MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Methanobrevibacter ruminantium M1 chromosome

Total Repeats: 31780

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013790	GAA	2	6	28	33	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	288559259
2	NC_013790	ATC	2	6	74	79	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	288559259
3	NC_013790	CTG	3	9	209	217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288559259
4	NC_013790	AGC	2	6	233	238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288559259
5	NC_013790	AAG	2	6	411	416	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	288559259
6	NC_013790	TTC	2	6	470	475	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	288559259
7	NC_013790	ATA	2	6	521	526	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	288559259
8	NC_013790	AGC	2	6	589	594	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288559259
9	NC_013790	ATG	2	6	626	631	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	288559259
10	NC_013790	GAA	2	6	679	684	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	288559259
11	NC_013790	GAA	2	6	694	699	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	288559259
12	NC_013790	GCT	2	6	727	732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288559259
13	NC_013790	GAA	2	6	736	741	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	288559259
14	NC_013790	GAA	2	6	796	801	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	288559259
15	NC_013790	TAA	2	6	858	863	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	288559259
16	NC_013790	TTA	3	9	875	883	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	288559259
17	NC_013790	AGA	2	6	1012	1017	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	288559259
18	NC_013790	ATT	2	6	1105	1110	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	288559259
19	NC_013790	CTG	2	6	1151	1156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288559259
20	NC_013790	GTA	2	6	1767	1772	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	288559260
21	NC_013790	AGG	2	6	1820	1825	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	288559260
22	NC_013790	AAT	2	6	1850	1855	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	288559260
23	NC_013790	GTT	2	6	1995	2000	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	288559260
24	NC_013790	CAA	2	6	2091	2096	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	288559260
25	NC_013790	TGT	2	6	2234	2239	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	288559260
26	NC_013790	TTA	2	6	2284	2289	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	288559260
27	NC_013790	TTG	2	6	2698	2703	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	288559261
28	NC_013790	TTG	2	6	2815	2820	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	288559261
29	NC_013790	ACA	2	6	2824	2829	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	288559261
30	NC_013790	AGA	2	6	2977	2982	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	288559261
31	NC_013790	TCT	2	6	3148	3153	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	288559261
32	NC_013790	TCA	2	6	3248	3253	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	288559261
33	NC_013790	ATC	2	6	3330	3335	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	288559261
34	NC_013790	TTA	2	6	3423	3428	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	288559261
35	NC_013790	GTT	2	6	3483	3488	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	288559261
36	NC_013790	TAT	2	6	3504	3509	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	288559261
37	NC_013790	ATA	2	6	3639	3644	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	288559261
38	NC_013790	ATA	2	6	3901	3906	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	288559261
39	NC_013790	TCC	2	6	3966	3971	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	288559261
40	NC_013790	AGA	2	6	4099	4104	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	288559261
41	NC_013790	CAA	2	6	4270	4275	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	288559261
42	NC_013790	ATG	2	6	4309	4314	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	288559261
43	NC_013790	AGA	2	6	4337	4342	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	288559261
44	NC_013790	ATG	2	6	4380	4385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	288559261
45	NC_013790	ATA	2	6	4386	4391	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	288559261
46	NC_013790	TGT	2	6	4424	4429	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	288559261
47	NC_013790	TCT	2	6	4448	4453	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	288559261
48	NC_013790	TAT	2	6	4553	4558	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	288559261
49	NC_013790	TTA	2	6	4589	4594	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	288559261
50	NC_013790	TTG	2	6	4605	4610	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	288559261
51	NC_013790	AGT	2	6	4771	4776	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	288559261
52	NC_013790	TCG	2	6	5282	5287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288559262
53	NC_013790	TCA	2	6	5642	5647	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	288559262
54	NC_013790	TGT	2	6	5655	5660	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	288559262
55	NC_013790	TAC	2	6	5731	5736	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	288559262
56	NC_013790	TGA	2	6	5802	5807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	288559262
57	NC_013790	TCT	2	6	5822	5827	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	288559262
58	NC_013790	ATC	2	6	5890	5895	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	288559262
59	NC_013790	TCC	2	6	5971	5976	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	288559262
60	NC_013790	GAG	2	6	6016	6021	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	288559262
61	NC_013790	GAG	2	6	6055	6060	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	288559262
62	NC_013790	TCT	2	6	6377	6382	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	288559262
63	NC_013790	TTC	2	6	6427	6432	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	288559262
64	NC_013790	TCT	2	6	6509	6514	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	288559262
65	NC_013790	TCT	2	6	6545	6550	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	288559262
66	NC_013790	AAG	2	6	6703	6708	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	288559262
67	NC_013790	TCC	2	6	6736	6741	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	288559262
68	NC_013790	TCT	2	6	6809	6814	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	288559262
69	NC_013790	TCC	2	6	6889	6894	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	288559262
70	NC_013790	TCC	2	6	6928	6933	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	288559262
71	NC_013790	TCC	2	6	7084	7089	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	288559262
72	NC_013790	CAT	2	6	7146	7151	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	288559262
73	NC_013790	TTC	2	6	7168	7173	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	288559262
74	NC_013790	CAG	2	6	7251	7256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288559262
75	NC_013790	ATT	2	6	7273	7278	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	288559262
76	NC_013790	TTC	2	6	7294	7299	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	288559262
77	NC_013790	TTA	2	6	7304	7309	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	288559262
78	NC_013790	TAC	2	6	7348	7353	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	288559262
79	NC_013790	TCA	2	6	7355	7360	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	288559262
80	NC_013790	GCA	2	6	7361	7366	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288559262
81	NC_013790	AAT	2	6	7444	7449	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	288559262
82	NC_013790	CAT	2	6	7846	7851	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	288559263
83	NC_013790	ATG	2	6	8016	8021	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	288559263
84	NC_013790	CAT	2	6	8128	8133	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	288559263
85	NC_013790	AAG	2	6	8189	8194	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	288559263
86	NC_013790	TTA	2	6	8353	8358	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	288559263
87	NC_013790	CTG	2	6	8424	8429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288559263
88	NC_013790	TTG	2	6	8503	8508	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	288559263
89	NC_013790	AAT	2	6	8520	8525	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	288559263
90	NC_013790	ATT	2	6	8651	8656	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	288559263
91	NC_013790	ATA	2	6	8667	8672	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	288559263
92	NC_013790	GTT	2	6	8841	8846	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	288559264
93	NC_013790	TGG	2	6	8914	8919	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	288559264
94	NC_013790	TAT	2	6	8959	8964	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	288559264
95	NC_013790	TTC	2	6	9070	9075	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	288559264
96	NC_013790	TAG	2	6	9306	9311	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	288559264
97	NC_013790	TTC	2	6	9619	9624	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	288559265
98	NC_013790	TTA	2	6	9627	9632	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	288559265
99	NC_013790	ATC	2	6	9791	9796	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	288559265
100	NC_013790	ATC	2	6	9994	9999	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	288559265
101	NC_013790	CTT	2	6	10005	10010	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	288559265
102	NC_013790	TCT	2	6	10247	10252	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	288559265
103	NC_013790	TAT	2	6	10980	10985	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	288559266
104	NC_013790	GGA	3	9	10994	11002	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	288559266
105	NC_013790	CTT	2	6	11005	11010	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	288559266
106	NC_013790	AAT	2	6	11029	11034	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	288559266
107	NC_013790	AGA	2	6	11088	11093	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	288559266
108	NC_013790	TGG	2	6	11278	11283	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	288559266
109	NC_013790	CTT	3	9	11312	11320	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	288559266
110	NC_013790	ATT	2	6	11351	11356	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	288559266
111	NC_013790	TAA	2	6	11433	11438	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	288559266
112	NC_013790	TCT	2	6	11518	11523	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	288559266
113	NC_013790	GCA	2	6	11546	11551	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288559266
114	NC_013790	TTA	2	6	11658	11663	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	288559266
115	NC_013790	TCA	2	6	11732	11737	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	288559266
116	NC_013790	TGT	2	6	11782	11787	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	288559266
117	NC_013790	ATC	2	6	11905	11910	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	288559266
118	NC_013790	TTG	2	6	11964	11969	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	288559266
119	NC_013790	AGC	2	6	12005	12010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288559266
120	NC_013790	TTG	2	6	12024	12029	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	288559266
121	NC_013790	TTA	3	9	12195	12203	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	288559266
122	NC_013790	ATT	2	6	12272	12277	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	288559266
123	NC_013790	TGT	2	6	12283	12288	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	288559266
124	NC_013790	TTC	2	6	12754	12759	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	288559267
125	NC_013790	GAA	2	6	12829	12834	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	288559267
126	NC_013790	TAT	2	6	12927	12932	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	288559267
127	NC_013790	TAT	2	6	13009	13014	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	288559267
128	NC_013790	TCT	2	6	13019	13024	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	288559267
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130	NC_013790	TAG	2	6	13139	13144	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	288559267
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