MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Cyanobacterium UCYN-A

Total Repeats: 144

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013771	TTAACT	2	12	5448	5459	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_013771	AAAATT	2	12	12249	12260	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_013771	AATTAA	2	12	16300	16311	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_013771	ATATGA	2	12	37971	37982	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_013771	TATTTT	2	12	38002	38013	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_013771	TAAAAA	2	12	39362	39373	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_013771	TTTTAT	2	12	93170	93181	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_013771	TAAAAG	2	12	99235	99246	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_013771	AATTTT	2	12	127387	127398	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_013771	TTTTAA	2	12	140950	140961	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_013771	TTTTTA	2	12	164771	164782	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_013771	AACTAA	2	12	171412	171423	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_013771	TAAAAG	2	12	184404	184415	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_013771	TAATTA	2	12	187061	187072	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_013771	ATAAAA	2	12	198389	198400	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_013771	AGATTT	2	12	204061	204072	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_013771	GCTAAT	2	12	209506	209517	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_013771	TTATAT	2	12	212104	212115	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_013771	ACATTT	2	12	230640	230651	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_013771	AAATAT	2	12	249920	249931	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_013771	AACTTT	2	12	256693	256704	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_013771	TTTATA	2	12	262971	262982	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_013771	TTAATT	2	12	266511	266522	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_013771	TATTTA	2	12	276571	276582	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_013771	TAGTTT	2	12	276652	276663	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_013771	TATCTT	2	12	283612	283623	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_013771	TCCATA	2	12	286464	286475	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_013771	ATTTAA	2	12	288740	288751	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_013771	TTGATA	2	12	313258	313269	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_013771	AATATA	2	12	330233	330244	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_013771	ATTTTC	2	12	339884	339895	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_013771	TTCTAA	2	12	339945	339956	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_013771	TTAATT	2	12	343722	343733	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_013771	ATTTTT	2	12	349891	349902	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_013771	AAATTT	2	12	383840	383851	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_013771	TAAAAT	2	12	395889	395900	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_013771	TAAAAT	2	12	395912	395923	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_013771	AATAAA	2	12	397017	397028	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_013771	ATAAGT	2	12	422214	422225	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_013771	TAAACA	2	12	422532	422543	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_013771	AAATAA	2	12	423668	423679	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_013771	AGTTAA	2	12	431650	431661	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_013771	ATTAAG	2	12	444444	444455	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_013771	CAATAA	2	12	456547	456558	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_013771	AATTTC	2	12	459640	459651	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_013771	TTAAAG	2	12	464637	464648	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_013771	TAAATA	2	12	468522	468533	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_013771	ATAGTT	2	12	471952	471963	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_013771	ATTTTT	2	12	487591	487602	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_013771	CTTATT	2	12	501355	501366	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_013771	TAATAT	2	12	510726	510737	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_013771	AAAATA	2	12	518786	518797	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_013771	ATTCTG	2	12	542646	542657	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_013771	AAAATT	2	12	550554	550565	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_013771	CTTCTA	2	12	565311	565322	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_013771	AATTAT	2	12	569663	569674	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_013771	AAACTA	2	12	573243	573254	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_013771	GCAAAA	2	12	586441	586452	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_013771	ATTTTA	2	12	590873	590884	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_013771	TAAATA	2	12	602390	602401	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_013771	TGTAAT	2	12	622418	622429	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_013771	AGAATA	2	12	627782	627793	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_013771	AAGCTA	2	12	661719	661730	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_013771	GAAATA	2	12	673363	673374	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_013771	TAAAAT	2	12	682033	682044	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_013771	TTTATT	2	12	708967	708978	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_013771	ATAAAT	2	12	712225	712236	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_013771	TAAAAA	2	12	719585	719596	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_013771	ATTCTA	2	12	725581	725592	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_013771	TTTTCA	2	12	729596	729607	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_013771	ATAACT	2	12	741074	741085	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_013771	TATCAA	2	12	786243	786254	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_013771	CTGATT	2	12	793040	793051	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_013771	AAATAT	2	12	795998	796009	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_013771	CTTAAT	2	12	808201	808212	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_013771	TATGGA	2	12	816903	816914	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_013771	TTTAAT	2	12	818284	818295	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_013771	AATACA	2	12	854110	854121	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_013771	AAAATT	2	12	860033	860044	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_013771	GTTATT	2	12	874577	874588	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_013771	TGATTA	2	12	885270	885281	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_013771	CTTTAA	2	12	890465	890476	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_013771	TATAAA	2	12	895083	895094	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_013771	TTAATT	2	12	911620	911631	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_013771	TAAAGG	2	12	928810	928821	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_013771	ATATTT	2	12	935996	936007	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_013771	TTAATT	2	12	940995	941006	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_013771	CTTTTT	2	12	968820	968831	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_013771	TATCTA	2	12	969971	969982	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_013771	ATTTTT	2	12	975636	975647	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_013771	ATTTAC	2	12	988524	988535	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_013771	AAAGTT	2	12	997830	997841	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_013771	GAAATA	2	12	1006766	1006777	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
94	NC_013771	TTATAA	2	12	1013936	1013947	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_013771	TAGTAT	2	12	1021770	1021781	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
96	NC_013771	GTATTG	2	12	1030379	1030390	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_013771	AATTAA	2	12	1065546	1065557	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_013771	TGATTA	2	12	1070627	1070638	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
99	NC_013771	TAAAAT	2	12	1070848	1070859	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_013771	ATATTT	2	12	1081224	1081235	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_013771	ACTTAG	2	12	1081317	1081328	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
102	NC_013771	TTTATA	2	12	1090243	1090254	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_013771	ATTTTT	2	12	1101454	1101465	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_013771	ATTTTT	2	12	1113842	1113853	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_013771	TTTATA	2	12	1114254	1114265	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_013771	ATTTTT	2	12	1132359	1132370	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_013771	ATCTTT	2	12	1132384	1132395	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
108	NC_013771	TAAATA	2	12	1141801	1141812	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_013771	TATAGT	2	12	1150257	1150268	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
110	NC_013771	ATTTTT	2	12	1150701	1150712	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_013771	AAAATA	2	12	1150816	1150827	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_013771	TATTAA	2	12	1163900	1163911	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_013771	TATTAA	2	12	1165673	1165684	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_013771	TAAAAA	2	12	1198040	1198051	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_013771	AATATC	2	12	1207206	1207217	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
116	NC_013771	TCTTTA	2	12	1217686	1217697	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
117	NC_013771	TTAAAT	2	12	1219869	1219880	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_013771	CATAAA	2	12	1223296	1223307	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
119	NC_013771	AAAATA	2	12	1225310	1225321	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_013771	CTTTTA	2	12	1266068	1266079	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
121	NC_013771	AATTAA	2	12	1266086	1266097	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_013771	TACTTA	2	12	1272275	1272286	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
123	NC_013771	ATATTT	2	12	1281038	1281049	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_013771	TTATAT	2	12	1283578	1283589	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_013771	CTTTCA	2	12	1290029	1290040	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_013771	TAAATA	2	12	1297810	1297821	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_013771	TAAATA	2	12	1302097	1302108	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_013771	AAATTA	2	12	1311084	1311095	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_013771	AATTCT	2	12	1321066	1321077	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
130	NC_013771	GTAATA	2	12	1341170	1341181	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
131	NC_013771	ATTACT	2	12	1341190	1341201	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
132	NC_013771	TCAATA	2	12	1343837	1343848	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
133	NC_013771	TTTATT	2	12	1349584	1349595	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_013771	TAAATT	2	12	1363748	1363759	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_013771	TCTTGA	2	12	1364086	1364097	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
136	NC_013771	ACCTTA	2	12	1364191	1364202	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_013771	TATTTA	2	12	1372103	1372114	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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139	NC_013771	ATTTTT	2	12	1408399	1408410	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_013771	AAAATT	2	12	1418967	1418978	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_013771	CTATTT	2	12	1422890	1422901	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.