MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Listeria monocytogenes 08-5578 plasmid pLM5578

Total Repeats: 38

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013767	TAGT	2	8	10514	10521	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_013767	TAAA	2	8	11691	11698	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_013767	ATAA	2	8	14840	14847	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_013767	TTTC	2	8	16488	16495	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_013767	AAAT	2	8	16540	16547	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_013767	TGAA	2	8	16586	16593	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
7	NC_013767	CTGA	2	8	17371	17378	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
8	NC_013767	GTTT	2	8	17492	17499	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
9	NC_013767	ATTT	2	8	19178	19185	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_013767	ATGT	2	8	19241	19248	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
11	NC_013767	TAAA	2	8	20871	20878	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_013767	CAAA	2	8	21058	21065	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
13	NC_013767	TATT	3	12	23152	23163	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_013767	TTTA	2	8	23216	23223	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_013767	TGTT	2	8	23365	23372	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
16	NC_013767	TATT	2	8	23812	23819	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_013767	AATT	2	8	27797	27804	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_013767	ATTG	2	8	28833	28840	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_013767	CAAC	2	8	28866	28873	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
20	NC_013767	TGGA	2	8	38471	38478	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_013767	TTGT	2	8	38482	38489	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
22	NC_013767	AAAT	2	8	38571	38578	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_013767	CCAA	2	8	38619	38626	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_013767	TGGA	2	8	38637	38644	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_013767	CTGT	2	8	38724	38731	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
26	NC_013767	ATTA	2	8	38795	38802	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_013767	CTTT	2	8	41120	41127	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
28	NC_013767	GAGC	2	8	52042	52049	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
29	NC_013767	GTAA	2	8	56707	56714	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
30	NC_013767	TTTA	2	8	61238	61245	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_013767	ATTT	2	8	62927	62934	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_013767	CCTT	2	8	62967	62974	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_013767	TAAA	2	8	65125	65132	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_013767	ATTT	2	8	69336	69343	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_013767	GTAA	2	8	69395	69402	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
36	NC_013767	GAAA	2	8	71648	71655	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_013767	ATTT	2	8	76768	76775	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_013767	GATA	2	8	76807	76814	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.