MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Methanobrevibacter ruminantium M1 chromosome

Total Repeats: 40633

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013790	GAA	2	6	28	33	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	288559259
2	NC_013790	ATC	2	6	74	79	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	288559259
3	NC_013790	CTG	3	9	209	217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288559259
4	NC_013790	AGC	2	6	233	238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288559259
5	NC_013790	AAG	2	6	411	416	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	288559259
6	NC_013790	TTC	2	6	470	475	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	288559259
7	NC_013790	ATA	2	6	521	526	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	288559259
8	NC_013790	AGC	2	6	589	594	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288559259
9	NC_013790	ATG	2	6	626	631	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	288559259
10	NC_013790	GAA	2	6	679	684	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	288559259
11	NC_013790	GAA	2	6	694	699	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	288559259
12	NC_013790	GCT	2	6	727	732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288559259
13	NC_013790	GAA	2	6	736	741	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	288559259
14	NC_013790	GAA	2	6	796	801	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	288559259
15	NC_013790	TAA	2	6	858	863	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	288559259
16	NC_013790	TTA	3	9	875	883	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	288559259
17	NC_013790	AGA	2	6	1012	1017	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	288559259
18	NC_013790	ATT	2	6	1105	1110	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	288559259
19	NC_013790	CTG	2	6	1151	1156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288559259
20	NC_013790	ATT	2	6	1242	1247	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_013790	TTA	2	6	1253	1258	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_013790	GAT	2	6	1280	1285	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_013790	CAT	2	6	1419	1424	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_013790	TAA	2	6	1473	1478	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_013790	AAT	2	6	1509	1514	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_013790	TAA	2	6	1538	1543	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_013790	GTA	2	6	1767	1772	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	288559260
28	NC_013790	AGG	2	6	1820	1825	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	288559260
29	NC_013790	AAT	2	6	1850	1855	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	288559260
30	NC_013790	GTT	2	6	1995	2000	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	288559260
31	NC_013790	CAA	2	6	2091	2096	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	288559260
32	NC_013790	TGT	2	6	2234	2239	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	288559260
33	NC_013790	TTA	2	6	2284	2289	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	288559260
34	NC_013790	AAT	2	6	2411	2416	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_013790	GAT	2	6	2432	2437	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_013790	TTA	3	9	2438	2446	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_013790	TTG	2	6	2698	2703	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	288559261
38	NC_013790	TTG	2	6	2815	2820	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	288559261
39	NC_013790	ACA	2	6	2824	2829	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	288559261
40	NC_013790	AGA	2	6	2977	2982	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	288559261
41	NC_013790	TCT	2	6	3148	3153	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	288559261
42	NC_013790	TCA	2	6	3248	3253	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	288559261
43	NC_013790	ATC	2	6	3330	3335	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	288559261
44	NC_013790	TTA	2	6	3423	3428	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	288559261
45	NC_013790	GTT	2	6	3483	3488	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	288559261
46	NC_013790	TAT	2	6	3504	3509	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	288559261
47	NC_013790	ATA	2	6	3639	3644	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	288559261
48	NC_013790	ATA	2	6	3901	3906	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	288559261
49	NC_013790	TCC	2	6	3966	3971	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	288559261
50	NC_013790	AGA	2	6	4099	4104	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	288559261
51	NC_013790	CAA	2	6	4270	4275	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	288559261
52	NC_013790	ATG	2	6	4309	4314	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	288559261
53	NC_013790	AGA	2	6	4337	4342	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	288559261
54	NC_013790	ATG	2	6	4380	4385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	288559261
55	NC_013790	ATA	2	6	4386	4391	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	288559261
56	NC_013790	TGT	2	6	4424	4429	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	288559261
57	NC_013790	TCT	2	6	4448	4453	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	288559261
58	NC_013790	TAT	2	6	4553	4558	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	288559261
59	NC_013790	TTA	2	6	4589	4594	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	288559261
60	NC_013790	TTG	2	6	4605	4610	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	288559261
61	NC_013790	AGT	2	6	4771	4776	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	288559261
62	NC_013790	ACA	2	6	4939	4944	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_013790	CTT	2	6	4949	4954	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_013790	TAA	2	6	5003	5008	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_013790	ATT	2	6	5038	5043	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_013790	TGA	3	9	5071	5079	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_013790	TCG	2	6	5282	5287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288559262
68	NC_013790	TCA	2	6	5642	5647	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	288559262
69	NC_013790	TGT	2	6	5655	5660	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	288559262
70	NC_013790	TAC	2	6	5731	5736	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	288559262
71	NC_013790	TGA	2	6	5802	5807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	288559262
72	NC_013790	TCT	2	6	5822	5827	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	288559262
73	NC_013790	ATC	2	6	5890	5895	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	288559262
74	NC_013790	TCC	2	6	5971	5976	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	288559262
75	NC_013790	GAG	2	6	6016	6021	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	288559262
76	NC_013790	GAG	2	6	6055	6060	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	288559262
77	NC_013790	TCT	2	6	6377	6382	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	288559262
78	NC_013790	TTC	2	6	6427	6432	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	288559262
79	NC_013790	TCT	2	6	6509	6514	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	288559262
80	NC_013790	TCT	2	6	6545	6550	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	288559262
81	NC_013790	AAG	2	6	6703	6708	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	288559262
82	NC_013790	TCC	2	6	6736	6741	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	288559262
83	NC_013790	TCT	2	6	6809	6814	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	288559262
84	NC_013790	TCC	2	6	6889	6894	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	288559262
85	NC_013790	TCC	2	6	6928	6933	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	288559262
86	NC_013790	TCC	2	6	7084	7089	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	288559262
87	NC_013790	CAT	2	6	7146	7151	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	288559262
88	NC_013790	TTC	2	6	7168	7173	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	288559262
89	NC_013790	CAG	2	6	7251	7256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288559262
90	NC_013790	ATT	2	6	7273	7278	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	288559262
91	NC_013790	TTC	2	6	7294	7299	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	288559262
92	NC_013790	TTA	2	6	7304	7309	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	288559262
93	NC_013790	TAC	2	6	7348	7353	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	288559262
94	NC_013790	TCA	2	6	7355	7360	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	288559262
95	NC_013790	GCA	2	6	7361	7366	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288559262
96	NC_013790	AAT	2	6	7444	7449	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	288559262
97	NC_013790	TCC	2	6	7479	7484	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
98	NC_013790	ATT	2	6	7485	7490	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_013790	ATT	2	6	7506	7511	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_013790	TAT	2	6	7550	7555	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_013790	CAT	2	6	7846	7851	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	288559263
102	NC_013790	ATG	2	6	8016	8021	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	288559263
103	NC_013790	CAT	2	6	8128	8133	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	288559263
104	NC_013790	AAG	2	6	8189	8194	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	288559263
105	NC_013790	TTA	2	6	8353	8358	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	288559263
106	NC_013790	CTG	2	6	8424	8429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288559263
107	NC_013790	TTG	2	6	8503	8508	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	288559263
108	NC_013790	AAT	2	6	8520	8525	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	288559263
109	NC_013790	ATT	2	6	8651	8656	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	288559263
110	NC_013790	ATA	2	6	8667	8672	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	288559263
111	NC_013790	TAT	2	6	8722	8727	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_013790	ATT	2	6	8776	8781	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_013790	GTT	2	6	8841	8846	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	288559264
114	NC_013790	TGG	2	6	8914	8919	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	288559264
115	NC_013790	TAT	2	6	8959	8964	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	288559264
116	NC_013790	TTC	2	6	9070	9075	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	288559264
117	NC_013790	TAG	2	6	9306	9311	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	288559264
118	NC_013790	ATT	2	6	9380	9385	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_013790	TAT	2	6	9387	9392	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_013790	AAT	2	6	9406	9411	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_013790	ATA	2	6	9423	9428	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_013790	ATA	2	6	9437	9442	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_013790	TAT	2	6	9454	9459	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_013790	CTT	2	6	9468	9473	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_013790	AAT	2	6	9485	9490	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_013790	ATT	2	6	9524	9529	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_013790	TAT	2	6	9583	9588	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_013790	TTC	2	6	9619	9624	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	288559265
129	NC_013790	TTA	2	6	9627	9632	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	288559265
130	NC_013790	ATC	2	6	9791	9796	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	288559265
131	NC_013790	ATC	2	6	9994	9999	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	288559265
132	NC_013790	CTT	2	6	10005	10010	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	288559265
133	NC_013790	TCT	2	6	10247	10252	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	288559265
134	NC_013790	ATT	2	6	10484	10489	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_013790	GGT	2	6	10510	10515	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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265	NC_013790	TTC	2	6	19964	19969	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	288559273
266	NC_013790	GAT	2	6	19980	19985	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	288559273
267	NC_013790	TCT	2	6	19986	19991	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	288559273
268	NC_013790	TTC	2	6	20012	20017	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	288559273
269	NC_013790	ATT	2	6	20035	20040	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	288559273
270	NC_013790	TCT	2	6	20070	20075	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	288559273
271	NC_013790	ATC	2	6	20078	20083	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	288559273
272	NC_013790	ACT	2	6	20115	20120	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	288559273
273	NC_013790	TGA	2	6	20300	20305	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	288559273
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280	NC_013790	ACT	2	6	21055	21060	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	288559273
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289	NC_013790	TAC	2	6	21720	21725	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	288559273
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