MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Methanobrevibacter ruminantium M1 chromosome

Total Repeats: 2082

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013790	CCAAC	2	10	889	898	40 %	0 %	0 %	60 %	288559259
2	NC_013790	ATTGA	2	10	1977	1986	40 %	40 %	20 %	0 %	288559260
3	NC_013790	AATCA	2	10	3205	3214	60 %	20 %	0 %	20 %	288559261
4	NC_013790	TTTTA	2	10	4565	4574	20 %	80 %	0 %	0 %	288559261
5	NC_013790	GATAA	2	10	7922	7931	60 %	20 %	20 %	0 %	288559263
6	NC_013790	ATACA	2	10	7994	8003	60 %	20 %	0 %	20 %	288559263
7	NC_013790	TACGG	2	10	8162	8171	20 %	20 %	40 %	20 %	288559263
8	NC_013790	GCCTT	2	10	9077	9086	0 %	40 %	20 %	40 %	288559264
9	NC_013790	TTATT	2	10	11017	11026	20 %	80 %	0 %	0 %	288559266
10	NC_013790	TTTAA	2	10	11924	11933	40 %	60 %	0 %	0 %	288559266
11	NC_013790	TGTTT	2	10	12301	12310	0 %	80 %	20 %	0 %	288559266
12	NC_013790	AAGCA	2	10	12492	12501	60 %	0 %	20 %	20 %	288559267
13	NC_013790	TATTG	2	10	12550	12559	20 %	60 %	20 %	0 %	288559267
14	NC_013790	ATTTT	2	10	12671	12680	20 %	80 %	0 %	0 %	288559267
15	NC_013790	ATCAA	2	10	16960	16969	60 %	20 %	0 %	20 %	288559271
16	NC_013790	AGGAA	2	10	17024	17033	60 %	0 %	40 %	0 %	288559271
17	NC_013790	CTTTT	2	10	19475	19484	0 %	80 %	0 %	20 %	288559272
18	NC_013790	TGGAT	2	10	20021	20030	20 %	40 %	40 %	0 %	288559273
19	NC_013790	CTTAA	2	10	20226	20235	40 %	40 %	0 %	20 %	288559273
20	NC_013790	AAATG	2	10	21131	21140	60 %	20 %	20 %	0 %	288559273
21	NC_013790	TATAA	2	10	21246	21255	60 %	40 %	0 %	0 %	288559273
22	NC_013790	TGGGA	2	10	22006	22015	20 %	20 %	60 %	0 %	288559273
23	NC_013790	TGACT	2	10	22211	22220	20 %	40 %	20 %	20 %	288559273
24	NC_013790	AATCA	2	10	24528	24537	60 %	20 %	0 %	20 %	288559275
25	NC_013790	ATTTA	2	10	25029	25038	40 %	60 %	0 %	0 %	288559275
26	NC_013790	ATTAT	2	10	25415	25424	40 %	60 %	0 %	0 %	288559276
27	NC_013790	AAAAT	2	10	27559	27568	80 %	20 %	0 %	0 %	288559277
28	NC_013790	AAATC	2	10	28272	28281	60 %	20 %	0 %	20 %	288559278
29	NC_013790	GGATG	2	10	30531	30540	20 %	20 %	60 %	0 %	288559278
30	NC_013790	CCATT	2	10	30973	30982	20 %	40 %	0 %	40 %	288559278
31	NC_013790	GGATT	2	10	31136	31145	20 %	40 %	40 %	0 %	288559278
32	NC_013790	TGCTT	2	10	32694	32703	0 %	60 %	20 %	20 %	288559278
33	NC_013790	TTGTA	2	10	33146	33155	20 %	60 %	20 %	0 %	288559278
34	NC_013790	TTAAG	2	10	33493	33502	40 %	40 %	20 %	0 %	288559278
35	NC_013790	ATTTT	2	10	34724	34733	20 %	80 %	0 %	0 %	288559279
36	NC_013790	ATTAT	2	10	35092	35101	40 %	60 %	0 %	0 %	288559281
37	NC_013790	CTTAT	2	10	36535	36544	20 %	60 %	0 %	20 %	288559283
38	NC_013790	ATTTG	2	10	37998	38007	20 %	60 %	20 %	0 %	288559284
39	NC_013790	ATTGC	2	10	38230	38239	20 %	40 %	20 %	20 %	288559284
40	NC_013790	TTTTC	2	10	38638	38647	0 %	80 %	0 %	20 %	288559285
41	NC_013790	AGCCA	2	10	39377	39386	40 %	0 %	20 %	40 %	288559286
42	NC_013790	AAGAA	2	10	39773	39782	80 %	0 %	20 %	0 %	288559287
43	NC_013790	CATGA	2	10	41364	41373	40 %	20 %	20 %	20 %	288559288
44	NC_013790	ATATC	2	10	41380	41389	40 %	40 %	0 %	20 %	288559288
45	NC_013790	CTTGA	2	10	42738	42747	20 %	40 %	20 %	20 %	288559289
46	NC_013790	ATTTG	2	10	47205	47214	20 %	60 %	20 %	0 %	288559290
47	NC_013790	GAATA	2	10	47419	47428	60 %	20 %	20 %	0 %	288559290
48	NC_013790	TAATG	2	10	48642	48651	40 %	40 %	20 %	0 %	288559291
49	NC_013790	TTCTA	2	10	49120	49129	20 %	60 %	0 %	20 %	288559292
50	NC_013790	TTAGA	2	10	50952	50961	40 %	40 %	20 %	0 %	288559294
51	NC_013790	GTCAT	2	10	51185	51194	20 %	40 %	20 %	20 %	288559294
52	NC_013790	ATTTG	2	10	54028	54037	20 %	60 %	20 %	0 %	288559296
53	NC_013790	TTTTA	2	10	55018	55027	20 %	80 %	0 %	0 %	288559296
54	NC_013790	ATTGC	2	10	55530	55539	20 %	40 %	20 %	20 %	288559297
55	NC_013790	ATGGC	2	10	55710	55719	20 %	20 %	40 %	20 %	288559297
56	NC_013790	TTCTT	2	10	55899	55908	0 %	80 %	0 %	20 %	288559297
57	NC_013790	CATTT	2	10	56537	56546	20 %	60 %	0 %	20 %	288559297
58	NC_013790	GTTTG	2	10	56615	56624	0 %	60 %	40 %	0 %	288559297
59	NC_013790	ATATT	2	10	58351	58360	40 %	60 %	0 %	0 %	288559298
60	NC_013790	GGATT	2	10	60854	60863	20 %	40 %	40 %	0 %	288559299
61	NC_013790	CTTGA	2	10	61280	61289	20 %	40 %	20 %	20 %	288559299
62	NC_013790	CTTGA	2	10	61643	61652	20 %	40 %	20 %	20 %	288559299
63	NC_013790	TGATA	2	10	61780	61789	40 %	40 %	20 %	0 %	288559299
64	NC_013790	CTTGA	2	10	62375	62384	20 %	40 %	20 %	20 %	288559299
65	NC_013790	AAAAT	2	10	63613	63622	80 %	20 %	0 %	0 %	288559301
66	NC_013790	CTTTT	2	10	67285	67294	0 %	80 %	0 %	20 %	288559304
67	NC_013790	AATCA	2	10	70335	70344	60 %	20 %	0 %	20 %	288559306
68	NC_013790	AATGA	2	10	70803	70812	60 %	20 %	20 %	0 %	288559306
69	NC_013790	ATAAA	2	10	73740	73749	80 %	20 %	0 %	0 %	288559307
70	NC_013790	TCTAT	2	10	74204	74213	20 %	60 %	0 %	20 %	288559307
71	NC_013790	GAGAG	2	10	75024	75033	40 %	0 %	60 %	0 %	288559307
72	NC_013790	TTGAC	2	10	75078	75087	20 %	40 %	20 %	20 %	288559307
73	NC_013790	CTTTT	2	10	75186	75195	0 %	80 %	0 %	20 %	288559307
74	NC_013790	ATCCA	2	10	75505	75514	40 %	20 %	0 %	40 %	288559307
75	NC_013790	TCATC	2	10	79868	79877	20 %	40 %	0 %	40 %	288559312
76	NC_013790	CTTTT	2	10	80968	80977	0 %	80 %	0 %	20 %	288559314
77	NC_013790	GTATT	2	10	82454	82463	20 %	60 %	20 %	0 %	288559315
78	NC_013790	ATATT	2	10	85975	85984	40 %	60 %	0 %	0 %	288559319
79	NC_013790	TTTAT	2	10	87920	87929	20 %	80 %	0 %	0 %	288559320
80	NC_013790	GATTT	2	10	90142	90151	20 %	60 %	20 %	0 %	288559320
81	NC_013790	TGAGA	2	10	90401	90410	40 %	20 %	40 %	0 %	288559320
82	NC_013790	TGAAA	2	10	93897	93906	60 %	20 %	20 %	0 %	288559322
83	NC_013790	TGAAT	2	10	94386	94395	40 %	40 %	20 %	0 %	288559322
84	NC_013790	CATTT	2	10	95538	95547	20 %	60 %	0 %	20 %	288559322
85	NC_013790	TGATT	2	10	95812	95821	20 %	60 %	20 %	0 %	288559322
86	NC_013790	TATGG	2	10	96730	96739	20 %	40 %	40 %	0 %	288559323
87	NC_013790	CAGTA	2	10	97083	97092	40 %	20 %	20 %	20 %	288559323
88	NC_013790	ATGTC	2	10	100737	100746	20 %	40 %	20 %	20 %	288559324
89	NC_013790	GGAAT	2	10	101324	101333	40 %	20 %	40 %	0 %	288559324
90	NC_013790	TTTAG	2	10	102566	102575	20 %	60 %	20 %	0 %	288559324
91	NC_013790	CACTG	2	10	104420	104429	20 %	20 %	20 %	40 %	288559326
92	NC_013790	AAGAT	2	10	105751	105760	60 %	20 %	20 %	0 %	288559326
93	NC_013790	TGACC	2	10	106145	106154	20 %	20 %	20 %	40 %	288559326
94	NC_013790	TCACT	2	10	107326	107335	20 %	40 %	0 %	40 %	288559326
95	NC_013790	AAGGC	2	10	108064	108073	40 %	0 %	40 %	20 %	288559326
96	NC_013790	AAATT	2	10	108294	108303	60 %	40 %	0 %	0 %	288559326
97	NC_013790	TATAT	2	10	110170	110179	40 %	60 %	0 %	0 %	288559326
98	NC_013790	CTATT	2	10	110757	110766	20 %	60 %	0 %	20 %	288559326
99	NC_013790	CATTG	2	10	112221	112230	20 %	40 %	20 %	20 %	288559327
100	NC_013790	CTTAT	2	10	112266	112275	20 %	60 %	0 %	20 %	288559327
101	NC_013790	TCAAC	2	10	112549	112558	40 %	20 %	0 %	40 %	288559327
102	NC_013790	TCATT	2	10	112982	112991	20 %	60 %	0 %	20 %	288559327
103	NC_013790	ACAGT	2	10	113524	113533	40 %	20 %	20 %	20 %	288559328
104	NC_013790	TTTTA	2	10	114140	114149	20 %	80 %	0 %	0 %	288559329
105	NC_013790	TTCTA	2	10	116164	116173	20 %	60 %	0 %	20 %	288559330
106	NC_013790	GCAAT	2	10	118154	118163	40 %	20 %	20 %	20 %	288559330
107	NC_013790	ATGAG	2	10	120179	120188	40 %	20 %	40 %	0 %	288559331
108	NC_013790	AAAGA	2	10	121339	121348	80 %	0 %	20 %	0 %	288559332
109	NC_013790	ACCAA	2	10	122552	122561	60 %	0 %	0 %	40 %	288559333
110	NC_013790	AATTC	2	10	122992	123001	40 %	40 %	0 %	20 %	288559333
111	NC_013790	TTATG	2	10	124267	124276	20 %	60 %	20 %	0 %	288559334
112	NC_013790	GAGAT	2	10	125559	125568	40 %	20 %	40 %	0 %	288559334
113	NC_013790	GATAA	2	10	127265	127274	60 %	20 %	20 %	0 %	288559334
114	NC_013790	CATTG	2	10	127321	127330	20 %	40 %	20 %	20 %	288559334
115	NC_013790	TTCAA	2	10	127534	127543	40 %	40 %	0 %	20 %	288559334
116	NC_013790	TGGCC	2	10	130630	130639	0 %	20 %	40 %	40 %	288559335
117	NC_013790	GGATG	2	10	131894	131903	20 %	20 %	60 %	0 %	288559335
118	NC_013790	AATAC	2	10	134501	134510	60 %	20 %	0 %	20 %	288559335
119	NC_013790	ACCTT	2	10	135240	135249	20 %	40 %	0 %	40 %	288559335
120	NC_013790	TGTAT	2	10	135559	135568	20 %	60 %	20 %	0 %	288559335
121	NC_013790	ATTGT	2	10	135655	135664	20 %	60 %	20 %	0 %	288559335
122	NC_013790	ATTAG	2	10	136535	136544	40 %	40 %	20 %	0 %	288559335
123	NC_013790	ATTCC	2	10	138642	138651	20 %	40 %	0 %	40 %	288559335
124	NC_013790	ACAAT	2	10	138762	138771	60 %	20 %	0 %	20 %	288559335
125	NC_013790	AAACC	2	10	139072	139081	60 %	0 %	0 %	40 %	288559335
126	NC_013790	ATTAT	2	10	144331	144340	40 %	60 %	0 %	0 %	288559337
127	NC_013790	TAAAT	2	10	144545	144554	60 %	40 %	0 %	0 %	288559337
128	NC_013790	ATACA	2	10	147038	147047	60 %	20 %	0 %	20 %	288559338
129	NC_013790	ATACT	2	10	150627	150636	40 %	40 %	0 %	20 %	288559340
130	NC_013790	AATGG	2	10	151339	151348	40 %	20 %	40 %	0 %	288559340
131	NC_013790	AAAGA	2	10	153287	153296	80 %	0 %	20 %	0 %	288559341
132	NC_013790	TTAAC	2	10	160164	160173	40 %	40 %	0 %	20 %	288559342
133	NC_013790	TAACT	2	10	162544	162553	40 %	40 %	0 %	20 %	288559342
134	NC_013790	ACATT	2	10	163158	163167	40 %	40 %	0 %	20 %	288559342
135	NC_013790	GCAAT	2	10	164322	164331	40 %	20 %	20 %	20 %	288559342
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