MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Bacillus pseudofirmus OF4 plasmid pBpOF4-02

Total Repeats: 81

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013793	TAATA	2	10	874	883	60 %	40 %	0 %	0 %	288557109
2	NC_013793	TCATT	2	10	1149	1158	20 %	60 %	0 %	20 %	288557109
3	NC_013793	CTATG	2	10	3719	3728	20 %	40 %	20 %	20 %	288557111
4	NC_013793	TTCAT	2	10	4428	4437	20 %	60 %	0 %	20 %	288557113
5	NC_013793	AAATT	2	10	5484	5493	60 %	40 %	0 %	0 %	288557116
6	NC_013793	CTCTA	2	10	6295	6304	20 %	40 %	0 %	40 %	288557117
7	NC_013793	GAAGA	2	10	7856	7865	60 %	0 %	40 %	0 %	288557119
8	NC_013793	AGTTT	2	10	11430	11439	20 %	60 %	20 %	0 %	288557123
9	NC_013793	AATTT	2	10	13297	13306	40 %	60 %	0 %	0 %	288557124
10	NC_013793	ATGGA	2	10	14557	14566	40 %	20 %	40 %	0 %	288557125
11	NC_013793	AAATG	2	10	15184	15193	60 %	20 %	20 %	0 %	288557126
12	NC_013793	AATTT	2	10	16459	16468	40 %	60 %	0 %	0 %	288557127
13	NC_013793	CAAAA	2	10	17673	17682	80 %	0 %	0 %	20 %	288557130
14	NC_013793	AGTTT	2	10	18919	18928	20 %	60 %	20 %	0 %	288557132
15	NC_013793	CATCG	2	10	19123	19132	20 %	20 %	20 %	40 %	288557132
16	NC_013793	TATTT	2	10	19904	19913	20 %	80 %	0 %	0 %	288557134
17	NC_013793	TTTTG	2	10	19933	19942	0 %	80 %	20 %	0 %	288557134
18	NC_013793	GAAAG	2	10	21587	21596	60 %	0 %	40 %	0 %	288557136
19	NC_013793	ACGCT	2	10	21875	21884	20 %	20 %	20 %	40 %	288557136
20	NC_013793	AAAAT	2	10	23419	23428	80 %	20 %	0 %	0 %	288557137
21	NC_013793	TTCTT	2	10	23987	23996	0 %	80 %	0 %	20 %	288557138
22	NC_013793	TAATA	2	10	25134	25143	60 %	40 %	0 %	0 %	288557140
23	NC_013793	ATCAA	2	10	26326	26335	60 %	20 %	0 %	20 %	288557141
24	NC_013793	AAGAA	2	10	28065	28074	80 %	0 %	20 %	0 %	288557142
25	NC_013793	TTAAT	2	10	29459	29468	40 %	60 %	0 %	0 %	288557143
26	NC_013793	AATTG	2	10	33005	33014	40 %	40 %	20 %	0 %	288557147
27	NC_013793	GAAAA	2	10	34092	34101	80 %	0 %	20 %	0 %	288557149
28	NC_013793	AATTA	2	10	36390	36399	60 %	40 %	0 %	0 %	288557152
29	NC_013793	GGTTT	2	10	36992	37001	0 %	60 %	40 %	0 %	288557153
30	NC_013793	TAAAA	2	10	37034	37043	80 %	20 %	0 %	0 %	288557153
31	NC_013793	AATTA	2	10	38261	38270	60 %	40 %	0 %	0 %	288557156
32	NC_013793	TGGTT	2	10	40477	40486	0 %	60 %	40 %	0 %	288557158
33	NC_013793	TATCT	2	10	40530	40539	20 %	60 %	0 %	20 %	288557158
34	NC_013793	TTATT	2	10	41123	41132	20 %	80 %	0 %	0 %	288557159
35	NC_013793	AGTGA	2	10	41384	41393	40 %	20 %	40 %	0 %	288557160
36	NC_013793	GAATG	2	10	44685	44694	40 %	20 %	40 %	0 %	288557167
37	NC_013793	AAATG	2	10	46014	46023	60 %	20 %	20 %	0 %	288557169
38	NC_013793	AGGGG	2	10	46699	46708	20 %	0 %	80 %	0 %	288557169
39	NC_013793	CTTTT	2	10	47763	47772	0 %	80 %	0 %	20 %	288557172
40	NC_013793	AAAAT	2	10	49311	49320	80 %	20 %	0 %	0 %	288557173
41	NC_013793	TTGAA	2	10	49440	49449	40 %	40 %	20 %	0 %	288557173
42	NC_013793	AAAGA	2	10	49664	49673	80 %	0 %	20 %	0 %	288557173
43	NC_013793	TAGTG	2	10	50071	50080	20 %	40 %	40 %	0 %	288557173
44	NC_013793	GAAAA	2	10	53424	53433	80 %	0 %	20 %	0 %	288557177
45	NC_013793	TCTCT	2	10	55146	55155	0 %	60 %	0 %	40 %	288557179
46	NC_013793	ATTTG	2	10	56183	56192	20 %	60 %	20 %	0 %	288557180
47	NC_013793	ATTTG	2	10	58577	58586	20 %	60 %	20 %	0 %	288557184
48	NC_013793	CCCAA	2	10	58636	58645	40 %	0 %	0 %	60 %	288557184
49	NC_013793	CTTTT	2	10	58685	58694	0 %	80 %	0 %	20 %	288557184
50	NC_013793	ATTTT	2	10	58968	58977	20 %	80 %	0 %	0 %	288557184
51	NC_013793	GAAGA	2	10	59428	59437	60 %	0 %	40 %	0 %	288557184
52	NC_013793	AATCT	2	10	59917	59926	40 %	40 %	0 %	20 %	288557184
53	NC_013793	GCCTA	2	10	60728	60737	20 %	20 %	20 %	40 %	288557184
54	NC_013793	CAATT	2	10	61862	61871	40 %	40 %	0 %	20 %	288557185
55	NC_013793	GAGAA	2	10	63094	63103	60 %	0 %	40 %	0 %	288557187
56	NC_013793	AGATA	2	10	67828	67837	60 %	20 %	20 %	0 %	288557192
57	NC_013793	AAACC	2	10	67880	67889	60 %	0 %	0 %	40 %	288557192
58	NC_013793	TTCTT	2	10	69925	69934	0 %	80 %	0 %	20 %	288557194
59	NC_013793	TTTAT	2	10	71989	71998	20 %	80 %	0 %	0 %	288557196
60	NC_013793	TGAAG	2	10	72707	72716	40 %	20 %	40 %	0 %	288557196
61	NC_013793	TGGAT	2	10	73130	73139	20 %	40 %	40 %	0 %	288557197
62	NC_013793	GTCAC	2	10	75508	75517	20 %	20 %	20 %	40 %	288557198
63	NC_013793	TGGAT	2	10	77376	77385	20 %	40 %	40 %	0 %	288557199
64	NC_013793	ACAAA	2	10	77518	77527	80 %	0 %	0 %	20 %	288557199
65	NC_013793	TGAAA	2	10	79343	79352	60 %	20 %	20 %	0 %	288557202
66	NC_013793	TTGCT	2	10	83510	83519	0 %	60 %	20 %	20 %	288557205
67	NC_013793	ATGAC	2	10	83708	83717	40 %	20 %	20 %	20 %	288557205
68	NC_013793	TGTGA	2	10	86556	86565	20 %	40 %	40 %	0 %	288557208
69	NC_013793	TCTGC	2	10	90019	90028	0 %	40 %	20 %	40 %	288557212
70	NC_013793	TTAAA	2	10	90664	90673	60 %	40 %	0 %	0 %	288557213
71	NC_013793	ATTTT	2	10	90705	90714	20 %	80 %	0 %	0 %	288557213
72	NC_013793	AAGTA	2	10	92689	92698	60 %	20 %	20 %	0 %	288557215
73	NC_013793	TTCTT	2	10	94019	94028	0 %	80 %	0 %	20 %	288557216
74	NC_013793	ATTTA	2	10	94464	94473	40 %	60 %	0 %	0 %	288557217
75	NC_013793	AATTA	2	10	94484	94493	60 %	40 %	0 %	0 %	288557217
76	NC_013793	TACAA	2	10	95305	95314	60 %	20 %	0 %	20 %	288557217
77	NC_013793	GCACA	2	10	96587	96596	40 %	0 %	20 %	40 %	288557218
78	NC_013793	ATTCG	2	10	97885	97894	20 %	40 %	20 %	20 %	288557220
79	NC_013793	TTATT	2	10	98717	98726	20 %	80 %	0 %	0 %	288557221
80	NC_013793	TTTTA	2	10	99883	99892	20 %	80 %	0 %	0 %	288557223
81	NC_013793	TTGAA	2	10	100475	100484	40 %	40 %	20 %	0 %	288557224

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.