MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Bacillus pseudofirmus OF4 plasmid pBpOF4-02

Total Repeats: 101

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013793	GGGT	2	8	2796	2803	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
2	NC_013793	AAGA	2	8	5821	5828	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_013793	AATT	2	8	5903	5910	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_013793	TATT	2	8	6449	6456	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_013793	TTAA	2	8	7992	7999	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_013793	GTTT	2	8	8037	8044	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
7	NC_013793	CCCT	2	8	9224	9231	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
8	NC_013793	GCAT	2	8	9246	9253	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
9	NC_013793	GGTG	2	8	9259	9266	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
10	NC_013793	CTAA	2	8	9282	9289	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_013793	TAGG	2	8	11314	11321	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_013793	CATC	2	8	16952	16959	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_013793	GAAA	2	8	19547	19554	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
14	NC_013793	TAAT	2	8	19816	19823	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_013793	TTCT	2	8	20976	20983	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
16	NC_013793	TAAA	2	8	23548	23555	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_013793	TATT	2	8	27385	27392	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_013793	AAAT	2	8	27727	27734	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_013793	AGGT	2	8	27758	27765	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_013793	GAGG	2	8	28764	28771	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
21	NC_013793	TAGA	2	8	28807	28814	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
22	NC_013793	TACT	2	8	31455	31462	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
23	NC_013793	GAAG	2	8	32053	32060	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_013793	AGAT	2	8	32179	32186	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
25	NC_013793	ATGT	2	8	33728	33735	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
26	NC_013793	CAAG	2	8	35994	36001	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
27	NC_013793	AATA	4	16	36017	36032	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_013793	ACGA	2	8	36046	36053	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
29	NC_013793	TTCT	2	8	36674	36681	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
30	NC_013793	AATG	2	8	37957	37964	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
31	NC_013793	TGTT	2	8	39190	39197	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
32	NC_013793	AGTT	2	8	39269	39276	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
33	NC_013793	TTTA	2	8	39640	39647	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_013793	AATA	2	8	42241	42248	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_013793	AATA	2	8	43439	43446	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_013793	CATA	2	8	44054	44061	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
37	NC_013793	GAGT	2	8	44111	44118	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_013793	AAAT	2	8	44799	44806	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_013793	TGTA	2	8	45162	45169	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_013793	GAAA	2	8	45217	45224	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_013793	AAAC	2	8	45232	45239	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
42	NC_013793	AAGA	2	8	45281	45288	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NC_013793	AAAG	2	8	45551	45558	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
44	NC_013793	CCAT	2	8	47124	47131	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
45	NC_013793	TGAA	2	8	47147	47154	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
46	NC_013793	TTGT	2	8	48212	48219	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
47	NC_013793	ATTT	2	8	48259	48266	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_013793	GGAG	2	8	50252	50259	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
49	NC_013793	AAAT	2	8	50586	50593	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_013793	GTTC	2	8	50935	50942	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
51	NC_013793	GAAA	2	8	51482	51489	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
52	NC_013793	CTTC	2	8	52568	52575	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
53	NC_013793	TTCA	2	8	56607	56614	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
54	NC_013793	TCCC	2	8	62101	62108	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
55	NC_013793	CGTT	2	8	62236	62243	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
56	NC_013793	TTCA	2	8	62280	62287	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
57	NC_013793	CAGA	2	8	64926	64933	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
58	NC_013793	ACCT	2	8	65753	65760	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
59	NC_013793	AACT	2	8	65766	65773	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
60	NC_013793	GATT	2	8	66029	66036	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
61	NC_013793	AATA	2	8	66547	66554	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_013793	TTGT	2	8	66802	66809	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
63	NC_013793	TAAT	2	8	66823	66830	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_013793	TTGA	2	8	66991	66998	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
65	NC_013793	TCCC	2	8	68038	68045	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
66	NC_013793	ACTA	2	8	69116	69123	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
67	NC_013793	ACGT	2	8	69478	69485	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
68	NC_013793	GTTA	2	8	70229	70236	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
69	NC_013793	AACT	2	8	71451	71458	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
70	NC_013793	AAAT	2	8	71510	71517	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_013793	ATGA	2	8	71638	71645	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
72	NC_013793	TAAT	2	8	71734	71741	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_013793	CCTC	2	8	73734	73741	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
74	NC_013793	GAAA	2	8	74072	74079	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
75	NC_013793	ACCA	2	8	74246	74253	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
76	NC_013793	ATTT	2	8	74386	74393	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_013793	GGTT	2	8	74723	74730	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_013793	TAAT	2	8	74845	74852	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_013793	AGGA	2	8	75163	75170	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
80	NC_013793	GGAA	2	8	75194	75201	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
81	NC_013793	AGAA	2	8	75333	75340	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
82	NC_013793	TAAT	2	8	75400	75407	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_013793	AAAT	2	8	88261	88268	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_013793	TATT	2	8	88328	88335	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_013793	ATTC	2	8	88465	88472	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
86	NC_013793	GGTT	2	8	88636	88643	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
87	NC_013793	GCCG	2	8	93310	93317	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
88	NC_013793	ATGA	2	8	93436	93443	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
89	NC_013793	ATTT	2	8	93652	93659	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_013793	AGTA	2	8	93767	93774	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
91	NC_013793	CTTT	2	8	95735	95742	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
92	NC_013793	TTTA	2	8	95743	95750	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_013793	GGAT	2	8	98371	98378	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
94	NC_013793	AGGA	2	8	99159	99166	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
95	NC_013793	GACA	2	8	101213	101220	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
96	NC_013793	AATT	2	8	101318	101325	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_013793	TCAA	2	8	101663	101670	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
98	NC_013793	GGAA	2	8	102899	102906	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
99	NC_013793	GGTA	2	8	103182	103189	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
100	NC_013793	GCAG	2	8	104969	104976	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
101	NC_013793	GCAA	2	8	105010	105017	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.