	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	288557179
23	NC_013793	AGCGAA	2	12	55172	55183	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	288557179
24	NC_013793	CATCTT	2	12	55308	55319	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_013793	TATCTA	2	12	55662	55673	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	288557180
26	NC_013793	TAAAAA	2	12	55758	55769	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	288557180
27	NC_013793	AGAATT	2	12	57315	57326	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	288557182
28	NC_013793	CCGTAT	2	12	59242	59253	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	288557184
29	NC_013793	TTTTGC	2	12	60546	60557	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	288557184
30	NC_013793	AATGTC	2	12	62720	62731	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	288557186
31	NC_013793	CTTTAT	2	12	68747	68758	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	288557193
32	NC_013793	TATGAA	2	12	71786	71797	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	288557196
33	NC_013793	ATATGA	2	12	72512	72523	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	288557196
34	NC_013793	AAAAGA	2	12	72950	72961	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	288557196
35	NC_013793	TCTTAT	2	12	74521	74532	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_013793	CGCTAT	2	12	75044	75055	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_013793	GATCGG	2	12	76486	76497	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	288557199
38	NC_013793	GGAAGA	2	12	78623	78634	50 %	0 %	50 %	0 %	288557200
39	NC_013793	AATTTT	2	12	79093	79104	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	288557201
40	NC_013793	AGTACC	2	12	79951	79962	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	288557203
41	NC_013793	CTTTTT	2	12	87794	87805	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	288557209
42	NC_013793	TATTTG	2	12	95665	95676	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_013793	TAATTA	2	12	100698	100709	50 %	50 %	0 %	0 %	288557224
44	NC_013793	TGAAGC	2	12	102174	102185	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.