MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Cyanobacterium UCYN-A

Total Repeats: 4760

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013771	CCTT	2	8	71	78	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_013771	AAGG	2	8	90	97	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_013771	GGAT	2	8	194	201	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_013771	TCCA	2	8	328	335	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_013771	AAGG	2	8	540	547	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_013771	CATT	2	8	2138	2145	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_013771	AGCT	2	8	2344	2351	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
8	NC_013771	TCGC	2	8	2930	2937	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
9	NC_013771	TGCT	2	8	3073	3080	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
10	NC_013771	TACT	2	8	3232	3239	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_013771	TGCG	2	8	4146	4153	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
12	NC_013771	TCTT	2	8	5012	5019	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
13	NC_013771	AATA	2	8	5240	5247	75 %	25 %	0 %	0 %	284928603
14	NC_013771	TTAC	2	8	5265	5272	25 %	50 %	0 %	25 %	284928603
15	NC_013771	TTTC	2	8	5348	5355	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
16	NC_013771	AAAT	2	8	5436	5443	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_013771	TGGA	2	8	6022	6029	25 %	25 %	50 %	0 %	284928604
18	NC_013771	AGGA	2	8	6102	6109	50 %	0 %	50 %	0 %	284928604
19	NC_013771	ATGC	2	8	6143	6150	25 %	25 %	25 %	25 %	284928604
20	NC_013771	GAAC	2	8	6250	6257	50 %	0 %	25 %	25 %	284928604
21	NC_013771	AATT	2	8	6685	6692	50 %	50 %	0 %	0 %	284928605
22	NC_013771	TAAT	2	8	6969	6976	50 %	50 %	0 %	0 %	284928605
23	NC_013771	AAAT	2	8	7156	7163	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_013771	TAAA	2	8	7239	7246	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_013771	TAAG	2	8	7330	7337	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
26	NC_013771	ATCC	2	8	7845	7852	25 %	25 %	0 %	50 %	284928606
27	NC_013771	AATC	2	8	8837	8844	50 %	25 %	0 %	25 %	284928607
28	NC_013771	ATTG	2	8	8905	8912	25 %	50 %	25 %	0 %	284928607
29	NC_013771	CTTT	2	8	9086	9093	0 %	75 %	0 %	25 %	284928607
30	NC_013771	AACA	2	8	9591	9598	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
31	NC_013771	AACA	2	8	10571	10578	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
32	NC_013771	ATTT	2	8	10930	10937	25 %	75 %	0 %	0 %	284928609
33	NC_013771	ATTT	2	8	11023	11030	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_013771	ATTA	2	8	11488	11495	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_013771	TTCA	2	8	11870	11877	25 %	50 %	0 %	25 %	284928611
36	NC_013771	TAAT	2	8	12533	12540	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_013771	AAGA	2	8	12700	12707	75 %	0 %	25 %	0 %	284928612
38	NC_013771	AGGA	2	8	13213	13220	50 %	0 %	50 %	0 %	284928612
39	NC_013771	AATT	2	8	13411	13418	50 %	50 %	0 %	0 %	284928612
40	NC_013771	ACTA	2	8	13665	13672	50 %	25 %	0 %	25 %	284928612
41	NC_013771	ATTA	2	8	13995	14002	50 %	50 %	0 %	0 %	284928612
42	NC_013771	GTTT	2	8	14030	14037	0 %	75 %	25 %	0 %	284928612
43	NC_013771	AACA	2	8	14088	14095	75 %	0 %	0 %	25 %	284928612
44	NC_013771	GGAA	2	8	14141	14148	50 %	0 %	50 %	0 %	284928612
45	NC_013771	AATT	2	8	14231	14238	50 %	50 %	0 %	0 %	284928612
46	NC_013771	TACA	2	8	14284	14291	50 %	25 %	0 %	25 %	284928612
47	NC_013771	ATAA	2	8	14379	14386	75 %	25 %	0 %	0 %	284928612
48	NC_013771	AAGA	2	8	14421	14428	75 %	0 %	25 %	0 %	284928612
49	NC_013771	ATTA	2	8	14453	14460	50 %	50 %	0 %	0 %	284928612
50	NC_013771	TTAA	2	8	14537	14544	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_013771	TAAA	2	8	14610	14617	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_013771	TAAA	2	8	15736	15743	75 %	25 %	0 %	0 %	284928613
53	NC_013771	AATT	2	8	16176	16183	50 %	50 %	0 %	0 %	284928614
54	NC_013771	TCTT	2	8	16539	16546	0 %	75 %	0 %	25 %	284928615
55	NC_013771	TAAA	2	8	17225	17232	75 %	25 %	0 %	0 %	284928615
56	NC_013771	ATTA	2	8	17274	17281	50 %	50 %	0 %	0 %	284928615
57	NC_013771	TATG	2	8	17309	17316	25 %	50 %	25 %	0 %	284928615
58	NC_013771	GTAC	2	8	17668	17675	25 %	25 %	25 %	25 %	284928615
59	NC_013771	AAAT	2	8	17718	17725	75 %	25 %	0 %	0 %	284928615
60	NC_013771	TTTG	2	8	17737	17744	0 %	75 %	25 %	0 %	284928615
61	NC_013771	TTAA	2	8	17958	17965	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_013771	TAAA	2	8	18071	18078	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_013771	CTTG	2	8	18281	18288	0 %	50 %	25 %	25 %	284928616
64	NC_013771	TCTT	2	8	18604	18611	0 %	75 %	0 %	25 %	284928616
65	NC_013771	AAAT	2	8	19266	19273	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_013771	CTAT	2	8	19667	19674	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
67	NC_013771	AAGA	2	8	19737	19744	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
68	NC_013771	ATTT	2	8	19816	19823	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_013771	ATTT	2	8	19976	19983	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_013771	TTTA	2	8	19991	19998	25 %	75 %	0 %	0 %	284928617
71	NC_013771	TATT	2	8	20127	20134	25 %	75 %	0 %	0 %	284928617
72	NC_013771	TAAT	2	8	20197	20204	50 %	50 %	0 %	0 %	284928617
73	NC_013771	TTTA	2	8	20294	20301	25 %	75 %	0 %	0 %	284928617
74	NC_013771	GTAC	2	8	20385	20392	25 %	25 %	25 %	25 %	284928617
75	NC_013771	TAAT	2	8	20494	20501	50 %	50 %	0 %	0 %	284928617
76	NC_013771	ACCG	2	8	20561	20568	25 %	0 %	25 %	50 %	284928617
77	NC_013771	TACT	2	8	20873	20880	25 %	50 %	0 %	25 %	284928617
78	NC_013771	AATG	2	8	20952	20959	50 %	25 %	25 %	0 %	284928617
79	NC_013771	TTAA	2	8	21388	21395	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_013771	TAAT	2	8	21796	21803	50 %	50 %	0 %	0 %	284928618
81	NC_013771	CTAG	2	8	21996	22003	25 %	25 %	25 %	25 %	284928618
82	NC_013771	AATA	2	8	22673	22680	75 %	25 %	0 %	0 %	284928618
83	NC_013771	TAAT	2	8	22927	22934	50 %	50 %	0 %	0 %	284928619
84	NC_013771	TAAT	2	8	22941	22948	50 %	50 %	0 %	0 %	284928619
85	NC_013771	TATC	2	8	23811	23818	25 %	50 %	0 %	25 %	284928619
86	NC_013771	AATG	2	8	24177	24184	50 %	25 %	25 %	0 %	284928619
87	NC_013771	GATT	2	8	24564	24571	25 %	50 %	25 %	0 %	284928619
88	NC_013771	TAAG	2	8	24727	24734	50 %	25 %	25 %	0 %	284928619
89	NC_013771	ATAG	2	8	24742	24749	50 %	25 %	25 %	0 %	284928619
90	NC_013771	CAAT	2	8	25145	25152	50 %	25 %	0 %	25 %	284928619
91	NC_013771	GTTG	2	8	26345	26352	0 %	50 %	50 %	0 %	284928620
92	NC_013771	AAAG	2	8	26656	26663	75 %	0 %	25 %	0 %	284928620
93	NC_013771	TTAG	2	8	26979	26986	25 %	50 %	25 %	0 %	284928620
94	NC_013771	AAAG	2	8	27578	27585	75 %	0 %	25 %	0 %	284928620
95	NC_013771	CTTG	2	8	27718	27725	0 %	50 %	25 %	25 %	284928620
96	NC_013771	TAAA	2	8	28477	28484	75 %	25 %	0 %	0 %	284928620
97	NC_013771	TGAA	2	8	28878	28885	50 %	25 %	25 %	0 %	284928621
98	NC_013771	TAAA	2	8	30137	30144	75 %	25 %	0 %	0 %	284928621
99	NC_013771	CTTT	2	8	30150	30157	0 %	75 %	0 %	25 %	284928621
100	NC_013771	CTAA	2	8	30178	30185	50 %	25 %	0 %	25 %	284928621
101	NC_013771	TTAA	2	8	30367	30374	50 %	50 %	0 %	0 %	284928621
102	NC_013771	TAAT	2	8	30662	30669	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_013771	ATTA	2	8	30689	30696	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_013771	CTTA	2	8	31577	31584	25 %	50 %	0 %	25 %	284928622
105	NC_013771	CATA	2	8	31815	31822	50 %	25 %	0 %	25 %	284928622
106	NC_013771	ATGA	2	8	31990	31997	50 %	25 %	25 %	0 %	284928622
107	NC_013771	TAAG	2	8	32497	32504	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
108	NC_013771	TTAA	2	8	32640	32647	50 %	50 %	0 %	0 %	284928623
109	NC_013771	CTTC	2	8	32703	32710	0 %	50 %	0 %	50 %	284928623
110	NC_013771	CGTA	2	8	33160	33167	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
111	NC_013771	TGAC	2	8	33191	33198	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
112	NC_013771	TAAA	2	8	33400	33407	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_013771	AATT	2	8	33899	33906	50 %	50 %	0 %	0 %	284928624
114	NC_013771	CTGA	2	8	34142	34149	25 %	25 %	25 %	25 %	284928624
115	NC_013771	ATAA	2	8	34407	34414	75 %	25 %	0 %	0 %	284928624
116	NC_013771	TTGT	2	8	34602	34609	0 %	75 %	25 %	0 %	284928624
117	NC_013771	ATAA	2	8	34639	34646	75 %	25 %	0 %	0 %	284928624
118	NC_013771	ATAA	2	8	35199	35206	75 %	25 %	0 %	0 %	284928624
119	NC_013771	ATTT	2	8	35594	35601	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_013771	AAGG	2	8	35959	35966	50 %	0 %	50 %	0 %	284928625
121	NC_013771	GTCA	2	8	36010	36017	25 %	25 %	25 %	25 %	284928625
122	NC_013771	TAAT	2	8	36656	36663	50 %	50 %	0 %	0 %	284928626
123	NC_013771	TTGA	2	8	36913	36920	25 %	50 %	25 %	0 %	284928626
124	NC_013771	GGTA	2	8	37187	37194	25 %	25 %	50 %	0 %	284928626
125	NC_013771	ATTG	2	8	37638	37645	25 %	50 %	25 %	0 %	284928626
126	NC_013771	ATTG	2	8	37795	37802	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
127	NC_013771	TTAA	2	8	37954	37961	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_013771	ATTA	2	8	38152	38159	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_013771	TTCG	2	8	38318	38325	0 %	50 %	25 %	25 %	284928627
130	NC_013771	TTTA	2	8	38701	38708	25 %	75 %	0 %	0 %	284928627
131	NC_013771	GGAT	2	8	38848	38855	25 %	25 %	50 %	0 %	284928628
132	NC_013771	TCAA	2	8	38865	38872	50 %	25 %	0 %	25 %	284928628
133	NC_013771	TGGT	2	8	39112	39119	0 %	50 %	50 %	0 %	284928628
134	NC_013771	AATG	2	8	39221	39228	50 %	25 %	25 %	0 %	284928628
135	NC_013771	TAAA	2	8	39323	39330	75 %	25 %	0 %	0 %	284928628
136	NC_013771	CTTT	2	8	39603	39610	0 %	75 %	0 %	25 %	284928629
137	NC_013771	ATTT	2	8	39655	39662	25 %	75 %	0 %	0 %	284928629
138	NC_013771	CTTC	2	8	39804	39811	0 %	50 %	0 %	50 %	284928629
139	NC_013771	ATTG	2	8	39865	39872	25 %	50 %	25 %	0 %	284928629
140	NC_013771	GTTT	2	8	39994	40001	0 %	75 %	25 %	0 %	284928629
141	NC_013771	AATA	2	8	40373	40380	75 %	25 %	0 %	0 %	284928629
142	NC_013771	TATT	2	8	40617	40624	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_013771	TAAA	2	8	40736	40743	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_013771	TCAA	2	8	41984	41991	50 %	25 %	0 %	25 %	284928630
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