MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Sulfolobus islandicus L.D.8.5 plasmid pLD8501

Total Repeats: 34

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013770	TTGA	2	8	188	195	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_013770	CTTT	2	8	315	322	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_013770	TTTA	2	8	544	551	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_013770	TTCA	2	8	865	872	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_013770	GAAA	2	8	985	992	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NC_013770	AGCC	2	8	1437	1444	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
7	NC_013770	ATTT	2	8	1893	1900	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_013770	AAAG	2	8	1926	1933	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
9	NC_013770	AGGA	2	8	2075	2082	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_013770	CACC	2	8	2314	2321	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
11	NC_013770	TTAA	2	8	2368	2375	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_013770	ACTT	2	8	2390	2397	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
13	NC_013770	TGCC	2	8	2559	2566	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
14	NC_013770	AATT	2	8	3466	3473	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_013770	GATA	2	8	3579	3586	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
16	NC_013770	GGAT	2	8	7335	7342	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_013770	ACCT	2	8	7591	7598	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_013770	TGAG	2	8	7939	7946	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_013770	GGAG	2	8	8059	8066	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
20	NC_013770	CCTC	2	8	8575	8582	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
21	NC_013770	TCGT	2	8	8637	8644	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
22	NC_013770	AGTA	2	8	8779	8786	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_013770	ATTT	2	8	21466	21473	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_013770	GATA	2	8	21633	21640	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
25	NC_013770	TTTC	2	8	21825	21832	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
26	NC_013770	TAAG	2	8	23511	23518	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_013770	TTCT	2	8	23602	23609	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
28	NC_013770	AATA	2	8	23659	23666	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_013770	ATTT	2	8	23886	23893	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_013770	TTAA	2	8	24558	24565	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_013770	GGTT	2	8	24573	24580	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_013770	CTAA	2	8	24682	24689	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
33	NC_013770	TATT	2	8	25220	25227	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_013770	AAGA	2	8	26569	26576	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.