MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Listeria monocytogenes 08-5578 plasmid pLM5578

Total Repeats: 977

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013767	ATG	2	6	134	139	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284803267
2	NC_013767	GGA	2	6	221	226	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284803267
3	NC_013767	ATG	2	6	278	283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284803267
4	NC_013767	TTG	2	6	288	293	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	284803267
5	NC_013767	TTA	2	6	416	421	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284803267
6	NC_013767	GAA	2	6	469	474	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284803267
7	NC_013767	GAA	2	6	530	535	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284803267
8	NC_013767	ATG	3	9	684	692	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284803267
9	NC_013767	CTC	2	6	821	826	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284803267
10	NC_013767	AAC	2	6	908	913	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	284803267
11	NC_013767	CAT	2	6	1081	1086	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284803267
12	NC_013767	GAA	2	6	1166	1171	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284803267
13	NC_013767	ATC	2	6	1209	1214	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284803267
14	NC_013767	TTG	2	6	1230	1235	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	284803267
15	NC_013767	CTC	2	6	1269	1274	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284803267
16	NC_013767	AAG	2	6	1275	1280	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284803267
17	NC_013767	TAA	2	6	1282	1287	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	284803267
18	NC_013767	ATA	2	6	1320	1325	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	284803267
19	NC_013767	TAA	2	6	1378	1383	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	284803267
20	NC_013767	CAA	2	6	1406	1411	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	284803267
21	NC_013767	TAT	2	6	1456	1461	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284803267
22	NC_013767	TAT	2	6	1512	1517	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284803267
23	NC_013767	ATA	2	6	1551	1556	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	284803267
24	NC_013767	AAG	2	6	1557	1562	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284803267
25	NC_013767	GAA	2	6	1580	1585	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284803267
26	NC_013767	TAT	2	6	1636	1641	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284803267
27	NC_013767	ATG	2	6	1673	1678	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284803267
28	NC_013767	ATG	2	6	1695	1700	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284803267
29	NC_013767	TTA	2	6	1710	1715	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284803267
30	NC_013767	TGG	2	6	1862	1867	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284803267
31	NC_013767	CTG	2	6	1941	1946	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284803267
32	NC_013767	ATC	2	6	1976	1981	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284803267
33	NC_013767	ATG	2	6	2122	2127	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284803268
34	NC_013767	TTC	2	6	2202	2207	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284803268
35	NC_013767	CAA	2	6	2412	2417	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	284803268
36	NC_013767	ACA	2	6	2431	2436	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	284803268
37	NC_013767	GCT	2	6	2542	2547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284803268
38	NC_013767	ATC	2	6	2558	2563	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284803268
39	NC_013767	TTA	2	6	2614	2619	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284803268
40	NC_013767	AAT	2	6	2641	2646	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	284803268
41	NC_013767	TAA	2	6	2681	2686	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	284803268
42	NC_013767	AAC	2	6	2796	2801	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	284803268
43	NC_013767	AAG	2	6	2804	2809	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284803268
44	NC_013767	TAA	2	6	2871	2876	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	284803268
45	NC_013767	GGC	2	6	2905	2910	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284803268
46	NC_013767	AGA	2	6	2997	3002	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284803268
47	NC_013767	TTG	2	6	3014	3019	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	284803268
48	NC_013767	ATG	2	6	3023	3028	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284803268
49	NC_013767	ATT	2	6	3046	3051	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284803268
50	NC_013767	ACT	2	6	3079	3084	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284803268
51	NC_013767	GAC	2	6	3191	3196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284803268
52	NC_013767	CTT	2	6	3355	3360	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284803269
53	NC_013767	TTA	2	6	3394	3399	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284803269
54	NC_013767	CGA	2	6	3432	3437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284803269
55	NC_013767	ATC	2	6	3545	3550	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284803269
56	NC_013767	TTC	2	6	3707	3712	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284803269
57	NC_013767	TCA	2	6	3720	3725	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284803269
58	NC_013767	TGA	2	6	3751	3756	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284803269
59	NC_013767	TAA	2	6	3761	3766	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	284803269
60	NC_013767	AAT	2	6	3798	3803	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	284803269
61	NC_013767	TTC	2	6	3905	3910	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284803269
62	NC_013767	AAC	2	6	3980	3985	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	284803269
63	NC_013767	ATG	2	6	3992	3997	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284803269
64	NC_013767	CTT	2	6	4204	4209	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284803269
65	NC_013767	TAA	2	6	4307	4312	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	284803269
66	NC_013767	AAT	2	6	4540	4545	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	284803269
67	NC_013767	ATC	2	6	4589	4594	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284803269
68	NC_013767	ATC	2	6	4649	4654	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284803269
69	NC_013767	ATT	2	6	4706	4711	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284803269
70	NC_013767	CTT	2	6	4762	4767	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284803269
71	NC_013767	TCT	2	6	4940	4945	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284803269
72	NC_013767	TCT	2	6	5016	5021	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284803269
73	NC_013767	TGA	3	9	5253	5261	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284803269
74	NC_013767	GAA	2	6	5356	5361	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284803269
75	NC_013767	AAC	2	6	5523	5528	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	284803269
76	NC_013767	AGA	2	6	5568	5573	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284803269
77	NC_013767	TCT	2	6	5622	5627	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284803269
78	NC_013767	AAT	2	6	5648	5653	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	284803269
79	NC_013767	TCA	2	6	5703	5708	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284803269
80	NC_013767	TAA	2	6	5725	5730	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	284803269
81	NC_013767	TGC	2	6	6086	6091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284803269
82	NC_013767	GTT	2	6	6153	6158	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	284803270
83	NC_013767	TGC	2	6	6284	6289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284803270
84	NC_013767	TGA	2	6	6985	6990	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284803271
85	NC_013767	CCA	2	6	7171	7176	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284803271
86	NC_013767	AAG	2	6	7190	7195	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284803271
87	NC_013767	TAT	2	6	7235	7240	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284803271
88	NC_013767	CAA	2	6	7465	7470	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	284803272
89	NC_013767	ATT	2	6	7581	7586	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284803272
90	NC_013767	ATT	2	6	7596	7601	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284803272
91	NC_013767	GGA	2	6	7638	7643	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284803272
92	NC_013767	AGG	2	6	7686	7691	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284803272
93	NC_013767	TGA	2	6	7754	7759	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284803272
94	NC_013767	TAT	2	6	7767	7772	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284803272
95	NC_013767	GCT	2	6	7777	7782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284803272
96	NC_013767	AAG	2	6	7907	7912	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284803272
97	NC_013767	GAT	2	6	8092	8097	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284803272
98	NC_013767	GAA	2	6	8122	8127	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284803272
99	NC_013767	AGA	2	6	8160	8165	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284803272
100	NC_013767	ATT	2	6	8182	8187	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284803272
101	NC_013767	GAG	2	6	8197	8202	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284803272
102	NC_013767	TTG	2	6	8234	8239	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	284803272
103	NC_013767	CGC	2	6	8280	8285	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284803272
104	NC_013767	TGG	2	6	8316	8321	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284803272
105	NC_013767	GTT	2	6	8386	8391	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	284803272
106	NC_013767	GGT	2	6	8455	8460	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284803272
107	NC_013767	AGA	2	6	8469	8474	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284803272
108	NC_013767	TGG	2	6	8478	8483	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284803272
109	NC_013767	GGT	2	6	8535	8540	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284803272
110	NC_013767	ATA	2	6	8582	8587	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	284803272
111	NC_013767	ATC	2	6	8596	8601	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284803272
112	NC_013767	GCA	2	6	8605	8610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284803272
113	NC_013767	ATT	2	6	8647	8652	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284803272
114	NC_013767	TAT	2	6	8755	8760	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284803272
115	NC_013767	TTA	2	6	8936	8941	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284803272
116	NC_013767	TAT	2	6	8973	8978	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284803272
117	NC_013767	ATG	2	6	9134	9139	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284803272
118	NC_013767	AGC	2	6	9150	9155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284803272
119	NC_013767	GAC	2	6	9232	9237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284803272
120	NC_013767	ATT	2	6	9286	9291	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284803272
121	NC_013767	TCA	2	6	9317	9322	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284803272
122	NC_013767	GGT	2	6	9353	9358	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284803272
123	NC_013767	GGT	2	6	9686	9691	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284803273
124	NC_013767	GAA	2	6	9748	9753	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284803273
125	NC_013767	AGA	2	6	9760	9765	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284803273
126	NC_013767	ATG	2	6	9890	9895	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284803273
127	NC_013767	AAT	2	6	9915	9920	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	284803273
128	NC_013767	ATG	2	6	9939	9944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284803274
129	NC_013767	TAG	2	6	9964	9969	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284803274
130	NC_013767	TAT	2	6	9982	9987	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284803274
131	NC_013767	GAA	4	12	10008	10019	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284803274
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251	NC_013767	CAA	2	6	21720	21725	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	284803286
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