MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Bacillus pseudofirmus OF4 plasmid pBpOF4-01

Total Repeats: 375

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013792	CT	3	6	264	269	0 %	50 %	0 %	50 %	288561477
2	NC_013792	TA	3	6	3644	3649	50 %	50 %	0 %	0 %	288561481
3	NC_013792	TA	3	6	4023	4028	50 %	50 %	0 %	0 %	288561481
4	NC_013792	AG	3	6	4683	4688	50 %	0 %	50 %	0 %	288561482
5	NC_013792	TA	3	6	4885	4890	50 %	50 %	0 %	0 %	288561482
6	NC_013792	TC	3	6	6107	6112	0 %	50 %	0 %	50 %	288561482
7	NC_013792	AG	3	6	6133	6138	50 %	0 %	50 %	0 %	288561482
8	NC_013792	TC	3	6	8042	8047	0 %	50 %	0 %	50 %	288561487
9	NC_013792	TG	3	6	8660	8665	0 %	50 %	50 %	0 %	288561487
10	NC_013792	GA	3	6	9099	9104	50 %	0 %	50 %	0 %	288561487
11	NC_013792	GT	3	6	11724	11729	0 %	50 %	50 %	0 %	288561491
12	NC_013792	AC	3	6	13697	13702	50 %	0 %	0 %	50 %	288561493
13	NC_013792	AG	3	6	15449	15454	50 %	0 %	50 %	0 %	288561496
14	NC_013792	AT	3	6	16488	16493	50 %	50 %	0 %	0 %	288561496
15	NC_013792	GA	3	6	16895	16900	50 %	0 %	50 %	0 %	288561496
16	NC_013792	AC	3	6	18357	18362	50 %	0 %	0 %	50 %	288561498
17	NC_013792	TC	3	6	19411	19416	0 %	50 %	0 %	50 %	288561500
18	NC_013792	AC	3	6	20052	20057	50 %	0 %	0 %	50 %	288561500
19	NC_013792	AT	3	6	20863	20868	50 %	50 %	0 %	0 %	288561500
20	NC_013792	AT	3	6	23152	23157	50 %	50 %	0 %	0 %	288561502
21	NC_013792	TA	3	6	23591	23596	50 %	50 %	0 %	0 %	288561502
22	NC_013792	TA	4	8	24508	24515	50 %	50 %	0 %	0 %	288561503
23	NC_013792	CT	4	8	25177	25184	0 %	50 %	0 %	50 %	288561504
24	NC_013792	AG	3	6	25752	25757	50 %	0 %	50 %	0 %	288561505
25	NC_013792	GT	3	6	25774	25779	0 %	50 %	50 %	0 %	288561505
26	NC_013792	AC	3	6	26136	26141	50 %	0 %	0 %	50 %	288561506
27	NC_013792	AG	3	6	26466	26471	50 %	0 %	50 %	0 %	288561506
28	NC_013792	TA	3	6	28316	28321	50 %	50 %	0 %	0 %	288561508
29	NC_013792	AG	3	6	29411	29416	50 %	0 %	50 %	0 %	288561510
30	NC_013792	GA	3	6	29944	29949	50 %	0 %	50 %	0 %	288561511
31	NC_013792	AG	3	6	29992	29997	50 %	0 %	50 %	0 %	288561511
32	NC_013792	CA	3	6	30029	30034	50 %	0 %	0 %	50 %	288561511
33	NC_013792	TC	3	6	30488	30493	0 %	50 %	0 %	50 %	288561512
34	NC_013792	TA	3	6	30514	30519	50 %	50 %	0 %	0 %	288561512
35	NC_013792	TC	3	6	31461	31466	0 %	50 %	0 %	50 %	288561513
36	NC_013792	TG	3	6	32166	32171	0 %	50 %	50 %	0 %	288561514
37	NC_013792	TA	3	6	32172	32177	50 %	50 %	0 %	0 %	288561514
38	NC_013792	AT	3	6	32816	32821	50 %	50 %	0 %	0 %	288561514
39	NC_013792	TA	3	6	33157	33162	50 %	50 %	0 %	0 %	288561514
40	NC_013792	TA	3	6	36831	36836	50 %	50 %	0 %	0 %	288561517
41	NC_013792	AT	3	6	37935	37940	50 %	50 %	0 %	0 %	288561519
42	NC_013792	AT	3	6	38294	38299	50 %	50 %	0 %	0 %	288561519
43	NC_013792	AT	3	6	38315	38320	50 %	50 %	0 %	0 %	288561519
44	NC_013792	TA	3	6	38959	38964	50 %	50 %	0 %	0 %	288561519
45	NC_013792	AG	3	6	40336	40341	50 %	0 %	50 %	0 %	288561521
46	NC_013792	CA	3	6	40442	40447	50 %	0 %	0 %	50 %	288561521
47	NC_013792	TG	3	6	40595	40600	0 %	50 %	50 %	0 %	288561521
48	NC_013792	TC	3	6	41388	41393	0 %	50 %	0 %	50 %	288561522
49	NC_013792	TC	3	6	44310	44315	0 %	50 %	0 %	50 %	288561523
50	NC_013792	AT	3	6	46336	46341	50 %	50 %	0 %	0 %	288561526
51	NC_013792	AG	3	6	49569	49574	50 %	0 %	50 %	0 %	288561529
52	NC_013792	TG	3	6	49939	49944	0 %	50 %	50 %	0 %	288561529
53	NC_013792	TC	3	6	50493	50498	0 %	50 %	0 %	50 %	288561530
54	NC_013792	CT	3	6	50734	50739	0 %	50 %	0 %	50 %	288561530
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57	NC_013792	CA	3	6	55575	55580	50 %	0 %	0 %	50 %	288561534
58	NC_013792	AG	3	6	56082	56087	50 %	0 %	50 %	0 %	288561534
59	NC_013792	AT	3	6	56306	56311	50 %	50 %	0 %	0 %	288561534
60	NC_013792	AG	3	6	56380	56385	50 %	0 %	50 %	0 %	288561534
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62	NC_013792	AG	3	6	57149	57154	50 %	0 %	50 %	0 %	288561535
63	NC_013792	AC	3	6	57282	57287	50 %	0 %	0 %	50 %	288561535
64	NC_013792	AT	3	6	57478	57483	50 %	50 %	0 %	0 %	288561535
65	NC_013792	GA	3	6	57799	57804	50 %	0 %	50 %	0 %	288561535
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67	NC_013792	TC	3	6	60171	60176	0 %	50 %	0 %	50 %	288561540
68	NC_013792	GA	4	8	64172	64179	50 %	0 %	50 %	0 %	288561542
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71	NC_013792	CA	3	6	69028	69033	50 %	0 %	0 %	50 %	288561549
72	NC_013792	AT	3	6	69632	69637	50 %	50 %	0 %	0 %	288561550
73	NC_013792	AT	3	6	70495	70500	50 %	50 %	0 %	0 %	288561551
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77	NC_013792	TA	3	6	73634	73639	50 %	50 %	0 %	0 %	288561553
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81	NC_013792	AT	3	6	77619	77624	50 %	50 %	0 %	0 %	288561558
82	NC_013792	AT	3	6	78843	78848	50 %	50 %	0 %	0 %	288561559
83	NC_013792	AT	3	6	80048	80053	50 %	50 %	0 %	0 %	288561560
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90	NC_013792	TA	3	6	87392	87397	50 %	50 %	0 %	0 %	288561568
91	NC_013792	AT	3	6	87946	87951	50 %	50 %	0 %	0 %	288561569
92	NC_013792	AT	3	6	88868	88873	50 %	50 %	0 %	0 %	288561570
93	NC_013792	TA	3	6	89044	89049	50 %	50 %	0 %	0 %	288561570
94	NC_013792	TA	3	6	90259	90264	50 %	50 %	0 %	0 %	288561570
95	NC_013792	TA	3	6	91132	91137	50 %	50 %	0 %	0 %	288561571
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103	NC_013792	AT	3	6	96943	96948	50 %	50 %	0 %	0 %	288561576
104	NC_013792	CT	3	6	96959	96964	0 %	50 %	0 %	50 %	288561576
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107	NC_013792	CT	3	6	98171	98176	0 %	50 %	0 %	50 %	288561577
108	NC_013792	CT	3	6	98621	98626	0 %	50 %	0 %	50 %	288561578
109	NC_013792	TA	3	6	99073	99078	50 %	50 %	0 %	0 %	288561578
110	NC_013792	TA	3	6	99768	99773	50 %	50 %	0 %	0 %	288561579
111	NC_013792	AT	4	8	100020	100027	50 %	50 %	0 %	0 %	288561579
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119	NC_013792	TA	3	6	106449	106454	50 %	50 %	0 %	0 %	288561585
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123	NC_013792	TA	3	6	108154	108159	50 %	50 %	0 %	0 %	288561587
124	NC_013792	TA	3	6	108683	108688	50 %	50 %	0 %	0 %	288561587
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141	NC_013792	AT	4	8	118554	118561	50 %	50 %	0 %	0 %	288561601
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.