MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Bacillus pseudofirmus OF4 plasmid pBpOF4-02

Total Repeats: 237

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013793	ATTA	2	8	272	279	50 %	50 %	0 %	0 %	288557108
2	NC_013793	AACG	2	8	292	299	50 %	0 %	25 %	25 %	288557108
3	NC_013793	TCTT	2	8	1808	1815	0 %	75 %	0 %	25 %	288557110
4	NC_013793	TCAA	2	8	1908	1915	50 %	25 %	0 %	25 %	288557110
5	NC_013793	CTTT	2	8	2339	2346	0 %	75 %	0 %	25 %	288557110
6	NC_013793	CTTT	2	8	3201	3208	0 %	75 %	0 %	25 %	288557111
7	NC_013793	ACAG	2	8	3387	3394	50 %	0 %	25 %	25 %	288557111
8	NC_013793	ATAG	2	8	3888	3895	50 %	25 %	25 %	0 %	288557111
9	NC_013793	TATT	2	8	4138	4145	25 %	75 %	0 %	0 %	288557112
10	NC_013793	ATGA	2	8	4225	4232	50 %	25 %	25 %	0 %	288557112
11	NC_013793	AAAT	2	8	4633	4640	75 %	25 %	0 %	0 %	288557114
12	NC_013793	ACAA	2	8	5077	5084	75 %	0 %	0 %	25 %	288557115
13	NC_013793	ATTT	2	8	6141	6148	25 %	75 %	0 %	0 %	288557117
14	NC_013793	ATAA	2	8	6339	6346	75 %	25 %	0 %	0 %	288557117
15	NC_013793	GAGC	2	8	6953	6960	25 %	0 %	50 %	25 %	288557119
16	NC_013793	CAGC	2	8	7802	7809	25 %	0 %	25 %	50 %	288557119
17	NC_013793	GAAA	2	8	7868	7875	75 %	0 %	25 %	0 %	288557119
18	NC_013793	AACT	2	8	8319	8326	50 %	25 %	0 %	25 %	288557120
19	NC_013793	ATTC	2	8	8401	8408	25 %	50 %	0 %	25 %	288557120
20	NC_013793	TGGT	2	8	8477	8484	0 %	50 %	50 %	0 %	288557120
21	NC_013793	GAAA	2	8	9016	9023	75 %	0 %	25 %	0 %	288557120
22	NC_013793	AATT	2	8	9926	9933	50 %	50 %	0 %	0 %	288557121
23	NC_013793	CTTT	2	8	10153	10160	0 %	75 %	0 %	25 %	288557122
24	NC_013793	ATGT	2	8	10274	10281	25 %	50 %	25 %	0 %	288557122
25	NC_013793	TCCT	2	8	10498	10505	0 %	50 %	0 %	50 %	288557122
26	NC_013793	ATTT	2	8	10736	10743	25 %	75 %	0 %	0 %	288557122
27	NC_013793	ATCG	2	8	11138	11145	25 %	25 %	25 %	25 %	288557122
28	NC_013793	TAAC	2	8	11240	11247	50 %	25 %	0 %	25 %	288557122
29	NC_013793	AAAG	2	8	11399	11406	75 %	0 %	25 %	0 %	288557123
30	NC_013793	TTTC	2	8	12131	12138	0 %	75 %	0 %	25 %	288557123
31	NC_013793	AACT	2	8	12393	12400	50 %	25 %	0 %	25 %	288557123
32	NC_013793	CTAC	2	8	12453	12460	25 %	25 %	0 %	50 %	288557124
33	NC_013793	TAAA	2	8	12796	12803	75 %	25 %	0 %	0 %	288557124
34	NC_013793	TATG	2	8	13222	13229	25 %	50 %	25 %	0 %	288557124
35	NC_013793	TAAA	2	8	13417	13424	75 %	25 %	0 %	0 %	288557124
36	NC_013793	GAAA	2	8	13553	13560	75 %	0 %	25 %	0 %	288557124
37	NC_013793	AAGT	2	8	14824	14831	50 %	25 %	25 %	0 %	288557125
38	NC_013793	ATAC	2	8	15278	15285	50 %	25 %	0 %	25 %	288557126
39	NC_013793	AACG	2	8	15412	15419	50 %	0 %	25 %	25 %	288557126
40	NC_013793	ATGG	2	8	15647	15654	25 %	25 %	50 %	0 %	288557126
41	NC_013793	AACA	2	8	16071	16078	75 %	0 %	0 %	25 %	288557127
42	NC_013793	GTAA	2	8	16090	16097	50 %	25 %	25 %	0 %	288557127
43	NC_013793	TAAT	2	8	16508	16515	50 %	50 %	0 %	0 %	288557127
44	NC_013793	TCTG	2	8	17205	17212	0 %	50 %	25 %	25 %	288557128
45	NC_013793	AAAT	2	8	17700	17707	75 %	25 %	0 %	0 %	288557130
46	NC_013793	CGTC	2	8	18245	18252	0 %	25 %	25 %	50 %	288557131
47	NC_013793	ATTC	2	8	18552	18559	25 %	50 %	0 %	25 %	288557131
48	NC_013793	AAAT	2	8	19352	19359	75 %	25 %	0 %	0 %	288557132
49	NC_013793	TTCA	2	8	19407	19414	25 %	50 %	0 %	25 %	288557132
50	NC_013793	ATTT	2	8	19626	19633	25 %	75 %	0 %	0 %	288557133
51	NC_013793	ACCA	2	8	20234	20241	50 %	0 %	0 %	50 %	288557135
52	NC_013793	AAAG	2	8	21940	21947	75 %	0 %	25 %	0 %	288557136
53	NC_013793	TTTG	2	8	21958	21965	0 %	75 %	25 %	0 %	288557137
54	NC_013793	TTTG	2	8	22330	22337	0 %	75 %	25 %	0 %	288557137
55	NC_013793	TCAA	2	8	22753	22760	50 %	25 %	0 %	25 %	288557137
56	NC_013793	TTTC	2	8	22922	22929	0 %	75 %	0 %	25 %	288557137
57	NC_013793	TAAT	2	8	23289	23296	50 %	50 %	0 %	0 %	288557137
58	NC_013793	TAGT	2	8	23373	23380	25 %	50 %	25 %	0 %	288557137
59	NC_013793	ATTT	2	8	23835	23842	25 %	75 %	0 %	0 %	288557138
60	NC_013793	TTAT	2	8	24165	24172	25 %	75 %	0 %	0 %	288557138
61	NC_013793	AACA	2	8	24634	24641	75 %	0 %	0 %	25 %	288557139
62	NC_013793	AATT	2	8	24672	24679	50 %	50 %	0 %	0 %	288557139
63	NC_013793	TAAA	2	8	25213	25220	75 %	25 %	0 %	0 %	288557140
64	NC_013793	CCTT	2	8	25295	25302	0 %	50 %	0 %	50 %	288557140
65	NC_013793	TAAG	2	8	25318	25325	50 %	25 %	25 %	0 %	288557140
66	NC_013793	TAAA	2	8	25410	25417	75 %	25 %	0 %	0 %	288557140
67	NC_013793	AGAA	2	8	26312	26319	75 %	0 %	25 %	0 %	288557141
68	NC_013793	TCTT	2	8	26396	26403	0 %	75 %	0 %	25 %	288557141
69	NC_013793	ACCA	2	8	26431	26438	50 %	0 %	0 %	50 %	288557141
70	NC_013793	ATGT	2	8	26665	26672	25 %	50 %	25 %	0 %	288557141
71	NC_013793	GAAG	2	8	26794	26801	50 %	0 %	50 %	0 %	288557141
72	NC_013793	TGGT	2	8	27980	27987	0 %	50 %	50 %	0 %	288557142
73	NC_013793	TTGG	2	8	28396	28403	0 %	50 %	50 %	0 %	288557142
74	NC_013793	CGGT	2	8	28418	28425	0 %	25 %	50 %	25 %	288557142
75	NC_013793	CAAC	2	8	29150	29157	50 %	0 %	0 %	50 %	288557143
76	NC_013793	AGCA	2	8	29267	29274	50 %	0 %	25 %	25 %	288557143
77	NC_013793	TGCT	2	8	29927	29934	0 %	50 %	25 %	25 %	288557143
78	NC_013793	GAAA	2	8	30503	30510	75 %	0 %	25 %	0 %	288557143
79	NC_013793	ATAA	2	8	31078	31085	75 %	25 %	0 %	0 %	288557145
80	NC_013793	AAAT	2	8	31409	31416	75 %	25 %	0 %	0 %	288557145
81	NC_013793	CTTT	2	8	32703	32710	0 %	75 %	0 %	25 %	288557147
82	NC_013793	TTAT	2	8	32874	32881	25 %	75 %	0 %	0 %	288557147
83	NC_013793	AAAT	2	8	33968	33975	75 %	25 %	0 %	0 %	288557149
84	NC_013793	AACT	2	8	34431	34438	50 %	25 %	0 %	25 %	288557150
85	NC_013793	TGAT	2	8	34496	34503	25 %	50 %	25 %	0 %	288557150
86	NC_013793	GAAA	2	8	34773	34780	75 %	0 %	25 %	0 %	288557150
87	NC_013793	TGTT	2	8	34942	34949	0 %	75 %	25 %	0 %	288557150
88	NC_013793	GTAC	2	8	35375	35382	25 %	25 %	25 %	25 %	288557151
89	NC_013793	TTAA	2	8	36190	36197	50 %	50 %	0 %	0 %	288557152
90	NC_013793	TTTA	2	8	36198	36205	25 %	75 %	0 %	0 %	288557152
91	NC_013793	AAAT	2	8	36417	36424	75 %	25 %	0 %	0 %	288557152
92	NC_013793	ATTA	2	8	37146	37153	50 %	50 %	0 %	0 %	288557153
93	NC_013793	ATTT	2	8	37195	37202	25 %	75 %	0 %	0 %	288557153
94	NC_013793	AAAG	2	8	38220	38227	75 %	0 %	25 %	0 %	288557156
95	NC_013793	AGAA	2	8	38710	38717	75 %	0 %	25 %	0 %	288557156
96	NC_013793	GAAA	2	8	39094	39101	75 %	0 %	25 %	0 %	288557156
97	NC_013793	GAAC	2	8	40557	40564	50 %	0 %	25 %	25 %	288557158
98	NC_013793	TTAT	2	8	40927	40934	25 %	75 %	0 %	0 %	288557159
99	NC_013793	TTTA	2	8	41115	41122	25 %	75 %	0 %	0 %	288557159
100	NC_013793	CAAC	2	8	41410	41417	50 %	0 %	0 %	50 %	288557160
101	NC_013793	TAAG	2	8	41428	41435	50 %	25 %	25 %	0 %	288557160
102	NC_013793	TGCT	2	8	41558	41565	0 %	50 %	25 %	25 %	288557161
103	NC_013793	AAGA	2	8	41782	41789	75 %	0 %	25 %	0 %	288557162
104	NC_013793	AAGA	2	8	42023	42030	75 %	0 %	25 %	0 %	288557163
105	NC_013793	GACC	2	8	42079	42086	25 %	0 %	25 %	50 %	288557163
106	NC_013793	GTTT	2	8	43145	43152	0 %	75 %	25 %	0 %	288557165
107	NC_013793	TGGG	2	8	43289	43296	0 %	25 %	75 %	0 %	288557165
108	NC_013793	AAAG	2	8	44187	44194	75 %	0 %	25 %	0 %	288557166
109	NC_013793	TTTA	2	8	44384	44391	25 %	75 %	0 %	0 %	288557166
110	NC_013793	ATGA	2	8	45028	45035	50 %	25 %	25 %	0 %	288557168
111	NC_013793	GATC	2	8	46584	46591	25 %	25 %	25 %	25 %	288557169
112	NC_013793	GGAA	2	8	46610	46617	50 %	0 %	50 %	0 %	288557169
113	NC_013793	AAAG	2	8	46779	46786	75 %	0 %	25 %	0 %	288557170
114	NC_013793	GGAC	2	8	46840	46847	25 %	0 %	50 %	25 %	288557170
115	NC_013793	AGGC	2	8	47015	47022	25 %	0 %	50 %	25 %	288557170
116	NC_013793	TTAA	2	8	47791	47798	50 %	50 %	0 %	0 %	288557172
117	NC_013793	GAAG	2	8	49702	49709	50 %	0 %	50 %	0 %	288557173
118	NC_013793	AATC	2	8	50631	50638	50 %	25 %	0 %	25 %	288557174
119	NC_013793	AGTA	2	8	50726	50733	50 %	25 %	25 %	0 %	288557174
120	NC_013793	TTTG	2	8	50781	50788	0 %	75 %	25 %	0 %	288557174
121	NC_013793	TATC	2	8	51076	51083	25 %	50 %	0 %	25 %	288557175
122	NC_013793	GAAG	2	8	51504	51511	50 %	0 %	50 %	0 %	288557176
123	NC_013793	TAAT	2	8	51620	51627	50 %	50 %	0 %	0 %	288557176
124	NC_013793	AACT	2	8	51680	51687	50 %	25 %	0 %	25 %	288557176
125	NC_013793	TAAA	2	8	51869	51876	75 %	25 %	0 %	0 %	288557176
126	NC_013793	ATAA	2	8	52306	52313	75 %	25 %	0 %	0 %	288557176
127	NC_013793	ATCA	2	8	52892	52899	50 %	25 %	0 %	25 %	288557177
128	NC_013793	TTGA	2	8	53032	53039	25 %	50 %	25 %	0 %	288557177
129	NC_013793	GTTT	2	8	53117	53124	0 %	75 %	25 %	0 %	288557177
130	NC_013793	ACTT	2	8	54888	54895	25 %	50 %	0 %	25 %	288557179
131	NC_013793	TATT	2	8	54946	54953	25 %	75 %	0 %	0 %	288557179
132	NC_013793	GTAT	2	8	55935	55942	25 %	50 %	25 %	0 %	288557180
133	NC_013793	AACC	2	8	56332	56339	50 %	0 %	0 %	50 %	288557180
134	NC_013793	TGAT	2	8	57206	57213	25 %	50 %	25 %	0 %	288557182
135	NC_013793	ACTA	2	8	57288	57295	50 %	25 %	0 %	25 %	288557182
136	NC_013793	TCTT	3	12	57422	57433	0 %	75 %	0 %	25 %	288557182
137	NC_013793	TAAA	2	8	57494	57501	75 %	25 %	0 %	0 %	288557182
138	NC_013793	CATT	2	8	58233	58240	25 %	50 %	0 %	25 %	288557183
139	NC_013793	AAAT	2	8	58604	58611	75 %	25 %	0 %	0 %	288557184
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.