MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Listeria monocytogenes 08-5578 plasmid pLM5578

Total Repeats: 124

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013767	CAT	2	6	5	10	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_013767	TCA	2	6	13	18	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_013767	CAT	2	6	62	67	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_013767	ATT	3	9	116	124	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_013767	CCT	2	6	6680	6685	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6	NC_013767	TCA	2	6	6715	6720	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_013767	ATT	2	6	9477	9482	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_013767	AAT	2	6	10601	10606	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_013767	GTA	2	6	11479	11484	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_013767	CGG	2	6	11612	11617	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_013767	AGC	2	6	11672	11677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_013767	CTA	2	6	11719	11724	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_013767	TAT	2	6	11737	11742	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_013767	AAT	2	6	12035	12040	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_013767	CTT	2	6	12355	12360	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_013767	CAC	2	6	12420	12425	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17	NC_013767	ATT	2	6	12580	12585	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_013767	AAG	2	6	14986	14991	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_013767	GTT	2	6	15047	15052	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_013767	TGA	2	6	16578	16583	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_013767	GAA	2	6	16598	16603	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_013767	TAT	2	6	17362	17367	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_013767	TAA	2	6	17420	17425	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_013767	ATT	2	6	17443	17448	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_013767	TTG	2	6	17533	17538	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_013767	GAG	2	6	17539	17544	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_013767	CTT	2	6	19196	19201	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_013767	ATT	2	6	19479	19484	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_013767	TCC	2	6	20752	20757	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
30	NC_013767	TAC	2	6	21089	21094	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_013767	CTT	2	6	21148	21153	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_013767	TGT	2	6	21281	21286	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_013767	AAT	2	6	23029	23034	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_013767	ATT	2	6	23150	23155	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_013767	ACC	2	6	23499	23504	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
36	NC_013767	CAG	2	6	23545	23550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_013767	AGA	2	6	23635	23640	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_013767	GTT	2	6	23694	23699	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_013767	GAT	2	6	23712	23717	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_013767	AGG	2	6	23742	23747	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_013767	TTA	2	6	24448	24453	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_013767	TGA	2	6	24475	24480	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_013767	TTC	2	6	24564	24569	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_013767	ACC	2	6	25858	25863	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
45	NC_013767	GAA	2	6	25902	25907	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_013767	ATG	2	6	27465	27470	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_013767	AGT	2	6	27473	27478	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_013767	CTT	2	6	27519	27524	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_013767	ATT	2	6	27566	27571	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_013767	ATA	2	6	27654	27659	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_013767	GTG	2	6	27752	27757	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_013767	AGG	2	6	28820	28825	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_013767	TCG	2	6	28853	28858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_013767	AGG	2	6	29598	29603	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_013767	AAT	2	6	38456	38461	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_013767	AGG	2	6	38706	38711	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_013767	AGT	2	6	38764	38769	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_013767	AGA	2	6	39102	39107	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_013767	TAA	2	6	40567	40572	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_013767	AGG	2	6	40785	40790	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_013767	GAG	2	6	41880	41885	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_013767	GAA	2	6	42466	42471	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_013767	AAG	2	6	44925	44930	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_013767	GGA	2	6	51296	51301	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_013767	TTA	2	6	55104	55109	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_013767	ACC	2	6	56634	56639	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
67	NC_013767	ACC	2	6	56668	56673	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
68	NC_013767	GGT	2	6	56695	56700	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_013767	ACC	2	6	56736	56741	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
70	NC_013767	ATT	2	6	56887	56892	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_013767	TTC	2	6	56953	56958	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_013767	AGG	2	6	59431	59436	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_013767	GAG	2	6	60228	60233	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
74	NC_013767	AAT	2	6	60245	60250	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_013767	TAT	2	6	61344	61349	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_013767	GAA	2	6	61807	61812	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_013767	CAG	2	6	61917	61922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_013767	TGA	2	6	61941	61946	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_013767	GCT	2	6	61950	61955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_013767	ACA	2	6	62070	62075	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_013767	ATC	2	6	62317	62322	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_013767	TAC	2	6	62357	62362	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_013767	ATA	2	6	62399	62404	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_013767	ACA	2	6	62418	62423	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_013767	AAT	2	6	62476	62481	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_013767	AAG	2	6	62858	62863	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_013767	GAG	2	6	62912	62917	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
88	NC_013767	AGA	2	6	62979	62984	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_013767	GAA	2	6	62992	62997	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_013767	TGC	2	6	63086	63091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_013767	GAA	2	6	63127	63132	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_013767	TGA	2	6	63183	63188	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_013767	GAA	2	6	63244	63249	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_013767	AGC	2	6	63255	63260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_013767	CTC	2	6	64558	64563	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
96	NC_013767	TCC	2	6	64988	64993	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
97	NC_013767	TAT	2	6	65007	65012	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_013767	AAG	2	6	65103	65108	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_013767	TCT	2	6	66638	66643	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_013767	TGG	2	6	67959	67964	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
101	NC_013767	GAT	2	6	67982	67987	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_013767	AAT	2	6	68381	68386	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_013767	AAT	2	6	68394	68399	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_013767	AAT	2	6	68407	68412	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_013767	ATT	2	6	68439	68444	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_013767	TAT	2	6	69430	69435	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_013767	GAC	2	6	69467	69472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_013767	ATT	2	6	69570	69575	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_013767	GCA	2	6	69580	69585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_013767	AGG	2	6	69673	69678	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
111	NC_013767	ATG	2	6	69729	69734	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_013767	AAG	2	6	69736	69741	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_013767	GTA	2	6	72371	72376	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_013767	AAT	2	6	72389	72394	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_013767	TAA	2	6	72711	72716	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_013767	ATA	2	6	72758	72763	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_013767	ATG	2	6	72797	72802	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_013767	TTG	2	6	72830	72835	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_013767	TAA	2	6	72867	72872	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_013767	CAA	2	6	75931	75936	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_013767	ATT	2	6	75964	75969	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_013767	TAA	2	6	76176	76181	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_013767	TTA	2	6	76985	76990	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_013767	AGG	2	6	77013	77018	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.