MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Bacillus pseudofirmus OF4 plasmid pBpOF4-01

Total Repeats: 210

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013792	GCAAG	2	10	2530	2539	40 %	0 %	40 %	20 %	288561479
2	NC_013792	AGAAT	2	10	2819	2828	60 %	20 %	20 %	0 %	288561479
3	NC_013792	GTAAA	2	10	3969	3978	60 %	20 %	20 %	0 %	288561481
4	NC_013792	AAAAG	2	10	6677	6686	80 %	0 %	20 %	0 %	288561483
5	NC_013792	GAAGG	2	10	6912	6921	40 %	0 %	60 %	0 %	288561484
6	NC_013792	TCTTT	2	10	7895	7904	0 %	80 %	0 %	20 %	288561486
7	NC_013792	CTTTT	2	10	9719	9728	0 %	80 %	0 %	20 %	288561488
8	NC_013792	GTAGT	2	10	10043	10052	20 %	40 %	40 %	0 %	288561489
9	NC_013792	AATGA	2	10	12688	12697	60 %	20 %	20 %	0 %	288561492
10	NC_013792	GGATT	2	10	13264	13273	20 %	40 %	40 %	0 %	288561493
11	NC_013792	ACTAT	2	10	14146	14155	40 %	40 %	0 %	20 %	288561494
12	NC_013792	AAAGT	2	10	14793	14802	60 %	20 %	20 %	0 %	288561495
13	NC_013792	AATGA	2	10	15424	15433	60 %	20 %	20 %	0 %	288561495
14	NC_013792	GAAAT	2	10	15691	15700	60 %	20 %	20 %	0 %	288561496
15	NC_013792	GATTG	2	10	16834	16843	20 %	40 %	40 %	0 %	288561496
16	NC_013792	GCAAA	2	10	17562	17571	60 %	0 %	20 %	20 %	288561497
17	NC_013792	GATTT	2	10	18276	18285	20 %	60 %	20 %	0 %	288561498
18	NC_013792	ATTCG	2	10	19668	19677	20 %	40 %	20 %	20 %	288561500
19	NC_013792	TTCCA	2	10	22603	22612	20 %	40 %	0 %	40 %	288561501
20	NC_013792	ATTTC	2	10	23627	23636	20 %	60 %	0 %	20 %	288561502
21	NC_013792	GTTGG	2	10	24377	24386	0 %	40 %	60 %	0 %	288561503
22	NC_013792	AAAGT	2	10	24534	24543	60 %	20 %	20 %	0 %	288561503
23	NC_013792	ATTTT	2	10	24831	24840	20 %	80 %	0 %	0 %	288561504
24	NC_013792	AAAAC	2	10	27407	27416	80 %	0 %	0 %	20 %	288561506
25	NC_013792	AAAAT	2	10	28878	28887	80 %	20 %	0 %	0 %	288561509
26	NC_013792	ATGAT	2	10	32601	32610	40 %	40 %	20 %	0 %	288561514
27	NC_013792	CATTA	2	10	32776	32785	40 %	40 %	0 %	20 %	288561514
28	NC_013792	TTTAA	2	10	33887	33896	40 %	60 %	0 %	0 %	288561515
29	NC_013792	GAAAG	2	10	35935	35944	60 %	0 %	40 %	0 %	288561516
30	NC_013792	ATCCG	2	10	36386	36395	20 %	20 %	20 %	40 %	288561516
31	NC_013792	TGACA	2	10	37057	37066	40 %	20 %	20 %	20 %	288561517
32	NC_013792	AGAAA	2	10	37076	37085	80 %	0 %	20 %	0 %	288561517
33	NC_013792	TAAAG	2	10	41444	41453	60 %	20 %	20 %	0 %	288561522
34	NC_013792	CTCAC	2	10	46962	46971	20 %	20 %	0 %	60 %	288561527
35	NC_013792	CTGTA	2	10	49665	49674	20 %	40 %	20 %	20 %	288561529
36	NC_013792	AAAAC	2	10	49826	49835	80 %	0 %	0 %	20 %	288561529
37	NC_013792	TGATG	2	10	52730	52739	20 %	40 %	40 %	0 %	288561531
38	NC_013792	GAAGA	2	10	55645	55654	60 %	0 %	40 %	0 %	288561534
39	NC_013792	TTCTT	2	10	56347	56356	0 %	80 %	0 %	20 %	288561534
40	NC_013792	AAATG	2	10	57112	57121	60 %	20 %	20 %	0 %	288561535
41	NC_013792	ATATT	2	10	57387	57396	40 %	60 %	0 %	0 %	288561535
42	NC_013792	GAAGC	2	10	57910	57919	40 %	0 %	40 %	20 %	288561536
43	NC_013792	TAAAA	2	10	59317	59326	80 %	20 %	0 %	0 %	288561538
44	NC_013792	TTGAG	2	10	59965	59974	20 %	40 %	40 %	0 %	288561539
45	NC_013792	AAAGA	2	10	62524	62533	80 %	0 %	20 %	0 %	288561541
46	NC_013792	TTTTC	2	10	66166	66175	0 %	80 %	0 %	20 %	288561544
47	NC_013792	CATTT	2	10	66250	66259	20 %	60 %	0 %	20 %	288561544
48	NC_013792	GCGAT	2	10	68269	68278	20 %	20 %	40 %	20 %	288561548
49	NC_013792	AAGTG	2	10	68445	68454	40 %	20 %	40 %	0 %	288561548
50	NC_013792	CTTCC	2	10	70268	70277	0 %	40 %	0 %	60 %	288561551
51	NC_013792	CTCTT	2	10	71078	71087	0 %	60 %	0 %	40 %	288561552
52	NC_013792	CGGCT	2	10	71567	71576	0 %	20 %	40 %	40 %	288561552
53	NC_013792	ATCAA	2	10	74987	74996	60 %	20 %	0 %	20 %	288561555
54	NC_013792	CTTTT	2	10	75970	75979	0 %	80 %	0 %	20 %	288561557
55	NC_013792	TAAAC	2	10	77257	77266	60 %	20 %	0 %	20 %	288561558
56	NC_013792	ATTGC	2	10	77528	77537	20 %	40 %	20 %	20 %	288561558
57	NC_013792	TCTTT	2	10	78601	78610	0 %	80 %	0 %	20 %	288561559
58	NC_013792	TTCAT	2	10	78624	78633	20 %	60 %	0 %	20 %	288561559
59	NC_013792	TAGGA	2	10	92069	92078	40 %	20 %	40 %	0 %	288561572
60	NC_013792	TAAAG	2	10	92771	92780	60 %	20 %	20 %	0 %	288561573
61	NC_013792	ACTCC	2	10	92959	92968	20 %	20 %	0 %	60 %	288561573
62	NC_013792	TCGTT	2	10	94446	94455	0 %	60 %	20 %	20 %	288561574
63	NC_013792	GTTTT	2	10	98376	98385	0 %	80 %	20 %	0 %	288561577
64	NC_013792	GCTTG	2	10	99980	99989	0 %	40 %	40 %	20 %	288561579
65	NC_013792	ATATT	2	10	100373	100382	40 %	60 %	0 %	0 %	288561579
66	NC_013792	TAAAC	2	10	106543	106552	60 %	20 %	0 %	20 %	288561585
67	NC_013792	AACTT	2	10	107492	107501	40 %	40 %	0 %	20 %	288561586
68	NC_013792	TTGAT	2	10	107673	107682	20 %	60 %	20 %	0 %	288561587
69	NC_013792	CAATA	2	10	107972	107981	60 %	20 %	0 %	20 %	288561587
70	NC_013792	ATCGT	2	10	108451	108460	20 %	40 %	20 %	20 %	288561587
71	NC_013792	CAAGG	2	10	109523	109532	40 %	0 %	40 %	20 %	288561588
72	NC_013792	GAAAA	2	10	111459	111468	80 %	0 %	20 %	0 %	288561590
73	NC_013792	AAGCC	2	10	111698	111707	40 %	0 %	20 %	40 %	288561591
74	NC_013792	CCAGT	2	10	112179	112188	20 %	20 %	20 %	40 %	288561592
75	NC_013792	CTTGT	2	10	112364	112373	0 %	60 %	20 %	20 %	288561592
76	NC_013792	TGCTT	2	10	112868	112877	0 %	60 %	20 %	20 %	288561593
77	NC_013792	ATCAC	2	10	113115	113124	40 %	20 %	0 %	40 %	288561594
78	NC_013792	AACAA	2	10	115436	115445	80 %	0 %	0 %	20 %	288561597
79	NC_013792	CTTTT	2	10	116573	116582	0 %	80 %	0 %	20 %	288561599
80	NC_013792	CTCTT	2	10	119020	119029	0 %	60 %	0 %	40 %	288561601
81	NC_013792	CGATG	2	10	119353	119362	20 %	20 %	40 %	20 %	288561601
82	NC_013792	ATACC	2	10	121647	121656	40 %	20 %	0 %	40 %	288561602
83	NC_013792	GAGGT	2	10	121999	122008	20 %	20 %	60 %	0 %	288561603
84	NC_013792	CCTTC	2	10	122821	122830	0 %	40 %	0 %	60 %	288561603
85	NC_013792	TGATA	2	10	123042	123051	40 %	40 %	20 %	0 %	288561603
86	NC_013792	TAACG	2	10	124858	124867	40 %	20 %	20 %	20 %	288561604
87	NC_013792	GCCTT	2	10	125083	125092	0 %	40 %	20 %	40 %	288561604
88	NC_013792	ATTTA	2	10	125775	125784	40 %	60 %	0 %	0 %	288561604
89	NC_013792	GATCT	2	10	128385	128394	20 %	40 %	20 %	20 %	288561608
90	NC_013792	GCTTG	2	10	129294	129303	0 %	40 %	40 %	20 %	288561609
91	NC_013792	TTTCT	2	10	129973	129982	0 %	80 %	0 %	20 %	288561610
92	NC_013792	GTTTT	2	10	131817	131826	0 %	80 %	20 %	0 %	288561612
93	NC_013792	AAGTA	2	10	134167	134176	60 %	20 %	20 %	0 %	288561613
94	NC_013792	CATAG	2	10	134498	134507	40 %	20 %	20 %	20 %	288561613
95	NC_013792	ATTTG	2	10	134905	134914	20 %	60 %	20 %	0 %	288561613
96	NC_013792	TTCTC	2	10	138174	138183	0 %	60 %	0 %	40 %	288561616
97	NC_013792	CCCTA	2	10	138835	138844	20 %	20 %	0 %	60 %	288561617
98	NC_013792	CTTCA	2	10	139477	139486	20 %	40 %	0 %	40 %	288561617
99	NC_013792	ATTTA	2	10	140289	140298	40 %	60 %	0 %	0 %	288561618
100	NC_013792	TAAAT	2	10	140817	140826	60 %	40 %	0 %	0 %	288561618
101	NC_013792	TTTTC	2	10	144949	144958	0 %	80 %	0 %	20 %	288561621
102	NC_013792	ACGAT	2	10	147074	147083	40 %	20 %	20 %	20 %	288561623
103	NC_013792	ATCAA	2	10	147852	147861	60 %	20 %	0 %	20 %	288561623
104	NC_013792	AAGTT	2	10	148033	148042	40 %	40 %	20 %	0 %	288561624
105	NC_013792	TAAAT	2	10	148967	148976	60 %	40 %	0 %	0 %	288561626
106	NC_013792	TGTTT	2	10	150154	150163	0 %	80 %	20 %	0 %	288561627
107	NC_013792	TCTAG	2	10	150422	150431	20 %	40 %	20 %	20 %	288561627
108	NC_013792	TCTTT	2	10	150644	150653	0 %	80 %	0 %	20 %	288561628
109	NC_013792	AGAAT	2	10	152383	152392	60 %	20 %	20 %	0 %	288561631
110	NC_013792	ATCAG	2	10	153582	153591	40 %	20 %	20 %	20 %	288561632
111	NC_013792	GTTGT	2	10	153821	153830	0 %	60 %	40 %	0 %	288561632
112	NC_013792	ATTTT	2	10	154452	154461	20 %	80 %	0 %	0 %	288561633
113	NC_013792	GGGAA	2	10	156956	156965	40 %	0 %	60 %	0 %	288561635
114	NC_013792	TTTTC	2	10	158301	158310	0 %	80 %	0 %	20 %	288561637
115	NC_013792	TGTTT	2	10	158569	158578	0 %	80 %	20 %	0 %	288561638
116	NC_013792	CTTTT	2	10	158786	158795	0 %	80 %	0 %	20 %	288561638
117	NC_013792	TTTCA	2	10	164029	164038	20 %	60 %	0 %	20 %	288561642
118	NC_013792	CCAAT	2	10	167085	167094	40 %	20 %	0 %	40 %	288561646
119	NC_013792	TGATA	2	10	170687	170696	40 %	40 %	20 %	0 %	288561651
120	NC_013792	CTGCT	2	10	170723	170732	0 %	40 %	20 %	40 %	288561651
121	NC_013792	TTGCT	2	10	174188	174197	0 %	60 %	20 %	20 %	288561653
122	NC_013792	GATTT	2	10	175074	175083	20 %	60 %	20 %	0 %	288561653
123	NC_013792	CTTTT	2	10	177158	177167	0 %	80 %	0 %	20 %	288561655
124	NC_013792	AATCA	2	10	177471	177480	60 %	20 %	0 %	20 %	288561656
125	NC_013792	GAAAG	2	10	177984	177993	60 %	0 %	40 %	0 %	288561656
126	NC_013792	TTTCT	2	10	179016	179025	0 %	80 %	0 %	20 %	288561659
127	NC_013792	ATCGA	2	10	179416	179425	40 %	20 %	20 %	20 %	288561659
128	NC_013792	GAGTC	2	10	179772	179781	20 %	20 %	40 %	20 %	288561659
129	NC_013792	ATGAC	2	10	182945	182954	40 %	20 %	20 %	20 %	288561661
130	NC_013792	AACAA	2	10	183829	183838	80 %	0 %	0 %	20 %	288561662
131	NC_013792	CTCTA	2	10	183868	183877	20 %	40 %	0 %	40 %	288561662
132	NC_013792	ATTGC	2	10	184434	184443	20 %	40 %	20 %	20 %	288561662
133	NC_013792	TTTGA	2	10	184794	184803	20 %	60 %	20 %	0 %	288561663
134	NC_013792	TTTTA	2	10	186602	186611	20 %	80 %	0 %	0 %	288561665
135	NC_013792	ACACT	2	10	186858	186867	40 %	20 %	0 %	40 %	288561665
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.