MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Listeria monocytogenes 08-5578 plasmid pLM5578

Total Repeats: 273

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013767	TGAT	2	8	510	517	25 %	50 %	25 %	0 %	284803267
2	NC_013767	AGTA	2	8	862	869	50 %	25 %	25 %	0 %	284803267
3	NC_013767	AAAG	2	8	1481	1488	75 %	0 %	25 %	0 %	284803267
4	NC_013767	AAAG	2	8	1628	1635	75 %	0 %	25 %	0 %	284803267
5	NC_013767	GAAA	2	8	2133	2140	75 %	0 %	25 %	0 %	284803268
6	NC_013767	GAAA	2	8	2185	2192	75 %	0 %	25 %	0 %	284803268
7	NC_013767	TGGA	2	8	2471	2478	25 %	25 %	50 %	0 %	284803268
8	NC_013767	AATT	2	8	2940	2947	50 %	50 %	0 %	0 %	284803268
9	NC_013767	AAGC	2	8	3935	3942	50 %	0 %	25 %	25 %	284803269
10	NC_013767	ATTG	2	8	4013	4020	25 %	50 %	25 %	0 %	284803269
11	NC_013767	ATTC	2	8	4292	4299	25 %	50 %	0 %	25 %	284803269
12	NC_013767	AGTG	2	8	4610	4617	25 %	25 %	50 %	0 %	284803269
13	NC_013767	CTTC	2	8	4674	4681	0 %	50 %	0 %	50 %	284803269
14	NC_013767	ATTT	2	8	4856	4863	25 %	75 %	0 %	0 %	284803269
15	NC_013767	ATCA	2	8	5108	5115	50 %	25 %	0 %	25 %	284803269
16	NC_013767	GATC	2	8	5239	5246	25 %	25 %	25 %	25 %	284803269
17	NC_013767	ATTG	2	8	5387	5394	25 %	50 %	25 %	0 %	284803269
18	NC_013767	ATTG	2	8	5743	5750	25 %	50 %	25 %	0 %	284803269
19	NC_013767	TGGA	2	8	5901	5908	25 %	25 %	50 %	0 %	284803269
20	NC_013767	GTTG	2	8	5989	5996	0 %	50 %	50 %	0 %	284803269
21	NC_013767	AGAA	2	8	6065	6072	75 %	0 %	25 %	0 %	284803269
22	NC_013767	AGTT	2	8	6117	6124	25 %	50 %	25 %	0 %	284803270
23	NC_013767	TTCC	2	8	6126	6133	0 %	50 %	0 %	50 %	284803270
24	NC_013767	ATTG	2	8	6234	6241	25 %	50 %	25 %	0 %	284803270
25	NC_013767	TCAA	2	8	6450	6457	50 %	25 %	0 %	25 %	284803270
26	NC_013767	ACTC	2	8	6647	6654	25 %	25 %	0 %	50 %	284803270
27	NC_013767	TCTG	2	8	7063	7070	0 %	50 %	25 %	25 %	284803271
28	NC_013767	AGAA	2	8	7514	7521	75 %	0 %	25 %	0 %	284803272
29	NC_013767	TATT	2	8	7664	7671	25 %	75 %	0 %	0 %	284803272
30	NC_013767	AAGG	2	8	7705	7712	50 %	0 %	50 %	0 %	284803272
31	NC_013767	GATG	2	8	8007	8014	25 %	25 %	50 %	0 %	284803272
32	NC_013767	TCAA	2	8	8042	8049	50 %	25 %	0 %	25 %	284803272
33	NC_013767	GCCA	2	8	8262	8269	25 %	0 %	25 %	50 %	284803272
34	NC_013767	CATC	2	8	8708	8715	25 %	25 %	0 %	50 %	284803272
35	NC_013767	AGTG	2	8	8826	8833	25 %	25 %	50 %	0 %	284803272
36	NC_013767	GCAA	2	8	9006	9013	50 %	0 %	25 %	25 %	284803272
37	NC_013767	GGTG	2	8	9024	9031	0 %	25 %	75 %	0 %	284803272
38	NC_013767	ATTA	2	8	9443	9450	50 %	50 %	0 %	0 %	284803272
39	NC_013767	GAAA	2	8	9646	9653	75 %	0 %	25 %	0 %	284803273
40	NC_013767	ACAT	2	8	9845	9852	50 %	25 %	0 %	25 %	284803273
41	NC_013767	TAGT	2	8	10514	10521	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NC_013767	CGGT	2	8	10897	10904	0 %	25 %	50 %	25 %	284803275
43	NC_013767	TATT	2	8	10963	10970	25 %	75 %	0 %	0 %	284803275
44	NC_013767	GAAA	2	8	11293	11300	75 %	0 %	25 %	0 %	284803275
45	NC_013767	ATTT	2	8	11468	11475	25 %	75 %	0 %	0 %	284803275
46	NC_013767	TAAA	2	8	11691	11698	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_013767	ATAA	2	8	12250	12257	75 %	25 %	0 %	0 %	284803277
48	NC_013767	TCAA	2	8	12765	12772	50 %	25 %	0 %	25 %	284803278
49	NC_013767	GATT	2	8	13183	13190	25 %	50 %	25 %	0 %	284803278
50	NC_013767	TCGA	2	8	13796	13803	25 %	25 %	25 %	25 %	284803278
51	NC_013767	AATT	2	8	14196	14203	50 %	50 %	0 %	0 %	284803278
52	NC_013767	GATG	2	8	14344	14351	25 %	25 %	50 %	0 %	284803278
53	NC_013767	ATAA	2	8	14840	14847	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_013767	AATT	2	8	15557	15564	50 %	50 %	0 %	0 %	284803279
55	NC_013767	AATG	2	8	15676	15683	50 %	25 %	25 %	0 %	284803279
56	NC_013767	TTTC	2	8	16488	16495	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
57	NC_013767	AAAT	2	8	16540	16547	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_013767	TGAA	2	8	16586	16593	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
59	NC_013767	GAAG	2	8	16758	16765	50 %	0 %	50 %	0 %	284803281
60	NC_013767	CTGA	2	8	17371	17378	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
61	NC_013767	GTTT	2	8	17492	17499	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
62	NC_013767	GGTA	2	8	17769	17776	25 %	25 %	50 %	0 %	284803282
63	NC_013767	CTTC	2	8	18194	18201	0 %	50 %	0 %	50 %	284803283
64	NC_013767	CCTC	2	8	18564	18571	0 %	25 %	0 %	75 %	284803283
65	NC_013767	TCAT	2	8	18799	18806	25 %	50 %	0 %	25 %	284803283
66	NC_013767	ATGC	2	8	19092	19099	25 %	25 %	25 %	25 %	284803283
67	NC_013767	TGAT	2	8	19108	19115	25 %	50 %	25 %	0 %	284803283
68	NC_013767	TTGG	2	8	19143	19150	0 %	50 %	50 %	0 %	284803283
69	NC_013767	ATTT	2	8	19178	19185	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_013767	ATGT	2	8	19241	19248	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
71	NC_013767	AGGA	2	8	19766	19773	50 %	0 %	50 %	0 %	284803284
72	NC_013767	TAAT	2	8	19901	19908	50 %	50 %	0 %	0 %	284803285
73	NC_013767	TCTA	2	8	19909	19916	25 %	50 %	0 %	25 %	284803285
74	NC_013767	TTTA	2	8	20164	20171	25 %	75 %	0 %	0 %	284803285
75	NC_013767	CTTT	2	8	20604	20611	0 %	75 %	0 %	25 %	284803285
76	NC_013767	TAAA	2	8	20871	20878	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_013767	CAAA	2	8	21058	21065	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
78	NC_013767	CGTG	2	8	21476	21483	0 %	25 %	50 %	25 %	284803286
79	NC_013767	ATAC	2	8	21649	21656	50 %	25 %	0 %	25 %	284803286
80	NC_013767	TACT	2	8	21665	21672	25 %	50 %	0 %	25 %	284803286
81	NC_013767	TTTC	2	8	21995	22002	0 %	75 %	0 %	25 %	284803286
82	NC_013767	CTTT	2	8	22113	22120	0 %	75 %	0 %	25 %	284803286
83	NC_013767	CGTA	2	8	22536	22543	25 %	25 %	25 %	25 %	284803286
84	NC_013767	AAAG	2	8	22796	22803	75 %	0 %	25 %	0 %	284803286
85	NC_013767	TATT	3	12	23152	23163	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_013767	TTTA	2	8	23216	23223	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_013767	TGTT	2	8	23365	23372	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
88	NC_013767	TATT	2	8	23812	23819	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_013767	TAAA	2	8	23859	23866	75 %	25 %	0 %	0 %	284803287
90	NC_013767	ATAC	2	8	25366	25373	50 %	25 %	0 %	25 %	284803289
91	NC_013767	TTAC	2	8	25431	25438	25 %	50 %	0 %	25 %	284803289
92	NC_013767	TCAT	2	8	25463	25470	25 %	50 %	0 %	25 %	284803289
93	NC_013767	AGTG	2	8	25791	25798	25 %	25 %	50 %	0 %	284803289
94	NC_013767	AAAG	2	8	26027	26034	75 %	0 %	25 %	0 %	284803290
95	NC_013767	CAAT	2	8	26220	26227	50 %	25 %	0 %	25 %	284803290
96	NC_013767	TAAA	2	8	26500	26507	75 %	25 %	0 %	0 %	284803290
97	NC_013767	AGAA	2	8	26581	26588	75 %	0 %	25 %	0 %	284803290
98	NC_013767	TGGG	2	8	27326	27333	0 %	25 %	75 %	0 %	284803292
99	NC_013767	AATT	2	8	27384	27391	50 %	50 %	0 %	0 %	284803292
100	NC_013767	AAAT	2	8	27421	27428	75 %	25 %	0 %	0 %	284803292
101	NC_013767	AATT	2	8	27797	27804	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_013767	TTAT	2	8	28038	28045	25 %	75 %	0 %	0 %	284803293
103	NC_013767	ATCA	2	8	28157	28164	50 %	25 %	0 %	25 %	284803293
104	NC_013767	ATTA	2	8	28213	28220	50 %	50 %	0 %	0 %	284803293
105	NC_013767	GATG	2	8	28347	28354	25 %	25 %	50 %	0 %	284803294
106	NC_013767	AAAG	2	8	28357	28364	75 %	0 %	25 %	0 %	284803294
107	NC_013767	AATT	2	8	28625	28632	50 %	50 %	0 %	0 %	284803294
108	NC_013767	TAGA	2	8	28715	28722	50 %	25 %	25 %	0 %	284803294
109	NC_013767	ATTG	2	8	28833	28840	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
110	NC_013767	CAAC	2	8	28866	28873	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
111	NC_013767	GCTA	2	8	28972	28979	25 %	25 %	25 %	25 %	284803295
112	NC_013767	CGAT	2	8	29124	29131	25 %	25 %	25 %	25 %	284803295
113	NC_013767	CAAG	2	8	29827	29834	50 %	0 %	25 %	25 %	284803296
114	NC_013767	AAAC	2	8	29961	29968	75 %	0 %	0 %	25 %	284803296
115	NC_013767	TGCT	2	8	30145	30152	0 %	50 %	25 %	25 %	284803296
116	NC_013767	GAAT	2	8	31171	31178	50 %	25 %	25 %	0 %	284803297
117	NC_013767	CGAT	2	8	31783	31790	25 %	25 %	25 %	25 %	284803297
118	NC_013767	GAAA	2	8	32512	32519	75 %	0 %	25 %	0 %	284803298
119	NC_013767	CTTC	2	8	32841	32848	0 %	50 %	0 %	50 %	284803298
120	NC_013767	CAAA	2	8	34068	34075	75 %	0 %	0 %	25 %	284803298
121	NC_013767	AGAC	2	8	34254	34261	50 %	0 %	25 %	25 %	284803298
122	NC_013767	TTTA	2	8	34342	34349	25 %	75 %	0 %	0 %	284803298
123	NC_013767	TGGA	2	8	34356	34363	25 %	25 %	50 %	0 %	284803298
124	NC_013767	TTTA	2	8	34796	34803	25 %	75 %	0 %	0 %	284803299
125	NC_013767	ACTT	2	8	34914	34921	25 %	50 %	0 %	25 %	284803300
126	NC_013767	ATGA	2	8	34962	34969	50 %	25 %	25 %	0 %	284803300
127	NC_013767	TTGA	2	8	36423	36430	25 %	50 %	25 %	0 %	284803301
128	NC_013767	TTCC	2	8	36456	36463	0 %	50 %	0 %	50 %	284803301
129	NC_013767	AAAG	2	8	36561	36568	75 %	0 %	25 %	0 %	284803302
130	NC_013767	ATTA	2	8	36754	36761	50 %	50 %	0 %	0 %	284803302
131	NC_013767	ATTG	2	8	37110	37117	25 %	50 %	25 %	0 %	284803302
132	NC_013767	TCAT	2	8	37455	37462	25 %	50 %	0 %	25 %	284803303
133	NC_013767	TTTA	2	8	37530	37537	25 %	75 %	0 %	0 %	284803303
134	NC_013767	TGAG	2	8	37882	37889	25 %	25 %	50 %	0 %	284803303
135	NC_013767	CCAA	2	8	37962	37969	50 %	0 %	0 %	50 %	284803303
136	NC_013767	ATCA	2	8	38082	38089	50 %	25 %	0 %	25 %	284803304
137	NC_013767	ACTT	2	8	38138	38145	25 %	50 %	0 %	25 %	284803304
138	NC_013767	AAGC	2	8	38307	38314	50 %	0 %	25 %	25 %	284803304
139	NC_013767	TGGA	2	8	38471	38478	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
140	NC_013767	TTGT	2	8	38482	38489	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
141	NC_013767	AAAT	2	8	38571	38578	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_013767	CCAA	2	8	38619	38626	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
143	NC_013767	TGGA	2	8	38637	38644	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
144	NC_013767	CTGT	2	8	38724	38731	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.