MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Listeria monocytogenes 08-5923

Total Repeats: 38966

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013768	GAC	2	6	257	262	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284993441
2	NC_013768	TTA	2	6	275	280	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284993441
3	NC_013768	CAG	2	6	300	305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284993441
4	NC_013768	GAA	2	6	419	424	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284993441
5	NC_013768	TAA	2	6	516	521	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	284993441
6	NC_013768	CTG	2	6	546	551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284993441
7	NC_013768	AAT	2	6	654	659	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	284993441
8	NC_013768	GTC	3	9	923	931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284993442
9	NC_013768	GAA	2	6	938	943	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284993442
10	NC_013768	TGT	2	6	1133	1138	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	284993443
11	NC_013768	AAG	2	6	1153	1158	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284993443
12	NC_013768	ATC	2	6	1296	1301	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284993443
13	NC_013768	CGG	2	6	1312	1317	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284993443
14	NC_013768	GAA	3	9	1452	1460	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284993444
15	NC_013768	GTT	2	6	1660	1665	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	284993444
16	NC_013768	ACA	2	6	1806	1811	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	284993444
17	NC_013768	ATG	2	6	1852	1857	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284993444
18	NC_013768	GTT	2	6	1859	1864	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	284993444
19	NC_013768	ATT	2	6	1869	1874	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284993444
20	NC_013768	CTA	2	6	1891	1896	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284993444
21	NC_013768	TAG	2	6	1914	1919	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284993444
22	NC_013768	CAG	2	6	1922	1927	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284993444
23	NC_013768	GTT	2	6	1993	1998	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	284993444
24	NC_013768	AAC	2	6	2007	2012	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	284993444
25	NC_013768	ATC	2	6	2019	2024	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284993444
26	NC_013768	ATG	2	6	2035	2040	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284993444
27	NC_013768	CAT	2	6	2082	2087	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284993444
28	NC_013768	AGG	2	6	2216	2221	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284993444
29	NC_013768	GAA	2	6	2256	2261	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284993444
30	NC_013768	GAA	2	6	2343	2348	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284993445
31	NC_013768	ACA	2	6	2379	2384	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	284993445
32	NC_013768	AGA	2	6	2477	2482	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284993445
33	NC_013768	AGA	2	6	2555	2560	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284993445
34	NC_013768	TAA	2	6	2669	2674	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	284993445
35	NC_013768	AAC	2	6	2675	2680	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	284993445
36	NC_013768	ATT	2	6	2697	2702	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284993445
37	NC_013768	ATT	2	6	2832	2837	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284993445
38	NC_013768	GAT	2	6	3044	3049	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284993446
39	NC_013768	TGG	2	6	3107	3112	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284993446
40	NC_013768	AGC	2	6	3144	3149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284993446
41	NC_013768	GAA	2	6	3225	3230	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284993446
42	NC_013768	TAT	2	6	3263	3268	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284993446
43	NC_013768	GAA	2	6	3396	3401	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284993446
44	NC_013768	GTT	2	6	3411	3416	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	284993446
45	NC_013768	GTT	2	6	3432	3437	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	284993446
46	NC_013768	AAT	2	6	3589	3594	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	284993447
47	NC_013768	TGC	2	6	3634	3639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284993447
48	NC_013768	TAA	2	6	3783	3788	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	284993447
49	NC_013768	TGG	2	6	3798	3803	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284993447
50	NC_013768	GTG	2	6	3806	3811	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284993447
51	NC_013768	ATC	2	6	3832	3837	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284993447
52	NC_013768	TGA	2	6	3907	3912	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284993447
53	NC_013768	TTC	3	9	3916	3924	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284993447
54	NC_013768	TTG	2	6	3958	3963	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	284993447
55	NC_013768	ATA	2	6	3992	3997	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	284993447
56	NC_013768	GAA	3	9	4032	4040	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284993447
57	NC_013768	TTG	2	6	4096	4101	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	284993447
58	NC_013768	TGA	2	6	4119	4124	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284993447
59	NC_013768	ATG	2	6	4156	4161	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284993447
60	NC_013768	GAA	2	6	4333	4338	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284993447
61	NC_013768	TAA	2	6	4348	4353	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	284993447
62	NC_013768	TGC	2	6	4359	4364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284993447
63	NC_013768	TGG	2	6	4793	4798	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284993448
64	NC_013768	ATT	2	6	4872	4877	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284993448
65	NC_013768	TTA	2	6	4902	4907	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284993448
66	NC_013768	ATT	2	6	5064	5069	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284993448
67	NC_013768	TAG	2	6	5305	5310	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284993448
68	NC_013768	TAT	2	6	5395	5400	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284993448
69	NC_013768	CAG	2	6	5410	5415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284993448
70	NC_013768	GTT	2	6	5468	5473	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	284993448
71	NC_013768	CTT	2	6	5500	5505	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284993448
72	NC_013768	TTG	2	6	5521	5526	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	284993448
73	NC_013768	CAG	2	6	5575	5580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284993448
74	NC_013768	CAA	2	6	5629	5634	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	284993448
75	NC_013768	GTG	2	6	5641	5646	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284993448
76	NC_013768	GTA	2	6	5680	5685	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284993448
77	NC_013768	TGA	2	6	5825	5830	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284993448
78	NC_013768	AGA	2	6	5969	5974	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284993449
79	NC_013768	TTG	2	6	6336	6341	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	284993449
80	NC_013768	AAC	2	6	6389	6394	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	284993449
81	NC_013768	ATT	2	6	6434	6439	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284993449
82	NC_013768	GGT	2	6	6602	6607	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284993449
83	NC_013768	CAG	2	6	6616	6621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284993449
84	NC_013768	AGT	2	6	6645	6650	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284993449
85	NC_013768	AGC	2	6	6701	6706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284993449
86	NC_013768	GAC	2	6	6807	6812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284993449
87	NC_013768	ATT	2	6	6873	6878	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284993449
88	NC_013768	ATG	2	6	6886	6891	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284993449
89	NC_013768	TAA	2	6	6899	6904	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	284993449
90	NC_013768	TGG	2	6	6916	6921	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284993449
91	NC_013768	TAT	2	6	7014	7019	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284993449
92	NC_013768	GGT	2	6	7083	7088	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284993449
93	NC_013768	GAA	2	6	7231	7236	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284993449
94	NC_013768	ATT	2	6	7239	7244	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284993449
95	NC_013768	AGG	2	6	7336	7341	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284993449
96	NC_013768	CTG	2	6	7469	7474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284993450
97	NC_013768	GAT	2	6	7482	7487	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284993450
98	NC_013768	AAG	2	6	7810	7815	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284993450
99	NC_013768	TAA	2	6	7898	7903	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	284993450
100	NC_013768	AAG	2	6	8020	8025	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284993450
101	NC_013768	TAA	2	6	8165	8170	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	284993450
102	NC_013768	TCT	2	6	8175	8180	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284993450
103	NC_013768	GTC	2	6	8218	8223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284993450
104	NC_013768	GAT	2	6	8259	8264	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284993450
105	NC_013768	TTC	2	6	8334	8339	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284993450
106	NC_013768	CAA	2	6	8344	8349	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	284993450
107	NC_013768	TGC	2	6	8360	8365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284993450
108	NC_013768	GTT	2	6	8370	8375	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	284993450
109	NC_013768	AGA	2	6	8483	8488	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284993450
110	NC_013768	ACT	2	6	8521	8526	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284993450
111	NC_013768	AAG	2	6	8569	8574	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284993450
112	NC_013768	GAA	2	6	8586	8591	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284993450
113	NC_013768	TTA	2	6	8653	8658	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284993451
114	NC_013768	ACT	2	6	8673	8678	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284993451
115	NC_013768	TTG	2	6	8733	8738	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	284993451
116	NC_013768	AAG	2	6	8746	8751	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284993451
117	NC_013768	ATC	2	6	8778	8783	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284993451
118	NC_013768	GAA	2	6	8871	8876	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284993451
119	NC_013768	TGT	2	6	8935	8940	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	284993451
120	NC_013768	CGG	2	6	8954	8959	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284993451
121	NC_013768	GTT	2	6	9033	9038	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	284993451
122	NC_013768	ATT	2	6	9165	9170	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284993451
123	NC_013768	AGC	2	6	9320	9325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284993451
124	NC_013768	AGG	2	6	9445	9450	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284993451
125	NC_013768	AAT	2	6	9455	9460	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	284993452
126	NC_013768	TAT	2	6	9476	9481	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284993452
127	NC_013768	TAA	2	6	9497	9502	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	284993452
128	NC_013768	AGA	2	6	9503	9508	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284993452
129	NC_013768	ACG	2	6	9523	9528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284993452
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131	NC_013768	GTG	2	6	9683	9688	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284993452
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