MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Methanobrevibacter ruminantium M1 chromosome

Total Repeats: 3630

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013790	TAAA	2	8	1453	1460	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_013790	ATTA	2	8	1586	1593	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_013790	AGAA	2	8	2381	2388	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_013790	ATTT	2	8	2424	2431	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_013790	TAGT	2	8	2456	2463	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NC_013790	AATT	2	8	4859	4866	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_013790	TTAA	2	8	5017	5024	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_013790	TTCT	2	8	8818	8825	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
9	NC_013790	ATTC	2	8	9597	9604	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NC_013790	TAAT	2	8	10442	10449	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_013790	ATTA	2	8	10642	10649	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_013790	ATTT	2	8	10694	10701	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_013790	ATTA	2	8	10843	10850	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_013790	ATTT	2	8	14614	14621	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_013790	ATTT	2	8	16530	16537	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_013790	TATT	2	8	16576	16583	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_013790	TTAT	2	8	17337	17344	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_013790	TATC	2	8	17378	17385	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
19	NC_013790	TCTA	2	8	17485	17492	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
20	NC_013790	TTAT	2	8	17519	17526	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_013790	TTAA	2	8	17696	17703	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_013790	ACTT	2	8	17768	17775	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
23	NC_013790	TAAA	2	8	19747	19754	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_013790	TTAA	2	8	19781	19788	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_013790	ATTA	2	8	27632	27639	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_013790	TAAT	2	8	27671	27678	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_013790	TTAA	2	8	27686	27693	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_013790	TTCT	2	8	33797	33804	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
29	NC_013790	ATAA	2	8	34808	34815	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_013790	TATT	2	8	34816	34823	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_013790	AAAT	2	8	35550	35557	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_013790	CCAC	2	8	40910	40917	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
33	NC_013790	AACT	2	8	41012	41019	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
34	NC_013790	ATTA	2	8	41709	41716	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_013790	ATTA	2	8	41788	41795	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_013790	ATTA	2	8	41820	41827	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_013790	TTAA	2	8	46376	46383	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_013790	AATC	2	8	46577	46584	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
39	NC_013790	TAAT	2	8	47790	47797	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_013790	ATTG	2	8	49871	49878	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_013790	ATTT	2	8	53380	53387	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_013790	ATTT	2	8	53420	53427	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_013790	ATTT	2	8	53460	53467	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_013790	ATTT	2	8	53500	53507	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_013790	ATTA	2	8	56923	56930	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_013790	ATTT	2	8	56932	56939	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_013790	TTCT	2	8	58546	58553	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
48	NC_013790	TTAA	2	8	58582	58589	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_013790	AATT	2	8	59188	59195	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_013790	TATT	2	8	62821	62828	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_013790	ATTA	2	8	63423	63430	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_013790	AAAT	2	8	65224	65231	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_013790	TATT	2	8	65494	65501	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_013790	TTTA	2	8	65543	65550	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_013790	ATTT	2	8	66090	66097	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_013790	TATT	2	8	66115	66122	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_013790	AATT	2	8	69434	69441	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_013790	TAAT	2	8	69516	69523	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_013790	TGGC	2	8	69593	69600	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
60	NC_013790	ATTT	2	8	72852	72859	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_013790	TTTA	2	8	72894	72901	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_013790	ATTT	2	8	72976	72983	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_013790	ATAA	2	8	73015	73022	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_013790	TAAA	2	8	73343	73350	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_013790	TATT	2	8	73412	73419	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_013790	TAGT	2	8	73462	73469	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
67	NC_013790	TAGT	2	8	73574	73581	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
68	NC_013790	TAGT	2	8	73603	73610	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
69	NC_013790	AATT	2	8	75681	75688	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_013790	TATT	2	8	75691	75698	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_013790	ATTT	2	8	75706	75713	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_013790	ATGG	2	8	75783	75790	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_013790	TAAT	2	8	75867	75874	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_013790	TTAA	2	8	75917	75924	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_013790	TAAT	2	8	76008	76015	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_013790	GTAT	2	8	76065	76072	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
77	NC_013790	ATTT	2	8	77201	77208	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_013790	TAGT	2	8	77219	77226	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
79	NC_013790	ATTG	2	8	77247	77254	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
80	NC_013790	GATA	2	8	77342	77349	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
81	NC_013790	TTAG	2	8	77368	77375	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
82	NC_013790	TAAA	2	8	77410	77417	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_013790	ATTT	2	8	77441	77448	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_013790	TTAT	2	8	77827	77834	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_013790	ATTT	2	8	78215	78222	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_013790	TAAA	2	8	79406	79413	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_013790	ATTT	2	8	79607	79614	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_013790	TTAG	2	8	79623	79630	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
89	NC_013790	ATTG	2	8	79652	79659	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
90	NC_013790	CAGA	2	8	80330	80337	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
91	NC_013790	ATTA	2	8	80572	80579	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_013790	TTAT	2	8	80662	80669	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_013790	TCTT	2	8	83653	83660	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
94	NC_013790	GATT	2	8	84122	84129	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
95	NC_013790	TATC	2	8	87070	87077	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
96	NC_013790	CATT	2	8	87384	87391	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
97	NC_013790	TAAA	2	8	92362	92369	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_013790	ATTA	2	8	95989	95996	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_013790	ATTT	2	8	96059	96066	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_013790	ATAA	2	8	96409	96416	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_013790	GCTT	2	8	97547	97554	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
102	NC_013790	ATTT	2	8	98211	98218	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_013790	ATTT	2	8	98222	98229	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_013790	CTTA	2	8	98630	98637	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
105	NC_013790	ACTT	2	8	98640	98647	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
106	NC_013790	AAAG	2	8	98872	98879	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
107	NC_013790	TGAT	2	8	98966	98973	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
108	NC_013790	ATTA	2	8	99033	99040	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_013790	GTTA	2	8	99077	99084	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
110	NC_013790	TTAC	2	8	99738	99745	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
111	NC_013790	TTTA	2	8	100067	100074	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_013790	ACTT	2	8	100110	100117	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
113	NC_013790	CTTA	2	8	100144	100151	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
114	NC_013790	ACTT	2	8	100252	100259	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
115	NC_013790	TTAT	2	8	100298	100305	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_013790	TTAC	2	8	100327	100334	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
117	NC_013790	TTAC	2	8	100360	100367	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
118	NC_013790	ACTT	2	8	100406	100413	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
119	NC_013790	TATT	2	8	102667	102674	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_013790	ATTT	3	12	103177	103188	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_013790	TAAT	2	8	103304	103311	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_013790	ATTA	2	8	103353	103360	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_013790	TTAT	2	8	113945	113952	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_013790	GTAT	2	8	115132	115139	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
125	NC_013790	TGGT	2	8	115162	115169	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
126	NC_013790	TTTA	2	8	115180	115187	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_013790	TTTA	2	8	115287	115294	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_013790	TCAA	2	8	115407	115414	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
129	NC_013790	ATTT	2	8	118389	118396	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_013790	CTTT	2	8	118602	118609	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
131	NC_013790	TTAA	2	8	121558	121565	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_013790	TAAT	2	8	123220	123227	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_013790	TAAT	2	8	123239	123246	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_013790	GTTT	2	8	130072	130079	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
135	NC_013790	TAAT	2	8	130139	130146	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_013790	ATTC	2	8	130214	130221	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
137	NC_013790	TATT	2	8	130272	130279	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_013790	TATC	2	8	130428	130435	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
139	NC_013790	TAAT	2	8	130491	130498	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_013790	TTAC	2	8	130513	130520	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
141	NC_013790	ACTG	2	8	139778	139785	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
142	NC_013790	TAAT	2	8	139974	139981	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_013790	TAGA	2	8	140685	140692	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
144	NC_013790	ATTA	2	8	141777	141784	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_013790	TTAT	2	8	141810	141817	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_013790	ATTA	2	8	141857	141864	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_013790	ATTA	2	8	141898	141905	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_013790	TAAT	2	8	141922	141929	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_013790	AATA	2	8	145952	145959	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_013790	TAAT	2	8	147641	147648	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_013790	TATT	2	8	147667	147674	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_013790	AAAT	2	8	147870	147877	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_013790	TAAT	2	8	147907	147914	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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