MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Cyanobacterium UCYN-A

Total Repeats: 702

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013771	TTAACT	2	12	5448	5459	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_013771	GATCTT	2	12	5747	5758	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	284928604
3	NC_013771	AAAATT	2	12	12249	12260	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_013771	AATTAA	2	12	16300	16311	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_013771	CTATTA	2	12	22636	22647	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	284928618
6	NC_013771	TTAGAC	2	12	23639	23650	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	284928619
7	NC_013771	TTGAAT	2	12	24396	24407	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	284928619
8	NC_013771	TTTAAA	2	12	28735	28746	50 %	50 %	0 %	0 %	284928620
9	NC_013771	AACAGT	2	12	29589	29600	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	284928621
10	NC_013771	TGCTTC	2	12	30393	30404	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	284928621
11	NC_013771	ACCCTT	2	12	30499	30510	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	284928621
12	NC_013771	TTCGTT	2	12	35869	35880	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	284928625
13	NC_013771	ATATGA	2	12	37971	37982	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_013771	TATTTT	2	12	38002	38013	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_013771	TATGGA	2	12	38458	38469	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284928627
16	NC_013771	TTAAAA	2	12	38770	38781	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	284928627
17	NC_013771	TAAAAA	2	12	39362	39373	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_013771	TCTTTG	2	12	40127	40138	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	284928629
19	NC_013771	ACGTAA	2	12	41743	41754	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	284928630
20	NC_013771	AATAAA	2	12	45075	45086	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	284928633
21	NC_013771	TACTGC	2	12	48018	48029	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	284928634
22	NC_013771	CTTGTT	2	12	48371	48382	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	284928634
23	NC_013771	GGTATA	2	12	51456	51467	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284928637
24	NC_013771	ATTAGA	2	12	53082	53093	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	284928639
25	NC_013771	CAATAG	2	12	55173	55184	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	284928641
26	NC_013771	CAGTTG	2	12	59549	59560	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	284928643
27	NC_013771	ATCAAA	2	12	61098	61109	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	284928645
28	NC_013771	CTTTTT	2	12	61277	61288	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	284928645
29	NC_013771	AGTAGA	2	12	76739	76750	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	284928659
30	NC_013771	AAGAGA	2	12	82960	82971	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284928663
31	NC_013771	TAACAT	2	12	83029	83040	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	284928663
32	NC_013771	TCGTTC	2	12	86102	86113	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	284928667
33	NC_013771	CAGAAA	2	12	87309	87320	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	284928668
34	NC_013771	AGCTTT	2	12	89530	89541	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	284928671
35	NC_013771	GAAAGA	2	12	90391	90402	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284928672
36	NC_013771	GGTATT	2	12	90748	90759	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	284928672
37	NC_013771	GGATTT	2	12	91255	91266	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	284928672
38	NC_013771	TTTTAT	2	12	93170	93181	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_013771	TTTAGA	2	12	98113	98124	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	284928678
40	NC_013771	AAAATT	2	12	98520	98531	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	284928678
41	NC_013771	TAAAAG	2	12	99235	99246	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_013771	AAAGAG	2	12	100078	100089	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284928680
43	NC_013771	AAACTA	2	12	104692	104703	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	284928684
44	NC_013771	TTAGCC	2	12	110939	110950	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	284928691
45	NC_013771	AAAGAT	2	12	116441	116452	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	284928696
46	NC_013771	TGCTAA	2	12	119477	119488	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	284928700
47	NC_013771	AATTTT	2	12	127387	127398	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_013771	TTGCAA	2	12	131271	131282	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	284928711
49	NC_013771	ATTACC	2	12	132652	132663	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284928712
50	NC_013771	CAATTT	2	12	134819	134830	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	284928714
51	NC_013771	ATTTGA	2	12	135561	135572	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	284928715
52	NC_013771	TTTTAA	2	12	140950	140961	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_013771	CTAACT	2	12	142623	142634	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284928721
54	NC_013771	TGAGCT	2	12	144659	144670	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	284928723
55	NC_013771	TAATGG	2	12	146065	146076	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284928726
56	NC_013771	GAATAG	2	12	146202	146213	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	284928726
57	NC_013771	AATTAA	2	12	152424	152435	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	284928732
58	NC_013771	ACTATA	2	12	155038	155049	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	284928734
59	NC_013771	TTTAGC	2	12	158323	158334	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	284928736
60	NC_013771	TTCTGT	2	12	159745	159756	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	284928737
61	NC_013771	AGATAA	2	12	161765	161776	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	284928738
62	NC_013771	TGATTA	2	12	163160	163171	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	284928739
63	NC_013771	TTTTTA	2	12	164771	164782	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_013771	AATATT	2	12	166770	166781	50 %	50 %	0 %	0 %	284928742
65	NC_013771	ATTAGG	2	12	170128	170139	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284928745
66	NC_013771	AACTAA	2	12	171412	171423	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_013771	TACAAG	2	12	173065	173076	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	284928749
68	NC_013771	ATTAAA	2	12	173271	173282	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	284928749
69	NC_013771	TAATTT	2	12	178388	178399	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284928753
70	NC_013771	CTTGGC	2	12	178700	178711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284928753
71	NC_013771	TAAAGA	2	12	182045	182056	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	284928756
72	NC_013771	TAAAAG	2	12	184404	184415	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_013771	TAATTA	2	12	187061	187072	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_013771	AACAAA	2	12	188509	188520	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	284928763
75	NC_013771	CTTCTG	2	12	191366	191377	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	284928766
76	NC_013771	CTAATG	2	12	191792	191803	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	284928766
77	NC_013771	AGCTGA	2	12	193430	193441	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	284928767
78	NC_013771	CCAGAA	2	12	195407	195418	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	284928768
79	NC_013771	GCAGAA	2	12	195671	195682	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	284928768
80	NC_013771	CAGATG	2	12	195915	195926	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	284928768
81	NC_013771	TTAAAT	2	12	196313	196324	50 %	50 %	0 %	0 %	284928768
82	NC_013771	ATAAAA	2	12	198389	198400	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_013771	TATTAA	2	12	200257	200268	50 %	50 %	0 %	0 %	284928773
84	NC_013771	TCCAAA	2	12	200742	200753	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	284928773
85	NC_013771	ATTTTT	2	12	201108	201119	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	284928773
86	NC_013771	ACATCT	2	12	202046	202057	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284928774
87	NC_013771	AGGTAG	2	12	202407	202418	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	284928774
88	NC_013771	AGATTT	2	12	204061	204072	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_013771	ACAATA	2	12	207593	207604	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	284928780
90	NC_013771	GCTAAT	2	12	209506	209517	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_013771	TTATAT	2	12	212104	212115	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_013771	TATTGT	2	12	212813	212824	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	284928784
93	NC_013771	CAAATC	2	12	215979	215990	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	284928786
94	NC_013771	GAAGTG	2	12	217819	217830	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	284928788
95	NC_013771	TTTCTA	2	12	221499	221510	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	284928792
96	NC_013771	GTAAAA	2	12	229871	229882	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	284928801
97	NC_013771	ACATTT	2	12	230640	230651	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_013771	ATATTG	2	12	231477	231488	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	284928802
99	NC_013771	AAAAGA	2	12	235242	235253	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	284928804
100	NC_013771	ATTCCT	2	12	236498	236509	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	284928805
101	NC_013771	AGATTG	2	12	237169	237180	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284928805
102	NC_013771	AGTAAA	2	12	238794	238805	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	284928806
103	NC_013771	AATTAA	2	12	239766	239777	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	284928807
104	NC_013771	ACAAAA	2	12	241154	241165	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	284928808
105	NC_013771	GTATCT	3	18	249569	249586	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	284928812
106	NC_013771	AAATAT	2	12	249920	249931	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_013771	TAAAAG	2	12	251447	251458	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	284928814
108	NC_013771	GCTACA	2	12	254101	254112	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	284928816
109	NC_013771	CTGTAA	2	12	254307	254318	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	284928816
110	NC_013771	AACTTT	2	12	256693	256704	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
111	NC_013771	TTAAGT	2	12	259264	259275	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	284928819
112	NC_013771	TGCTCA	2	12	262298	262309	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	284928821
113	NC_013771	TCTTTT	2	12	262359	262370	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	284928821
114	NC_013771	TTTATA	2	12	262971	262982	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_013771	TATTTT	2	12	263201	263212	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	284928822
116	NC_013771	GCACCA	2	12	265168	265179	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	284928823
117	NC_013771	TTAATT	2	12	266511	266522	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_013771	AAGCCA	2	12	267123	267134	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	284928824
119	NC_013771	AAATTA	2	12	268688	268699	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	284928826
120	NC_013771	TCAAAT	2	12	269518	269529	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	284928826
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236	NC_013771	AAAGCT	2	12	488470	488481	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	284929013
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238	NC_013771	AATTGA	2	12	500519	500530	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	284929022
239	NC_013771	CTTATT	2	12	501355	501366	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
240	NC_013771	CCACGA	2	12	504956	504967	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	284929027
241	NC_013771	GCAGTT	2	12	505430	505441	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	284929027
242	NC_013771	TAATAT	2	12	510726	510737	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
243	NC_013771	AAAATA	2	12	518786	518797	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
244	NC_013771	TAAAAA	2	12	519270	519281	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	284929039
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248	NC_013771	ACTCAT	2	12	524358	524369	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284929041
249	NC_013771	CAGCTG	2	12	524375	524386	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	284929041
250	NC_013771	TGCAGC	2	12	525383	525394	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	284929042
251	NC_013771	GCTGAT	2	12	526242	526253	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	284929042
252	NC_013771	CTTCAC	2	12	528291	528302	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	284929043
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260	NC_013771	TGATTT	2	12	548247	548258	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	284929061
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265	NC_013771	ATTCTG	2	12	551599	551610	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	284929065
266	NC_013771	GAAATT	2	12	552214	552225	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	284929065
267	NC_013771	ATTTCT	2	12	552918	552929	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	284929066
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272	NC_013771	CTTCTA	2	12	565311	565322	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
273	NC_013771	TTTAGT	2	12	567591	567602	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	284929075
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277	NC_013771	AAACTA	2	12	573243	573254	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
278	NC_013771	AAATTG	2	12	573452	573463	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	284929080
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287	NC_013771	GCAAAA	2	12	586441	586452	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
288	NC_013771	GCTTTT	2	12	586924	586935	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	284929089
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293	NC_013771	GTTCTT	2	12	594743	594754	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	284929095
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338	NC_013771	TGAATC	2	12	721675	721686	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	284929199
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340	NC_013771	ATTCTA	2	12	725581	725592	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
341	NC_013771	AAGGTG	2	12	725682	725693	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	284929204
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343	NC_013771	TTTTCA	2	12	729596	729607	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
344	NC_013771	TTAAAT	2	12	734140	734151	50 %	50 %	0 %	0 %	284929211
345	NC_013771	CCAACT	2	12	734739	734750	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	284929211
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347	NC_013771	CTTGTA	2	12	738481	738492	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	284929215
348	NC_013771	TTAAAT	2	12	739373	739384	50 %	50 %	0 %	0 %	284929216
349	NC_013771	ATTCTG	2	12	740037	740048	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	284929217
350	NC_013771	ATAACT	2	12	741074	741085	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
351	NC_013771	AGAATT	2	12	742103	742114	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	284929219
352	NC_013771	CAATAT	2	12	743420	743431	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	284929219
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472	NC_013771	AGATAC	2	12	986837	986848	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	284929410
473	NC_013771	TTTTTC	2	12	987143	987154	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	284929410
474	NC_013771	ATTTAC	2	12	988524	988535	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
475	NC_013771	TGCTAT	2	12	990623	990634	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	284929412
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479	NC_013771	AAAGTT	2	12	997830	997841	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
480	NC_013771	AACTAA	2	12	998402	998413	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	284929416
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