MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Listeria monocytogenes 08-5578 plasmid pLM5578

Total Repeats: 46

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013767	GATTG	2	10	179	188	20 %	40 %	40 %	0 %	284803267
2	NC_013767	GTACA	2	10	720	729	40 %	20 %	20 %	20 %	284803267
3	NC_013767	ATGAT	2	10	2156	2165	40 %	40 %	20 %	0 %	284803268
4	NC_013767	GAAAG	2	10	2295	2304	60 %	0 %	40 %	0 %	284803268
5	NC_013767	GAAAA	2	10	2504	2513	80 %	0 %	20 %	0 %	284803268
6	NC_013767	AAGAA	2	10	2961	2970	80 %	0 %	20 %	0 %	284803268
7	NC_013767	CAAAT	2	10	3245	3254	60 %	20 %	0 %	20 %	284803269
8	NC_013767	TTTTC	2	10	4327	4336	0 %	80 %	0 %	20 %	284803269
9	NC_013767	GACTG	2	10	7012	7021	20 %	20 %	40 %	20 %	284803271
10	NC_013767	TCTCT	2	10	11879	11888	0 %	60 %	0 %	40 %	284803276
11	NC_013767	AGCTT	2	10	14818	14827	20 %	40 %	20 %	20 %	284803278
12	NC_013767	TCTAT	2	10	18229	18238	20 %	60 %	0 %	20 %	284803283
13	NC_013767	GGTTT	2	10	19823	19832	0 %	60 %	40 %	0 %	284803284
14	NC_013767	GGGAA	2	10	22719	22728	40 %	0 %	60 %	0 %	284803286
15	NC_013767	CGAAA	2	10	24048	24057	60 %	0 %	20 %	20 %	284803287
16	NC_013767	AAATG	2	10	27144	27153	60 %	20 %	20 %	0 %	284803291
17	NC_013767	ATGAT	2	10	30961	30970	40 %	40 %	20 %	0 %	284803297
18	NC_013767	ATCAA	2	10	34435	34444	60 %	20 %	0 %	20 %	284803298
19	NC_013767	AAAAG	2	10	36491	36500	80 %	0 %	20 %	0 %	284803301
20	NC_013767	AAAAG	2	10	36921	36930	80 %	0 %	20 %	0 %	284803302
21	NC_013767	TGGAT	2	10	37189	37198	20 %	40 %	40 %	0 %	284803302
22	NC_013767	TGACA	2	10	37739	37748	40 %	20 %	20 %	20 %	284803303
23	NC_013767	AAAAG	2	10	39159	39168	80 %	0 %	20 %	0 %	284803306
24	NC_013767	ATCTT	2	10	39922	39931	20 %	60 %	0 %	20 %	284803307
25	NC_013767	TAAGG	2	10	46196	46205	40 %	20 %	40 %	0 %	284803316
26	NC_013767	ACCAA	2	10	47249	47258	60 %	0 %	0 %	40 %	284803316
27	NC_013767	GGTTG	2	10	49646	49655	0 %	40 %	60 %	0 %	284803317
28	NC_013767	ATGGA	2	10	49722	49731	40 %	20 %	40 %	0 %	284803317
29	NC_013767	TCGTT	2	10	49873	49882	0 %	60 %	20 %	20 %	284803317
30	NC_013767	CGATT	2	10	50238	50247	20 %	40 %	20 %	20 %	284803317
31	NC_013767	TAGAC	2	10	51598	51607	40 %	20 %	20 %	20 %	284803319
32	NC_013767	CAAAT	2	10	51766	51775	60 %	20 %	0 %	20 %	284803319
33	NC_013767	CTATT	2	10	51972	51981	20 %	60 %	0 %	20 %	284803319
34	NC_013767	CCACT	2	10	55540	55549	20 %	20 %	0 %	60 %	284803322
35	NC_013767	TTATC	2	10	55801	55810	20 %	60 %	0 %	20 %	284803323
36	NC_013767	GTATT	2	10	57722	57731	20 %	60 %	20 %	0 %	284803326
37	NC_013767	GAAAA	2	10	57982	57991	80 %	0 %	20 %	0 %	284803326
38	NC_013767	GATCG	2	10	61432	61441	20 %	20 %	40 %	20 %	284803331
39	NC_013767	CAAGA	2	10	62717	62726	60 %	0 %	20 %	20 %	284803332
40	NC_013767	TGTTC	2	10	64083	64092	0 %	60 %	20 %	20 %	284803334
41	NC_013767	TTTCT	2	10	68056	68065	0 %	80 %	0 %	20 %	284803338
42	NC_013767	TTTAA	2	10	68183	68192	40 %	60 %	0 %	0 %	284803338
43	NC_013767	AGACA	2	10	70703	70712	60 %	0 %	20 %	20 %	284803340
44	NC_013767	GAAAA	2	10	73912	73921	80 %	0 %	20 %	0 %	284803342
45	NC_013767	ATTTT	2	10	74861	74870	20 %	80 %	0 %	0 %	284803343
46	NC_013767	ATTCA	2	10	75394	75403	40 %	40 %	0 %	20 %	284803343

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.