MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Cyanobacterium UCYN-A

Total Repeats: 417

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013771	CTCAG	2	10	1651	1660	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
2	NC_013771	CTCCC	2	10	2655	2664	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
3	NC_013771	CACGA	2	10	3967	3976	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
4	NC_013771	ACGGC	2	10	4187	4196	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
5	NC_013771	TTTGA	2	10	4992	5001	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
6	NC_013771	TAATT	2	10	6616	6625	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_013771	ATTAT	2	10	7058	7067	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_013771	AATGT	2	10	11414	11423	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
9	NC_013771	ATTAT	2	10	12401	12410	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_013771	GTAAA	2	10	19536	19545	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
11	NC_013771	ATAGT	2	10	40695	40704	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
12	NC_013771	TTAAT	2	10	52670	52679	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_013771	ACTAT	2	10	56270	56279	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
14	NC_013771	TATTT	2	10	63471	63480	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_013771	TTAAT	2	10	63488	63497	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_013771	TTTAA	2	10	64566	64575	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_013771	ATAAA	2	10	64694	64703	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_013771	ATTTT	2	10	65272	65281	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_013771	TTTCT	2	10	66905	66914	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
20	NC_013771	AATAG	2	10	74024	74033	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
21	NC_013771	TTTCT	2	10	78404	78413	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
22	NC_013771	AGTAA	2	10	78687	78696	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
23	NC_013771	TAAAA	2	10	79800	79809	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_013771	ATTTT	2	10	83372	83381	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_013771	AAAAC	2	10	85322	85331	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
26	NC_013771	TAACT	2	10	86234	86243	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
27	NC_013771	ATTAT	2	10	93605	93614	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_013771	TAATT	2	10	95449	95458	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_013771	TAATC	2	10	96870	96879	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
30	NC_013771	TGTAT	2	10	99095	99104	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
31	NC_013771	AAGTT	2	10	99564	99573	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
32	NC_013771	TTAAC	2	10	99601	99610	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
33	NC_013771	ATTCT	2	10	107245	107254	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
34	NC_013771	AAAAT	2	10	113702	113711	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_013771	TTAAT	2	10	113821	113830	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_013771	TAATT	2	10	121126	121135	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_013771	CTTTT	2	10	122306	122315	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
38	NC_013771	TATTT	2	10	129466	129475	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_013771	ATATA	2	10	137753	137762	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_013771	TTTTA	2	10	145401	145410	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_013771	TAGAT	2	10	147822	147831	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
42	NC_013771	TTTTA	2	10	148049	148058	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_013771	TGATA	2	10	148312	148321	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
44	NC_013771	AAAAG	2	10	153237	153246	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
45	NC_013771	GATTA	2	10	155268	155277	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
46	NC_013771	ATTTT	2	10	155397	155406	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_013771	TAAAA	2	10	164428	164437	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_013771	TTCTA	2	10	172809	172818	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
49	NC_013771	TATAA	2	10	176641	176650	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_013771	TGTTA	2	10	179458	179467	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
51	NC_013771	TTAAT	2	10	186706	186715	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_013771	TTTAA	2	10	187012	187021	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_013771	ATCAA	2	10	192470	192479	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
54	NC_013771	CATAT	2	10	198446	198455	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
55	NC_013771	TTTTA	2	10	198527	198536	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_013771	TAAAA	2	10	201432	201441	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_013771	ATAAG	2	10	201585	201594	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
58	NC_013771	TTAAG	2	10	203987	203996	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
59	NC_013771	AGTTA	2	10	206604	206613	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
60	NC_013771	TAATT	2	10	207212	207221	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_013771	TTTTA	2	10	210053	210062	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_013771	TTAAT	2	10	212484	212493	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_013771	TTTAA	2	10	214506	214515	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_013771	TAATG	2	10	214539	214548	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
65	NC_013771	ATTTA	2	10	219902	219911	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_013771	GAAAT	2	10	224575	224584	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
67	NC_013771	AAAAT	2	10	227003	227012	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_013771	TAATT	2	10	230670	230679	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_013771	TAATT	2	10	230758	230767	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_013771	GTTAA	2	10	230822	230831	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
71	NC_013771	AAAAT	2	10	240531	240540	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_013771	CTACT	2	10	254957	254966	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
73	NC_013771	ATTTT	2	10	255536	255545	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_013771	TTTTA	2	10	256710	256719	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_013771	TATAT	2	10	261689	261698	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_013771	CTGTT	2	10	274075	274084	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
77	NC_013771	GAAAA	2	10	276032	276041	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
78	NC_013771	CTTTA	2	10	276721	276730	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
79	NC_013771	TAAAA	2	10	281748	281757	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_013771	AAAAT	2	10	281804	281813	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_013771	ATTGA	2	10	282148	282157	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
82	NC_013771	TTAAT	2	10	283642	283651	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_013771	AAAAT	2	10	286129	286138	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_013771	CTTTT	2	10	286429	286438	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
85	NC_013771	TGATT	2	10	288631	288640	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
86	NC_013771	ATATA	2	10	303242	303251	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_013771	CATAT	2	10	306255	306264	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
88	NC_013771	TAAAT	2	10	310358	310367	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_013771	AGATA	2	10	316843	316852	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
90	NC_013771	TTAAC	2	10	320264	320273	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
91	NC_013771	AATAC	2	10	323942	323951	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
92	NC_013771	TTGAT	2	10	330096	330105	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
93	NC_013771	TTAAT	2	10	331484	331493	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_013771	AATTT	2	10	332446	332455	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_013771	TTCAT	2	10	334086	334095	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
96	NC_013771	TTAAA	2	10	335092	335101	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_013771	TAATT	2	10	338403	338412	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_013771	TAATT	2	10	342713	342722	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_013771	AAAAT	2	10	343785	343794	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_013771	TACTA	2	10	349989	349998	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
101	NC_013771	TTAAC	2	10	352354	352363	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
102	NC_013771	TAAAT	2	10	359676	359685	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_013771	ATTTG	2	10	361570	361579	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
104	NC_013771	ATTAA	2	10	365862	365871	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_013771	TAATT	2	10	366981	366990	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_013771	AATTA	2	10	367073	367082	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_013771	TATAG	2	10	371956	371965	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
108	NC_013771	TAATT	2	10	372281	372290	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_013771	CTTAA	2	10	379081	379090	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
110	NC_013771	AGATA	2	10	380702	380711	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
111	NC_013771	AATTT	2	10	386421	386430	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_013771	GTTAA	2	10	386474	386483	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
113	NC_013771	AAGAA	2	10	388408	388417	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
114	NC_013771	CAAAA	2	10	393401	393410	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
115	NC_013771	TTACA	2	10	395959	395968	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
116	NC_013771	AATAA	2	10	396785	396794	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_013771	TTTGA	2	10	396809	396818	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
118	NC_013771	CATAT	2	10	401818	401827	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
119	NC_013771	TTAAA	2	10	413761	413770	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_013771	AAAAT	2	10	413983	413992	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_013771	TTAAA	2	10	415130	415139	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_013771	TAAAA	2	10	419277	419286	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_013771	TAAAT	2	10	419358	419367	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_013771	AACAA	2	10	426655	426664	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
125	NC_013771	TTTAT	2	10	428750	428759	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_013771	TTTAA	2	10	430058	430067	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_013771	TAAAA	2	10	431577	431586	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_013771	TTTTA	2	10	431908	431917	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_013771	CTTAT	2	10	433713	433722	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
130	NC_013771	TCTTA	2	10	436012	436021	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
131	NC_013771	AATAC	2	10	439350	439359	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
132	NC_013771	ATAAG	2	10	439585	439594	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
133	NC_013771	GTCTT	2	10	441203	441212	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
134	NC_013771	ATATG	2	10	452621	452630	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
135	NC_013771	CATTA	2	10	457416	457425	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
136	NC_013771	TATTT	3	15	462385	462399	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_013771	AATTT	2	10	462568	462577	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_013771	TAATT	2	10	464882	464891	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_013771	TGTAT	2	10	468622	468631	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
140	NC_013771	TATTT	2	10	471648	471657	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_013771	ATTTT	2	10	474600	474609	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_013771	TAGAT	2	10	477019	477028	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
143	NC_013771	AATAC	2	10	478271	478280	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
144	NC_013771	GAATT	2	10	478324	478333	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
145	NC_013771	GAATA	2	10	478423	478432	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
146	NC_013771	ATTAA	2	10	478618	478627	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_013771	TATTT	2	10	482423	482432	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_013771	ATATG	2	10	486043	486052	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
149	NC_013771	TAATT	2	10	486125	486134	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.