MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Listeria monocytogenes 08-5578 plasmid pLM5578

Total Repeats: 24

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013767	TTTAAT	2	12	400	411	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284803267
2	NC_013767	ATTAAA	2	12	2002	2013	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	284803267
3	NC_013767	AAGATG	2	12	2735	2746	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	284803268
4	NC_013767	TGCACT	2	12	3410	3421	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	284803269
5	NC_013767	TCAGAG	2	12	6009	6020	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	284803269
6	NC_013767	CAAATT	2	12	6623	6634	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	284803270
7	NC_013767	TGAAAG	2	12	9431	9442	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	284803272
8	NC_013767	GCGTCA	2	12	11128	11139	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	284803275
9	NC_013767	ATCGAG	2	12	17561	17572	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	284803282
10	NC_013767	ATCGAT	2	12	21741	21752	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	284803286
11	NC_013767	ACAGCA	2	12	26689	26700	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	284803290
12	NC_013767	CTTTTC	2	12	31769	31780	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284803297
13	NC_013767	CAAAAA	2	12	33205	33216	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	284803298
14	NC_013767	AAAGAT	2	12	34485	34496	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	284803298
15	NC_013767	GAAAGT	2	12	34745	34756	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	284803299
16	NC_013767	GGGAAT	2	12	40998	41009	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	284803310
17	NC_013767	TGAAAG	2	12	45894	45905	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	284803315
18	NC_013767	ATTTTT	2	12	51095	51106	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	284803318
19	NC_013767	CTGTTT	2	12	52266	52277	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	284803320
20	NC_013767	CAGATG	2	12	53094	53105	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	284803320
21	NC_013767	ACAAAA	2	12	55626	55637	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	284803322
22	NC_013767	AAAGAA	2	12	59201	59212	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	284803327
23	NC_013767	TTTTTC	2	12	64785	64796	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	284803335
24	NC_013767	TGTCGT	2	12	71351	71362	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	284803340

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.