MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Sulfolobus islandicus L.D.8.5 plasmid pLD8501

Total Repeats: 148

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013770	TAG	2	6	139	144	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_013770	ATT	2	6	293	298	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_013770	GTT	2	6	304	309	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_013770	TTG	2	6	345	350	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_013770	TCT	2	6	401	406	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_013770	AGG	2	6	469	474	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_013770	ATT	2	6	515	520	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_013770	TCA	2	6	560	565	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_013770	TTA	2	6	699	704	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_013770	TCT	2	6	717	722	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_013770	ATC	2	6	724	729	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_013770	TAG	2	6	752	757	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_013770	ATA	2	6	818	823	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_013770	GTT	2	6	903	908	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_013770	ATG	2	6	1094	1099	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_013770	GAT	2	6	1117	1122	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_013770	CTT	2	6	1206	1211	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_013770	TCA	2	6	1305	1310	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_013770	ATC	2	6	1416	1421	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_013770	GCA	2	6	1446	1451	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_013770	ATA	2	6	1452	1457	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_013770	AGT	2	6	1494	1499	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_013770	ATG	2	6	1533	1538	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_013770	TAG	2	6	1574	1579	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_013770	ATA	2	6	1637	1642	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_013770	GAA	2	6	1655	1660	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_013770	AGG	2	6	1667	1672	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_013770	TGC	2	6	1688	1693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_013770	TTG	2	6	1694	1699	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_013770	ATG	2	6	1716	1721	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_013770	GTA	2	6	1728	1733	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_013770	TTA	2	6	1734	1739	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_013770	ATA	2	6	1768	1773	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_013770	GTA	2	6	1789	1794	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_013770	AGT	2	6	1828	1833	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_013770	CTT	2	6	1863	1868	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_013770	TCT	2	6	1887	1892	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_013770	TAT	2	6	1966	1971	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_013770	TAA	2	6	2033	2038	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_013770	AGA	2	6	2049	2054	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_013770	TAT	2	6	2107	2112	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_013770	ATT	2	6	2173	2178	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_013770	TTC	2	6	2192	2197	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_013770	CAA	2	6	2260	2265	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_013770	AGA	2	6	2340	2345	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_013770	ATT	2	6	2376	2381	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_013770	CCT	2	6	2423	2428	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
48	NC_013770	CGT	2	6	2478	2483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_013770	GCT	2	6	2494	2499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_013770	CTA	2	6	2637	2642	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_013770	TGC	2	6	2693	2698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_013770	TCT	2	6	5228	5233	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_013770	AAG	2	6	7251	7256	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_013770	AGG	2	6	7392	7397	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_013770	CCT	2	6	7448	7453	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
56	NC_013770	AAC	2	6	7464	7469	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_013770	GAG	2	6	7557	7562	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_013770	TAA	2	6	7655	7660	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_013770	GGA	2	6	7822	7827	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_013770	AGG	2	6	7831	7836	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_013770	TAA	2	6	7846	7851	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_013770	GTT	2	6	7875	7880	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_013770	AGG	2	6	7891	7896	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_013770	TGA	2	6	7997	8002	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_013770	CAC	2	6	8007	8012	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
66	NC_013770	CCA	2	6	8099	8104	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
67	NC_013770	AGA	2	6	8123	8128	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_013770	GTT	2	6	8154	8159	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_013770	AAT	2	6	8171	8176	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_013770	TCA	2	6	8215	8220	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_013770	CGT	2	6	8277	8282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_013770	TTG	2	6	8326	8331	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_013770	GGA	2	6	8551	8556	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
74	NC_013770	CTC	2	6	8588	8593	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
75	NC_013770	CTC	2	6	8609	8614	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
76	NC_013770	CTA	2	6	8721	8726	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_013770	TTC	2	6	8873	8878	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_013770	CCT	2	6	9001	9006	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
79	NC_013770	TCG	2	6	9045	9050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_013770	TAT	2	6	9095	9100	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_013770	TAT	2	6	9107	9112	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_013770	TTA	2	6	11787	11792	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_013770	AAT	2	6	12171	12176	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_013770	ATA	2	6	14232	14237	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_013770	AAT	2	6	14255	14260	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_013770	TTA	2	6	16156	16161	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_013770	TCT	2	6	19004	19009	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_013770	AAG	2	6	19041	19046	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_013770	GTG	2	6	21284	21289	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_013770	TTC	2	6	21320	21325	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_013770	TTC	3	9	21346	21354	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_013770	GGT	2	6	21445	21450	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_013770	TAT	2	6	21455	21460	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_013770	GAT	2	6	21492	21497	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_013770	ATA	2	6	21529	21534	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_013770	AGA	2	6	21569	21574	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_013770	ACA	2	6	21654	21659	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_013770	GAT	2	6	21690	21695	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_013770	TAA	2	6	21707	21712	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_013770	TCT	2	6	21716	21721	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_013770	ATA	2	6	21819	21824	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_013770	TAT	2	6	21917	21922	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_013770	ATT	2	6	21964	21969	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_013770	ATA	2	6	22970	22975	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_013770	TTC	2	6	23380	23385	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_013770	CTC	2	6	23429	23434	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
107	NC_013770	TTA	2	6	23459	23464	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_013770	TAT	2	6	23638	23643	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_013770	TAA	2	6	23648	23653	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_013770	GAG	2	6	23672	23677	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
111	NC_013770	TAA	2	6	23715	23720	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_013770	ATT	2	6	23805	23810	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_013770	ATA	2	6	23826	23831	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_013770	ATG	2	6	23850	23855	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_013770	AGA	2	6	23856	23861	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_013770	ATA	2	6	23874	23879	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_013770	CTC	2	6	23915	23920	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
118	NC_013770	GAA	2	6	23929	23934	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_013770	AGT	2	6	23943	23948	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_013770	TCT	2	6	24057	24062	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_013770	TGA	2	6	24070	24075	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_013770	AAC	2	6	24081	24086	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_013770	CTT	2	6	24385	24390	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_013770	ATT	2	6	24705	24710	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_013770	AAG	2	6	24806	24811	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_013770	AAG	2	6	24871	24876	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_013770	ATG	2	6	24958	24963	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_013770	GAA	2	6	25021	25026	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_013770	CAA	2	6	25070	25075	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_013770	GAA	2	6	25078	25083	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_013770	GCG	2	6	25168	25173	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_013770	AGT	2	6	25233	25238	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_013770	CGC	3	9	25316	25324	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
134	NC_013770	TTC	2	6	25384	25389	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_013770	AAT	2	6	25467	25472	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_013770	CAA	2	6	25493	25498	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_013770	AGA	2	6	25547	25552	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_013770	ATT	2	6	25553	25558	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_013770	AGA	2	6	25569	25574	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
140	NC_013770	ACA	2	6	25602	25607	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_013770	GGA	2	6	25612	25617	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
142	NC_013770	TTC	2	6	25642	25647	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_013770	GAG	2	6	25692	25697	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
144	NC_013770	GAG	2	6	25728	25733	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
145	NC_013770	CTT	2	6	25734	25739	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_013770	TAT	2	6	25776	25781	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_013770	TCC	2	6	26502	26507	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
148	NC_013770	TTC	2	6	26538	26543	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.