MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Listeria monocytogenes 08-5923

Total Repeats: 102

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013768	ATACTT	2	12	56767	56778	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_013768	TTTTTA	2	12	57634	57645	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_013768	ATTGAT	2	12	57717	57728	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_013768	ATAAAA	2	12	127984	127995	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_013768	GAAAGG	2	12	171867	171878	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_013768	GATTTA	2	12	198901	198912	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_013768	AAGAGG	2	12	220373	220384	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_013768	ATTTTT	2	12	258972	258983	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_013768	ATTCAA	2	12	263859	263870	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_013768	AAGGAA	2	12	265430	265441	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_013768	TAGGCG	2	12	267334	267345	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_013768	AGTCAA	2	12	269148	269159	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_013768	TTTACC	2	12	269577	269588	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_013768	TTATAT	2	12	283932	283943	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_013768	AACTTT	2	12	316899	316910	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_013768	AATACA	2	12	325491	325502	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_013768	CATAGA	2	12	367448	367459	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_013768	ATGATA	2	12	405823	405834	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_013768	AGTGCT	2	12	417465	417476	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_013768	ACAAAA	2	12	481173	481184	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_013768	TTAAAT	2	12	504692	504703	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_013768	CTATAA	2	12	506461	506472	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_013768	TTAGGT	2	12	560656	560667	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_013768	AGATTT	2	12	574429	574440	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_013768	ATCATT	2	12	643065	643076	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_013768	TATTTT	2	12	682212	682223	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_013768	ATCATT	2	12	685742	685753	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_013768	TATAGG	2	12	730232	730243	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_013768	TTACTT	2	12	855317	855328	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_013768	TGAAAT	2	12	866452	866463	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_013768	ATTTTA	2	12	871213	871224	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_013768	AAATAG	2	12	893096	893107	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_013768	GTAATC	2	12	899899	899910	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_013768	TTACAA	2	12	899917	899928	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_013768	ATGAAA	2	12	908512	908523	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_013768	TTGACT	2	12	1031773	1031784	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_013768	AGGAAG	2	12	1041964	1041975	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_013768	CTTTTT	2	12	1101698	1101709	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_013768	TTATGG	2	12	1151300	1151311	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_013768	TTTAGT	2	12	1155296	1155307	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_013768	TTTTAA	2	12	1189601	1189612	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_013768	CTTTTT	2	12	1227596	1227607	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_013768	GAAAAA	2	12	1257573	1257584	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_013768	TATTAA	2	12	1328797	1328808	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_013768	TATTAA	2	12	1479547	1479558	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_013768	TACCAA	2	12	1495961	1495972	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_013768	ATAAAA	2	12	1513726	1513737	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_013768	TTTCAT	2	12	1522120	1522131	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_013768	CTCTTC	2	12	1626067	1626078	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_013768	GGTATA	2	12	1659321	1659332	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_013768	GGTTGT	2	12	1676717	1676728	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_013768	GGTTGT	2	12	1678178	1678189	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_013768	GAATAA	2	12	1679732	1679743	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_013768	GTAAAC	2	12	1680883	1680894	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_013768	ACAAAA	2	12	1689507	1689518	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_013768	AAAATA	2	12	1693825	1693836	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_013768	TAAAAA	2	12	1694735	1694746	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_013768	TAAAAA	2	12	1721480	1721491	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_013768	ATGAAA	2	12	1740982	1740993	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_013768	CGCCTA	2	12	1781799	1781810	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
61	NC_013768	TTTCCT	2	12	1783451	1783462	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_013768	TTGAAT	2	12	1785023	1785034	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_013768	TGTAAT	2	12	1815961	1815972	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_013768	TTTTGA	2	12	1831748	1831759	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_013768	GTTCTT	2	12	1846889	1846900	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_013768	TGTCAT	2	12	1850925	1850936	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_013768	AAAAAC	2	12	1905277	1905288	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_013768	CGCCTA	2	12	1935716	1935727	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
69	NC_013768	TTTCCT	2	12	1937367	1937378	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_013768	TTGAAT	2	12	1938939	1938950	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_013768	GTTTTA	2	12	1946860	1946871	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
72	NC_013768	AAAAAG	2	12	2030044	2030055	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_013768	CTCTAT	2	12	2047763	2047774	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_013768	TCATTT	2	12	2048961	2048972	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_013768	GTTTTC	2	12	2076130	2076141	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_013768	CAAAAA	2	12	2093854	2093865	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_013768	GAAAAA	2	12	2097716	2097727	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
78	NC_013768	TCTTTT	2	12	2155858	2155869	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_013768	GAAGTT	2	12	2214246	2214257	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_013768	ATTCAA	2	12	2249811	2249822	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_013768	AAAAGA	2	12	2276271	2276282	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_013768	TTATAT	2	12	2311276	2311287	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_013768	AATTTT	2	12	2364066	2364077	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_013768	AAATTG	2	12	2370241	2370252	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
85	NC_013768	CTCTGT	2	12	2377086	2377097	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_013768	TAACGC	2	12	2475359	2475370	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_013768	TAATAC	2	12	2500395	2500406	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_013768	CGCCTA	2	12	2521193	2521204	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
89	NC_013768	TTTCCT	2	12	2523096	2523107	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_013768	TTGAAT	2	12	2524668	2524679	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
91	NC_013768	TTCAAA	2	12	2606973	2606984	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_013768	CTTTTT	2	12	2672199	2672210	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_013768	ATCCCA	2	12	2692114	2692125	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
94	NC_013768	AAAAGA	2	12	2697945	2697956	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
95	NC_013768	TTTTTA	2	12	2703941	2703952	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_013768	CGCCTA	2	12	2755472	2755483	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
97	NC_013768	TTTCCT	2	12	2757124	2757135	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_013768	TTGAAT	2	12	2758696	2758707	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
99	NC_013768	GTTTTC	2	12	2769379	2769390	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_013768	ACTCAA	2	12	2871828	2871839	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_013768	ACAGCC	2	12	2910498	2910509	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
102	NC_013768	TTTTAT	2	12	2934677	2934688	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.