MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Bacillus pseudofirmus OF4 plasmid pBpOF4-02

Total Repeats: 32

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013793	TTAAA	2	10	5684	5693	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_013793	TAGAA	2	10	11286	11295	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
3	NC_013793	TATAA	2	10	23692	23701	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_013793	ATACA	2	10	32245	32254	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
5	NC_013793	GTTTT	2	10	32554	32563	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
6	NC_013793	TAAAT	2	10	33443	33452	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_013793	ACTCG	2	10	39116	39125	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
8	NC_013793	ATAAC	2	10	39145	39154	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
9	NC_013793	TGTAG	2	10	39396	39405	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
10	NC_013793	CCTTC	2	10	40146	40155	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
11	NC_013793	TTGAC	2	10	41281	41290	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
12	NC_013793	TCTTT	2	10	44086	44095	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
13	NC_013793	ATTAA	2	10	44507	44516	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_013793	TAAAA	2	10	45667	45676	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_013793	CAATT	2	10	50614	50623	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
16	NC_013793	TGAAA	2	10	50841	50850	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
17	NC_013793	GTTCA	2	10	51403	51412	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
18	NC_013793	TCATA	2	10	65893	65902	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
19	NC_013793	TTTGC	2	10	69234	69243	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
20	NC_013793	AGTTT	2	10	70181	70190	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
21	NC_013793	ATTTA	3	15	71410	71424	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_013793	TTAGA	2	10	71554	71563	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
23	NC_013793	GTTAA	2	10	71579	71588	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
24	NC_013793	TTTTA	2	10	74607	74616	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_013793	ATATT	2	10	88566	88575	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_013793	TTTCC	2	10	93219	93228	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
27	NC_013793	CGGAA	2	10	93449	93458	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
28	NC_013793	TTAAT	2	10	93806	93815	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_013793	TTATA	2	10	93838	93847	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_013793	ACGCC	2	10	96056	96065	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
31	NC_013793	AAATC	2	10	96842	96851	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
32	NC_013793	ACCCT	2	10	104980	104989	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.