MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Cyanobacterium UCYN-A

Total Repeats: 1270

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013771	CTCAG	2	10	1651	1660	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
2	NC_013771	CTCCC	2	10	2655	2664	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
3	NC_013771	CACGA	2	10	3967	3976	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
4	NC_013771	ACGGC	2	10	4187	4196	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
5	NC_013771	TTTGA	2	10	4992	5001	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
6	NC_013771	ATGAA	2	10	5580	5589	60 %	20 %	20 %	0 %	284928604
7	NC_013771	AATTA	3	15	6578	6592	60 %	40 %	0 %	0 %	284928604
8	NC_013771	TAATT	2	10	6616	6625	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_013771	ATTAT	2	10	7058	7067	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_013771	AATGT	2	10	11414	11423	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
11	NC_013771	ATTAT	2	10	12401	12410	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_013771	AAAAT	2	10	13720	13729	80 %	20 %	0 %	0 %	284928612
13	NC_013771	TCAAA	2	10	14858	14867	60 %	20 %	0 %	20 %	284928613
14	NC_013771	AAAGT	2	10	17641	17650	60 %	20 %	20 %	0 %	284928615
15	NC_013771	GTAAA	2	10	19536	19545	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
16	NC_013771	TTTGG	2	10	20508	20517	0 %	60 %	40 %	0 %	284928617
17	NC_013771	ATTGA	2	10	23344	23353	40 %	40 %	20 %	0 %	284928619
18	NC_013771	GAAAC	2	10	23503	23512	60 %	0 %	20 %	20 %	284928619
19	NC_013771	CTGTA	2	10	24239	24248	20 %	40 %	20 %	20 %	284928619
20	NC_013771	TCTTT	2	10	24666	24675	0 %	80 %	0 %	20 %	284928619
21	NC_013771	CATCC	2	10	25266	25275	20 %	20 %	0 %	60 %	284928619
22	NC_013771	ATGAA	2	10	28444	28453	60 %	20 %	20 %	0 %	284928620
23	NC_013771	ATTGG	2	10	28536	28545	20 %	40 %	40 %	0 %	284928620
24	NC_013771	AGCTT	2	10	31498	31507	20 %	40 %	20 %	20 %	284928622
25	NC_013771	ATACA	2	10	31827	31836	60 %	20 %	0 %	20 %	284928622
26	NC_013771	GCAGA	2	10	31922	31931	40 %	0 %	40 %	20 %	284928622
27	NC_013771	ATCCC	2	10	39465	39474	20 %	20 %	0 %	60 %	284928629
28	NC_013771	AGCTC	2	10	40023	40032	20 %	20 %	20 %	40 %	284928629
29	NC_013771	TTCTT	2	10	40541	40550	0 %	80 %	0 %	20 %	284928629
30	NC_013771	ATAGT	2	10	40695	40704	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
31	NC_013771	TACAA	2	10	46578	46587	60 %	20 %	0 %	20 %	284928634
32	NC_013771	AAAAC	2	10	46981	46990	80 %	0 %	0 %	20 %	284928634
33	NC_013771	CAAAC	2	10	47159	47168	60 %	0 %	0 %	40 %	284928634
34	NC_013771	CTTAT	2	10	48517	48526	20 %	60 %	0 %	20 %	284928634
35	NC_013771	AAATT	2	10	48854	48863	60 %	40 %	0 %	0 %	284928635
36	NC_013771	ACTTT	2	10	51073	51082	20 %	60 %	0 %	20 %	284928637
37	NC_013771	CTTTT	2	10	52606	52615	0 %	80 %	0 %	20 %	284928638
38	NC_013771	TTAAT	2	10	52670	52679	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_013771	ACTTC	2	10	53617	53626	20 %	40 %	0 %	40 %	284928640
40	NC_013771	TAATT	2	10	54506	54515	40 %	60 %	0 %	0 %	284928640
41	NC_013771	ACTAT	2	10	56270	56279	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
42	NC_013771	AGGAG	2	10	56998	57007	40 %	0 %	60 %	0 %	284928643
43	NC_013771	TTCAG	2	10	57193	57202	20 %	40 %	20 %	20 %	284928643
44	NC_013771	TTTTA	2	10	57789	57798	20 %	80 %	0 %	0 %	284928643
45	NC_013771	ATTTA	2	10	58170	58179	40 %	60 %	0 %	0 %	284928643
46	NC_013771	TAGAA	2	10	58929	58938	60 %	20 %	20 %	0 %	284928643
47	NC_013771	GTTTG	2	10	59148	59157	0 %	60 %	40 %	0 %	284928643
48	NC_013771	GAGCA	2	10	59357	59366	40 %	0 %	40 %	20 %	284928643
49	NC_013771	TAATG	2	10	62384	62393	40 %	40 %	20 %	0 %	284928647
50	NC_013771	TTTAA	2	10	62926	62935	40 %	60 %	0 %	0 %	284928648
51	NC_013771	TATTT	2	10	63471	63480	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_013771	TTAAT	2	10	63488	63497	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_013771	TTTAA	2	10	64566	64575	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_013771	ATAAA	2	10	64694	64703	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_013771	ATTTT	2	10	65272	65281	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_013771	CAACT	2	10	65795	65804	40 %	20 %	0 %	40 %	284928651
57	NC_013771	TTTCT	2	10	66905	66914	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
58	NC_013771	AAAAT	2	10	67613	67622	80 %	20 %	0 %	0 %	284928652
59	NC_013771	CATAT	2	10	73461	73470	40 %	40 %	0 %	20 %	284928657
60	NC_013771	AATAG	2	10	74024	74033	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
61	NC_013771	AAATT	2	10	75956	75965	60 %	40 %	0 %	0 %	284928658
62	NC_013771	CAAAT	2	10	76208	76217	60 %	20 %	0 %	20 %	284928658
63	NC_013771	TTTCT	2	10	78404	78413	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
64	NC_013771	AGTAA	2	10	78687	78696	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
65	NC_013771	TTTCT	2	10	78821	78830	0 %	80 %	0 %	20 %	284928661
66	NC_013771	TTTCC	2	10	79567	79576	0 %	60 %	0 %	40 %	284928661
67	NC_013771	TAAAA	2	10	79800	79809	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_013771	AAAGG	2	10	80081	80090	60 %	0 %	40 %	0 %	284928662
69	NC_013771	GTACA	2	10	81477	81486	40 %	20 %	20 %	20 %	284928662
70	NC_013771	ATTTT	2	10	83372	83381	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_013771	GTATG	2	10	84818	84827	20 %	40 %	40 %	0 %	284928666
72	NC_013771	AAAAC	2	10	85322	85331	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
73	NC_013771	TAACT	2	10	86234	86243	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
74	NC_013771	TTACA	2	10	88637	88646	40 %	40 %	0 %	20 %	284928670
75	NC_013771	ATTAT	2	10	93605	93614	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_013771	TACTT	2	10	93880	93889	20 %	60 %	0 %	20 %	284928674
77	NC_013771	TAGCT	2	10	94174	94183	20 %	40 %	20 %	20 %	284928674
78	NC_013771	TAATT	2	10	95449	95458	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_013771	TAATC	2	10	96870	96879	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
80	NC_013771	AAATA	2	10	97327	97336	80 %	20 %	0 %	0 %	284928677
81	NC_013771	TCTTA	2	10	97658	97667	20 %	60 %	0 %	20 %	284928678
82	NC_013771	TCCTA	2	10	97783	97792	20 %	40 %	0 %	40 %	284928678
83	NC_013771	TGTAT	2	10	99095	99104	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
84	NC_013771	AAGTT	2	10	99564	99573	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
85	NC_013771	TTAAC	2	10	99601	99610	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
86	NC_013771	AAGAA	2	10	100121	100130	80 %	0 %	20 %	0 %	284928680
87	NC_013771	ATCTT	2	10	100173	100182	20 %	60 %	0 %	20 %	284928680
88	NC_013771	AAGAT	2	10	100223	100232	60 %	20 %	20 %	0 %	284928680
89	NC_013771	TGGAT	2	10	100782	100791	20 %	40 %	40 %	0 %	284928680
90	NC_013771	AAATT	2	10	102934	102943	60 %	40 %	0 %	0 %	284928682
91	NC_013771	CTAAA	2	10	105166	105175	60 %	20 %	0 %	20 %	284928684
92	NC_013771	GATTG	2	10	105393	105402	20 %	40 %	40 %	0 %	284928685
93	NC_013771	AAAAT	2	10	105457	105466	80 %	20 %	0 %	0 %	284928685
94	NC_013771	AAAAG	2	10	107178	107187	80 %	0 %	20 %	0 %	284928685
95	NC_013771	ATTCT	2	10	107245	107254	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
96	NC_013771	TTTTG	2	10	107387	107396	0 %	80 %	20 %	0 %	284928686
97	NC_013771	TCATA	2	10	107974	107983	40 %	40 %	0 %	20 %	284928687
98	NC_013771	AAAAT	2	10	113702	113711	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_013771	TTAAT	2	10	113821	113830	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_013771	ATTAC	2	10	116979	116988	40 %	40 %	0 %	20 %	284928696
101	NC_013771	ACTAT	2	10	117600	117609	40 %	40 %	0 %	20 %	284928696
102	NC_013771	TAATT	2	10	121126	121135	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_013771	CTTTT	2	10	122306	122315	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
104	NC_013771	TAATA	2	10	124258	124267	60 %	40 %	0 %	0 %	284928704
105	NC_013771	TCTAC	2	10	127169	127178	20 %	40 %	0 %	40 %	284928707
106	NC_013771	CAAAA	2	10	127279	127288	80 %	0 %	0 %	20 %	284928707
107	NC_013771	TATCC	2	10	129120	129129	20 %	40 %	0 %	40 %	284928709
108	NC_013771	TATTT	2	10	129466	129475	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_013771	TCTAT	2	10	131567	131576	20 %	60 %	0 %	20 %	284928711
110	NC_013771	CTTTA	2	10	133831	133840	20 %	60 %	0 %	20 %	284928713
111	NC_013771	GCAAT	2	10	136296	136305	40 %	20 %	20 %	20 %	284928716
112	NC_013771	GGAAA	2	10	136641	136650	60 %	0 %	40 %	0 %	284928716
113	NC_013771	ATATC	2	10	136724	136733	40 %	40 %	0 %	20 %	284928716
114	NC_013771	ATATA	2	10	137753	137762	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_013771	TTTTA	2	10	145401	145410	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_013771	TAGAT	2	10	147822	147831	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
117	NC_013771	TTTTA	2	10	148049	148058	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_013771	TGATA	2	10	148312	148321	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
119	NC_013771	ATCTT	2	10	150082	150091	20 %	60 %	0 %	20 %	284928731
120	NC_013771	AATGT	2	10	151277	151286	40 %	40 %	20 %	0 %	284928732
121	NC_013771	TAGCG	2	10	152576	152585	20 %	20 %	40 %	20 %	284928732
122	NC_013771	TAAAT	2	10	152616	152625	60 %	40 %	0 %	0 %	284928732
123	NC_013771	ATTTA	2	10	153087	153096	40 %	60 %	0 %	0 %	284928732
124	NC_013771	AAAAG	2	10	153237	153246	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
125	NC_013771	TTTTA	2	10	153974	153983	20 %	80 %	0 %	0 %	284928734
126	NC_013771	TTTTA	2	10	154006	154015	20 %	80 %	0 %	0 %	284928734
127	NC_013771	GATTA	2	10	155268	155277	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
128	NC_013771	ATTTT	2	10	155397	155406	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_013771	TATTC	2	10	157246	157255	20 %	60 %	0 %	20 %	284928736
130	NC_013771	TGGGA	2	10	157432	157441	20 %	20 %	60 %	0 %	284928736
131	NC_013771	TGAAT	2	10	158973	158982	40 %	40 %	20 %	0 %	284928737
132	NC_013771	AATAA	2	10	159946	159955	80 %	20 %	0 %	0 %	284928737
133	NC_013771	AATTA	2	10	160319	160328	60 %	40 %	0 %	0 %	284928738
134	NC_013771	TTCGT	2	10	160669	160678	0 %	60 %	20 %	20 %	284928738
135	NC_013771	AGTTA	2	10	160721	160730	40 %	40 %	20 %	0 %	284928738
136	NC_013771	TAAAA	2	10	161837	161846	80 %	20 %	0 %	0 %	284928738
137	NC_013771	TAAAA	2	10	164428	164437	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_013771	AAAAC	2	10	166784	166793	80 %	0 %	0 %	20 %	284928742
139	NC_013771	AAAAG	2	10	167745	167754	80 %	0 %	20 %	0 %	284928742
140	NC_013771	AATTT	2	10	168353	168362	40 %	60 %	0 %	0 %	284928743
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