MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Sulfolobus islandicus L.D.8.5 plasmid pLD8501

Total Repeats: 27

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013770	ATATT	2	10	2613	2622	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_013770	CTTAT	2	10	2726	2735	20 %	60 %	0 %	20 %	284807104
3	NC_013770	AAGAG	2	10	3026	3035	60 %	0 %	40 %	0 %	284807104
4	NC_013770	TGAAA	2	10	3165	3174	60 %	20 %	20 %	0 %	284807104
5	NC_013770	CTTTT	2	10	3322	3331	0 %	80 %	0 %	20 %	284807105
6	NC_013770	TTGAG	2	10	4076	4085	20 %	40 %	40 %	0 %	284807106
7	NC_013770	TTATA	2	10	4298	4307	40 %	60 %	0 %	0 %	284807106
8	NC_013770	TGATA	2	10	5190	5199	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
9	NC_013770	AAGAG	2	10	7577	7586	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
10	NC_013770	GCATT	2	10	9555	9564	20 %	40 %	20 %	20 %	284807110
11	NC_013770	ATGGA	2	10	11813	11822	40 %	20 %	40 %	0 %	284807113
12	NC_013770	AAATT	2	10	12106	12115	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_013770	AGAGA	2	10	12489	12498	60 %	0 %	40 %	0 %	284807114
14	NC_013770	TTCCC	2	10	13956	13965	0 %	40 %	0 %	60 %	284807118
15	NC_013770	AACTA	2	10	15347	15356	60 %	20 %	0 %	20 %	284807121
16	NC_013770	AGCTC	2	10	16807	16816	20 %	20 %	20 %	40 %	284807125
17	NC_013770	CTTGG	2	10	17342	17351	0 %	40 %	40 %	20 %	284807125
18	NC_013770	TATAT	2	10	18242	18251	40 %	60 %	0 %	0 %	284807126
19	NC_013770	TTCTC	2	10	18848	18857	0 %	60 %	0 %	40 %	284807127
20	NC_013770	AAGTA	2	10	19194	19203	60 %	20 %	20 %	0 %	284807128
21	NC_013770	CCAGT	2	10	19702	19711	20 %	20 %	20 %	40 %	284807128
22	NC_013770	AATGT	2	10	19967	19976	40 %	40 %	20 %	0 %	284807128
23	NC_013770	AATAT	2	10	21267	21276	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_013770	CTAGT	2	10	21425	21434	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
25	NC_013770	TAACA	2	10	22026	22035	60 %	20 %	0 %	20 %	284807129
26	NC_013770	TTTAC	2	10	23587	23596	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
27	NC_013770	GAATT	2	10	23743	23752	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.