MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Bacillus pseudofirmus OF4 plasmid pBpOF4-02

Total Repeats: 223

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013793	GA	4	8	177	184	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_013793	TC	3	6	467	472	0 %	50 %	0 %	50 %	288557109
3	NC_013793	AT	3	6	788	793	50 %	50 %	0 %	0 %	288557109
4	NC_013793	CT	3	6	2184	2189	0 %	50 %	0 %	50 %	288557110
5	NC_013793	TG	3	6	2691	2696	0 %	50 %	50 %	0 %	288557110
6	NC_013793	TA	3	6	2787	2792	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_013793	AT	3	6	3471	3476	50 %	50 %	0 %	0 %	288557111
8	NC_013793	AT	3	6	4023	4028	50 %	50 %	0 %	0 %	288557112
9	NC_013793	TG	3	6	4449	4454	0 %	50 %	50 %	0 %	288557113
10	NC_013793	CT	3	6	5698	5703	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_013793	GA	3	6	5785	5790	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_013793	AG	3	6	5868	5873	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_013793	AT	4	8	6087	6094	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_013793	AT	3	6	6258	6263	50 %	50 %	0 %	0 %	288557117
15	NC_013793	AT	3	6	7009	7014	50 %	50 %	0 %	0 %	288557119
16	NC_013793	AC	3	6	7065	7070	50 %	0 %	0 %	50 %	288557119
17	NC_013793	CT	3	6	7075	7080	0 %	50 %	0 %	50 %	288557119
18	NC_013793	AT	3	6	7410	7415	50 %	50 %	0 %	0 %	288557119
19	NC_013793	TA	3	6	8801	8806	50 %	50 %	0 %	0 %	288557120
20	NC_013793	AG	3	6	9406	9411	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_013793	TA	3	6	9448	9453	50 %	50 %	0 %	0 %	288557121
22	NC_013793	TA	4	8	9587	9594	50 %	50 %	0 %	0 %	288557121
23	NC_013793	TA	3	6	9807	9812	50 %	50 %	0 %	0 %	288557121
24	NC_013793	GT	3	6	10465	10470	0 %	50 %	50 %	0 %	288557122
25	NC_013793	TA	3	6	11658	11663	50 %	50 %	0 %	0 %	288557123
26	NC_013793	AG	3	6	12170	12175	50 %	0 %	50 %	0 %	288557123
27	NC_013793	GA	3	6	12259	12264	50 %	0 %	50 %	0 %	288557123
28	NC_013793	GA	3	6	12409	12414	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_013793	GT	3	6	14112	14117	0 %	50 %	50 %	0 %	288557125
30	NC_013793	AG	3	6	15206	15211	50 %	0 %	50 %	0 %	288557126
31	NC_013793	TA	3	6	15826	15831	50 %	50 %	0 %	0 %	288557127
32	NC_013793	TA	3	6	16550	16555	50 %	50 %	0 %	0 %	288557127
33	NC_013793	AT	3	6	16972	16977	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_013793	CA	3	6	18221	18226	50 %	0 %	0 %	50 %	288557131
35	NC_013793	AT	3	6	18851	18856	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_013793	TA	3	6	19276	19281	50 %	50 %	0 %	0 %	288557132
37	NC_013793	CT	3	6	19334	19339	0 %	50 %	0 %	50 %	288557132
38	NC_013793	CT	3	6	20024	20029	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_013793	CT	3	6	22970	22975	0 %	50 %	0 %	50 %	288557137
40	NC_013793	AC	3	6	23818	23823	50 %	0 %	0 %	50 %	288557138
41	NC_013793	CA	3	6	24131	24136	50 %	0 %	0 %	50 %	288557138
42	NC_013793	AT	3	6	24551	24556	50 %	50 %	0 %	0 %	288557139
43	NC_013793	TA	3	6	25230	25235	50 %	50 %	0 %	0 %	288557140
44	NC_013793	AT	3	6	26685	26690	50 %	50 %	0 %	0 %	288557141
45	NC_013793	AG	3	6	26767	26772	50 %	0 %	50 %	0 %	288557141
46	NC_013793	AT	3	6	27689	27694	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_013793	AT	3	6	27774	27779	50 %	50 %	0 %	0 %	288557142
48	NC_013793	AT	3	6	27992	27997	50 %	50 %	0 %	0 %	288557142
49	NC_013793	AT	4	8	28579	28586	50 %	50 %	0 %	0 %	288557142
50	NC_013793	TA	3	6	28694	28699	50 %	50 %	0 %	0 %	288557142
51	NC_013793	GA	3	6	29127	29132	50 %	0 %	50 %	0 %	288557143
52	NC_013793	GA	4	8	30490	30497	50 %	0 %	50 %	0 %	288557143
53	NC_013793	TA	3	6	30709	30714	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_013793	CT	3	6	32220	32225	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
55	NC_013793	TC	4	8	32593	32600	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
56	NC_013793	TA	3	6	33382	33387	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_013793	TA	4	8	33537	33544	50 %	50 %	0 %	0 %	288557148
58	NC_013793	AT	3	6	33690	33695	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_013793	TA	3	6	33774	33779	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_013793	GT	3	6	33864	33869	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_013793	TA	3	6	35721	35726	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_013793	TA	3	6	37062	37067	50 %	50 %	0 %	0 %	288557153
63	NC_013793	GA	3	6	37896	37901	50 %	0 %	50 %	0 %	288557155
64	NC_013793	AT	3	6	37988	37993	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_013793	GA	3	6	38125	38130	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_013793	TC	3	6	38174	38179	0 %	50 %	0 %	50 %	288557156
67	NC_013793	AT	3	6	39828	39833	50 %	50 %	0 %	0 %	288557157
68	NC_013793	TA	3	6	40508	40513	50 %	50 %	0 %	0 %	288557158
69	NC_013793	TC	3	6	40619	40624	0 %	50 %	0 %	50 %	288557158
70	NC_013793	AT	3	6	40994	40999	50 %	50 %	0 %	0 %	288557159
71	NC_013793	TA	3	6	41627	41632	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_013793	AT	3	6	41921	41926	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_013793	AG	3	6	42156	42161	50 %	0 %	50 %	0 %	288557163
74	NC_013793	CA	3	6	42967	42972	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
75	NC_013793	GA	3	6	44304	44309	50 %	0 %	50 %	0 %	288557166
76	NC_013793	GC	3	6	45417	45422	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
77	NC_013793	TA	3	6	45655	45660	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_013793	TC	3	6	45958	45963	0 %	50 %	0 %	50 %	288557169
79	NC_013793	CT	3	6	46317	46322	0 %	50 %	0 %	50 %	288557169
80	NC_013793	TG	3	6	46475	46480	0 %	50 %	50 %	0 %	288557169
81	NC_013793	AG	3	6	46570	46575	50 %	0 %	50 %	0 %	288557169
82	NC_013793	CT	3	6	46738	46743	0 %	50 %	0 %	50 %	288557170
83	NC_013793	TC	3	6	47971	47976	0 %	50 %	0 %	50 %	288557172
84	NC_013793	CA	3	6	48327	48332	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
85	NC_013793	CA	3	6	48349	48354	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
86	NC_013793	CA	3	6	48371	48376	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
87	NC_013793	CA	3	6	48393	48398	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
88	NC_013793	CA	3	6	48437	48442	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
89	NC_013793	CA	3	6	48460	48465	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
90	NC_013793	CA	3	6	48502	48507	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
91	NC_013793	CA	3	6	48543	48548	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
92	NC_013793	CA	3	6	48584	48589	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
93	NC_013793	CA	3	6	48626	48631	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
94	NC_013793	CA	3	6	48646	48651	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
95	NC_013793	CA	3	6	48668	48673	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
96	NC_013793	TG	3	6	48822	48827	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
97	NC_013793	CA	3	6	48970	48975	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
98	NC_013793	AG	3	6	49551	49556	50 %	0 %	50 %	0 %	288557173
99	NC_013793	TA	3	6	49895	49900	50 %	50 %	0 %	0 %	288557173
100	NC_013793	AT	3	6	49942	49947	50 %	50 %	0 %	0 %	288557173
101	NC_013793	AG	3	6	50314	50319	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
102	NC_013793	AT	3	6	51126	51131	50 %	50 %	0 %	0 %	288557175
103	NC_013793	CA	3	6	53293	53298	50 %	0 %	0 %	50 %	288557177
104	NC_013793	AG	3	6	53615	53620	50 %	0 %	50 %	0 %	288557177
105	NC_013793	TA	3	6	54048	54053	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_013793	AT	3	6	54059	54064	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_013793	CT	3	6	54732	54737	0 %	50 %	0 %	50 %	288557179
108	NC_013793	CT	3	6	54981	54986	0 %	50 %	0 %	50 %	288557179
109	NC_013793	AC	3	6	55061	55066	50 %	0 %	0 %	50 %	288557179
110	NC_013793	GA	3	6	55320	55325	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
111	NC_013793	TA	3	6	55585	55590	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_013793	TA	3	6	56066	56071	50 %	50 %	0 %	0 %	288557180
113	NC_013793	TA	4	8	56815	56822	50 %	50 %	0 %	0 %	288557181
114	NC_013793	AT	3	6	56957	56962	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_013793	TA	4	8	57241	57248	50 %	50 %	0 %	0 %	288557182
116	NC_013793	CT	3	6	57745	57750	0 %	50 %	0 %	50 %	288557182
117	NC_013793	GT	3	6	57885	57890	0 %	50 %	50 %	0 %	288557182
118	NC_013793	AT	3	6	58327	58332	50 %	50 %	0 %	0 %	288557183
119	NC_013793	TC	3	6	58948	58953	0 %	50 %	0 %	50 %	288557184
120	NC_013793	AT	3	6	59203	59208	50 %	50 %	0 %	0 %	288557184
121	NC_013793	TA	3	6	59797	59802	50 %	50 %	0 %	0 %	288557184
122	NC_013793	AT	3	6	59911	59916	50 %	50 %	0 %	0 %	288557184
123	NC_013793	TC	3	6	59945	59950	0 %	50 %	0 %	50 %	288557184
124	NC_013793	TA	3	6	59954	59959	50 %	50 %	0 %	0 %	288557184
125	NC_013793	AT	3	6	60076	60081	50 %	50 %	0 %	0 %	288557184
126	NC_013793	GC	3	6	60202	60207	0 %	0 %	50 %	50 %	288557184
127	NC_013793	GC	3	6	60261	60266	0 %	0 %	50 %	50 %	288557184
128	NC_013793	TC	3	6	60812	60817	0 %	50 %	0 %	50 %	288557184
129	NC_013793	TA	3	6	60964	60969	50 %	50 %	0 %	0 %	288557184
130	NC_013793	TA	3	6	62319	62324	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_013793	TG	5	10	62537	62546	0 %	50 %	50 %	0 %	288557186
132	NC_013793	AC	3	6	63715	63720	50 %	0 %	0 %	50 %	288557187
133	NC_013793	AT	3	6	65166	65171	50 %	50 %	0 %	0 %	288557188
134	NC_013793	AT	3	6	65441	65446	50 %	50 %	0 %	0 %	288557188
135	NC_013793	AT	3	6	66499	66504	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_013793	CA	3	6	66657	66662	50 %	0 %	0 %	50 %	288557190
137	NC_013793	TC	4	8	67023	67030	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
138	NC_013793	CT	3	6	67245	67250	0 %	50 %	0 %	50 %	288557191
139	NC_013793	AT	3	6	67624	67629	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_013793	GA	3	6	67743	67748	50 %	0 %	50 %	0 %	288557192
141	NC_013793	TA	3	6	67854	67859	50 %	50 %	0 %	0 %	288557192
142	NC_013793	TA	3	6	68468	68473	50 %	50 %	0 %	0 %	288557193
143	NC_013793	TA	3	6	68561	68566	50 %	50 %	0 %	0 %	288557193
144	NC_013793	AC	3	6	69011	69016	50 %	0 %	0 %	50 %	288557193
145	NC_013793	AG	3	6	69681	69686	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
146	NC_013793	TC	3	6	69689	69694	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
147	NC_013793	TC	3	6	69774	69779	0 %	50 %	0 %	50 %	288557194
148	NC_013793	TA	3	6	70306	70311	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.