MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Listeria monocytogenes 08-5923

Total Repeats: 1082

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013768	TGCTCT	2	12	2127	2138	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	284993444
2	NC_013768	GAAGGA	2	12	3306	3317	50 %	0 %	50 %	0 %	284993446
3	NC_013768	TAAAAG	2	12	4174	4185	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	284993447
4	NC_013768	CAGAAA	2	12	9661	9672	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	284993452
5	NC_013768	GGTTGT	2	12	14990	15001	0 %	50 %	50 %	0 %	284993456
6	NC_013768	GCATTC	2	12	19268	19279	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	284993459
7	NC_013768	GTTGGT	2	12	27045	27056	0 %	50 %	50 %	0 %	284993466
8	NC_013768	CTTGTT	2	12	27491	27502	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	284993467
9	NC_013768	ATTTTA	2	12	29573	29584	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284993471
10	NC_013768	AATGCC	2	12	32170	32181	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	284993473
11	NC_013768	ATTGAT	2	12	33001	33012	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	284993473
12	NC_013768	TGTGTT	2	12	35010	35021	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	284993476
13	NC_013768	GAATAT	2	12	38581	38592	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	284993477
14	NC_013768	GAAACG	2	12	38723	38734	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	284993477
15	NC_013768	CAAGGT	2	12	40718	40729	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	284993478
16	NC_013768	GAAACA	2	12	42841	42852	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	284993480
17	NC_013768	TTTTGG	2	12	44301	44312	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	284993481
18	NC_013768	AATTTT	2	12	47267	47278	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284993484
19	NC_013768	CTAAAA	2	12	48655	48666	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	284993486
20	NC_013768	TGCAGA	2	12	54595	54606	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	284993493
21	NC_013768	GAAAGC	2	12	67794	67805	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	284993509
22	NC_013768	ATTGAA	2	12	67866	67877	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	284993509
23	NC_013768	TGCTTT	2	12	70513	70524	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	284993512
24	NC_013768	AAGTGG	2	12	70959	70970	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	284993512
25	NC_013768	GAATTA	2	12	74465	74476	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	284993515
26	NC_013768	TGTTTA	2	12	77151	77162	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	284993516
27	NC_013768	AAAGAT	2	12	80900	80911	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	284993520
28	NC_013768	TTTATT	2	12	82023	82034	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	284993521
29	NC_013768	AAAAAT	2	12	83142	83153	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	284993522
30	NC_013768	GTGCAT	2	12	89049	89060	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	284993528
31	NC_013768	TTTTCT	2	12	91216	91227	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	284993528
32	NC_013768	AGAAAC	2	12	93606	93617	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	284993531
33	NC_013768	ACAGAG	2	12	94390	94401	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	284993532
34	NC_013768	CAAGAA	2	12	95077	95088	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	284993532
35	NC_013768	TGCTTC	2	12	95326	95337	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	284993533
36	NC_013768	TTCAAT	2	12	97914	97925	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	284993536
37	NC_013768	AAGATA	2	12	104787	104798	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	284993542
38	NC_013768	GGTTAT	2	12	105245	105256	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	284993542
39	NC_013768	TTCTAC	2	12	115588	115599	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	284993549
40	NC_013768	CCTGGT	2	12	117691	117702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284993550
41	NC_013768	TCGCCA	2	12	130965	130976	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	284993564
42	NC_013768	TGGAAG	2	12	134670	134681	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	284993566
43	NC_013768	TAGTTG	2	12	140051	140062	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	284993573
44	NC_013768	TAAAAA	2	12	140589	140600	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	284993574
45	NC_013768	AATGGC	2	12	141161	141172	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	284993575
46	NC_013768	AGTGAC	2	12	142709	142720	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	284993576
47	NC_013768	ATTTTC	2	12	143443	143454	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	284993578
48	NC_013768	AATTGG	2	12	144538	144549	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284993579
49	NC_013768	GATATG	2	12	149386	149397	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284993583
50	NC_013768	CCATGA	2	12	150596	150607	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	284993584
51	NC_013768	TCTAAT	2	12	155194	155205	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	284993587
52	NC_013768	ACTGTT	2	12	159998	160009	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	284993592
53	NC_013768	AATGGT	2	12	160765	160776	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284993592
54	NC_013768	AAGCAG	2	12	161981	161992	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	284993595
55	NC_013768	TGATGC	2	12	163938	163949	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	284993596
56	NC_013768	CGATTT	2	12	167975	167986	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	284993602
57	NC_013768	TCAAGA	2	12	172646	172657	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	284993608
58	NC_013768	GTGTTA	2	12	173535	173546	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	284993609
59	NC_013768	ATTTTT	2	12	179237	179248	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	284993612
60	NC_013768	ATTTTT	2	12	181224	181235	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	284993614
61	NC_013768	GGTAAA	2	12	181546	181557	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	284993614
62	NC_013768	TACAAG	2	12	182786	182797	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	284993616
63	NC_013768	TTTGTA	2	12	184857	184868	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	284993618
64	NC_013768	GATGTG	2	12	187223	187234	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	284993619
65	NC_013768	ACGAAA	2	12	191407	191418	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	284993621
66	NC_013768	GAAGAT	2	12	191694	191705	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	284993622
67	NC_013768	TTATTT	2	12	196406	196417	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	284993628
68	NC_013768	CGATTT	2	12	198090	198101	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	284993631
69	NC_013768	GGTATG	2	12	201796	201807	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	284993634
70	NC_013768	TTGATA	2	12	202269	202280	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	284993635
71	NC_013768	GCGAAA	2	12	211219	211230	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	284993643
72	NC_013768	GCAAGA	2	12	212668	212679	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	284993646
73	NC_013768	AGTTGA	2	12	212773	212784	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284993646
74	NC_013768	AAACAG	2	12	212850	212861	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	284993646
75	NC_013768	AACGTG	2	12	213543	213554	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	284993646
76	NC_013768	ATTTGA	2	12	214063	214074	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	284993646
77	NC_013768	ACGAAA	2	12	221459	221470	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	284993653
78	NC_013768	TAACGC	2	12	228168	228179	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	284993660
79	NC_013768	GTCTTT	2	12	230938	230949	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	284993662
80	NC_013768	GTATTT	2	12	235014	235025	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	284993666
81	NC_013768	CAGTAA	2	12	236258	236269	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	284993668
82	NC_013768	GTGAAA	2	12	237315	237326	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	284993669
83	NC_013768	TGTTAC	2	12	237702	237713	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	284993670
84	NC_013768	GTGCAA	2	12	239300	239311	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	284993673
85	NC_013768	GTAAAG	2	12	240280	240291	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	284993675
86	NC_013768	CAACAG	2	12	243039	243050	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	284993683
87	NC_013768	TAAAGG	2	12	243445	243456	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	284993683
88	NC_013768	AAACAA	2	12	247933	247944	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	284993691
89	NC_013768	TACTCG	2	12	248094	248105	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	284993692
90	NC_013768	TCGTGG	2	12	249284	249295	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	284993694
91	NC_013768	GAATAT	2	12	252074	252085	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	284993697
92	NC_013768	TTTTTA	2	12	252356	252367	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	284993697
93	NC_013768	ATTTTT	2	12	255236	255247	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	284993701
94	NC_013768	TAAGTA	2	12	258451	258462	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	284993705
95	NC_013768	AAGTAC	2	12	262657	262668	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	284993709
96	NC_013768	AAATGG	2	12	263495	263506	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	284993709
97	NC_013768	AGTAAA	2	12	276834	276845	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	284993716
98	NC_013768	AAAGGA	2	12	280094	280105	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284993719
99	NC_013768	ACAGTA	2	12	284261	284272	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	284993725
100	NC_013768	AAAACA	2	12	284636	284647	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	284993726
101	NC_013768	GCATGG	2	12	284817	284828	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	284993726
102	NC_013768	CTGTAG	2	12	287761	287772	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	284993731
103	NC_013768	GACAAT	2	12	289579	289590	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	284993734
104	NC_013768	AAAGCG	2	12	290399	290410	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	284993734
105	NC_013768	TAAAAA	2	12	291298	291309	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	284993735
106	NC_013768	TGAATC	2	12	292083	292094	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	284993736
107	NC_013768	GCTACT	2	12	293775	293786	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	284993737
108	NC_013768	TTCTGA	2	12	296849	296860	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	284993739
109	NC_013768	AAGAAA	2	12	300065	300076	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	284993741
110	NC_013768	TACACT	2	12	304309	304320	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284993742
111	NC_013768	TTCGTG	2	12	305821	305832	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	284993742
112	NC_013768	CCAAAT	2	12	311810	311821	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	284993746
113	NC_013768	GAATTA	2	12	314418	314429	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	284993748
114	NC_013768	CGAAAT	2	12	318718	318729	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	284993752
115	NC_013768	TCTTTT	2	12	321681	321692	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	284993754
116	NC_013768	AGTTCA	2	12	323946	323957	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	284993756
117	NC_013768	ATCAAT	2	12	324089	324100	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	284993756
118	NC_013768	ATGAAA	2	12	324447	324458	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	284993757
119	NC_013768	CTTTTA	2	12	326320	326331	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	284993759
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226	NC_013768	ATTTGT	4	24	622970	622993	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	284994048
227	NC_013768	ATAAAG	2	12	625246	625257	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	284994049
228	NC_013768	ACTTGA	2	12	626657	626668	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	284994049
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